84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2952 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  362  1e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2508  hypothetical protein  84.74 
 
 		 191 aa  299  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2796  hypothetical protein  71.57 
 
 		 196 aa  276  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.514284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2804  hypothetical protein  65.79 
 
 		 190 aa  254  5e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.104063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4019  hypothetical protein  64.89 
 
 		 195 aa  222  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2298  hypothetical protein  62.3 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3207  hypothetical protein  47.51 
 
 		 208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.17097 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0131  hypothetical protein  35.37 
 
 		 186 aa  105  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.391144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1099  hypothetical protein  36.41 
 
 		 185 aa  97.8  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2690  hypothetical protein  36.93 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0149  hypothetical protein  34.3 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1336  hypothetical protein  30.85 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.416394  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0606  hypothetical protein  33.33 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.755493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6196  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4326  hypothetical protein  34.66 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06381  hypothetical protein  35.84 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0831835 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71390  hypothetical protein  33.15 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1025  hypothetical protein  27.7 
 
 		 185 aa  67  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.531684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5837  hypothetical protein  30.64 
 
 		 181 aa  65.5  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02198  hypothetical protein  26.52 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0350  hypothetical protein  28.57 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0787888  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2435  hypothetical protein  26.26 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1322  hypothetical protein  28.33 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1195  hypothetical protein  29.84 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2522  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0904508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0779  hypothetical protein  27.87 
 
 		 182 aa  62.4  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.289109  normal  0.0535205 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3886  hypothetical protein  32.14 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.652083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1436  hypothetical protein  27.68 
 
 		 210 aa  62  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.341725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6139  hypothetical protein  31.43 
 
 		 174 aa  62  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0833  hypothetical protein  29.33 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2828  hypothetical protein  31.46 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0493816 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0999  hypothetical protein  28.8 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1061  hypothetical protein  28.8 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.521066  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0881  hypothetical protein  30.25 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000429044  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2789  hypothetical protein  24.19 
 
 		 187 aa  59.3  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0566  hypothetical protein  28.41 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.484223 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2658  hypothetical protein  24.06 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3372  hypothetical protein  26.6 
 
 		 185 aa  57.4  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1522  hypothetical protein  25.79 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0892  hypothetical protein  28.77 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0862368  normal  0.795998 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1798  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1475  hypothetical protein  25.26 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2206  hypothetical protein  32.06 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.224771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0502  acid-resistance membrane protein  26.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1092  acid-resistance membrane protein  26.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0564  acid-resistance membrane protein  26.88 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0489975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2620  hypothetical protein  25.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000246316  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3337  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.783352 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03312  hypothetical protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4870  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.756215 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0203  putative HdeD protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3909  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03359  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.493233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0206  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0145817 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3713  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00199236  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3997  acid-resistance membrane protein  28.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11640  hypothetical protein  31.41 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.233532 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4145  membrane-bound protease  33.86 
 
 		 452 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.333375 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3813  acid-resistance membrane protein  29.24 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0521  hypothetical protein  27.37 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0311  hypothetical protein  37.93 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.773139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1597  hypothetical protein  27.27 
 
 		 167 aa  49.3  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.585273  hitchhiker  0.00302287 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0797  hypothetical protein  28.67 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7679  hypothetical protein  26.04 
 
 		 185 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0415  hypothetical protein  25.58 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.301102  normal  0.0386467 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0241  protein of unknown function DUF308 membrane  28.1 
 
 		 176 aa  47  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.770271  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00883  hypothetical protein  29.89 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0347503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4460  hypothetical protein  27.4 
 
 		 457 aa  44.3  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4031  protein of unknown function DUF308 membrane  25.79 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2780  hypothetical protein  27.59 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2723  hypothetical protein  27.59 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2302  hypothetical protein  26.92 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1519  hypothetical protein  26.72 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4468  hypothetical protein  35.62 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.075562  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3322  hypothetical protein  25.27 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4892  hypothetical protein  28.46 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5490  hypothetical protein  27.84 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04730  hypothetical protein  30.47 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.184626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2504  hypothetical protein  33.04 
 
 		 244 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0379278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32866  predicted protein  25.99 
 
 		 224 aa  42  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.861678  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4374  hypothetical protein  28.81 
 
 		 467 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0121947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1205  hypothetical protein  32.84 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.39038  normal  0.418544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2295  hypothetical protein  32.31 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.357303  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0410  hypothetical protein  29.51 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.144489  normal  0.754821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>