195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3322 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3322  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  792    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1386  major facilitator transporter  67.6 
 
 		 394 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  50.65 
 
 		 398 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03550  putative MFS transporter  58.12 
 
 		 404 aa  333  4e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0168326  hitchhiker  0.00000000000715422 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 401 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 401 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  48.48 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  48.48 
 
 		 401 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  50.13 
 
 		 401 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1497  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 391 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.449683  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1589  major facilitator superfamily MFS_1  43.22 
 
 		 389 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000189981  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2873  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 389 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00211826  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32330  putative cyanate permease  42.6 
 
 		 408 aa  249  7e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0106  putative cyanate transporter  40.31 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2483  major facilitator superfamily MFS_1  49.73 
 
 		 393 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.566697  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2739  MFS family transporter  42.05 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  40.55 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3444  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.466635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4522  major facilitator transporter  46.18 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1281  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 409 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.081326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 409 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2392  major facilitator family transporter  44.27 
 
 		 390 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1199  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1679  major facilitator transporter  42.04 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3265  cyanate transporter  38.86 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3284  putative cyanate transporter  38.86 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.464523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4832  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0209753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0366  putative cyanate transporter  39.01 
 
 		 384 aa  229  5e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0863543  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00295  predicted cyanate transporter  39.27 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00299  hypothetical protein  39.27 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0372  putative cyanate transporter  38.85 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.552261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0414  putative cyanate transporter  38.7 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0406  putative cyanate transporter  38.85 
 
 		 384 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.480535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1597  major facilitator transporter  41.32 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327647 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2152  major facilitator transporter  38.54 
 
 		 398 aa  225  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222111 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2387  major facilitator superfamily MFS_1  46.52 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1652  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 394 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1579  major facilitator transporter  42.26 
 
 		 427 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3751  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 398 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2012  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.579167 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5382  major facilitator transporter  36.48 
 
 		 408 aa  208  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.958191  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5672  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.54859 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4252  major facilitator transporter  37.31 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.227689 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1974  major facilitator family transporter  43.68 
 
 		 394 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.698434  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1155  major facilitator family transporter  44.82 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.469422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1596  major facilitator family transporter  44.82 
 
 		 394 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00474308  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1957  major facilitator family transporter  44.82 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0483109  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2202  major facilitator transporter  37.66 
 
 		 420 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.61634  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2119  major facilitator family transporter  44.82 
 
 		 401 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.449252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2924  major facilitator transporter  39.73 
 
 		 420 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0280  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4258  MFS family major facilitator transporter  30.88 
 
 		 394 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134352 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1341  major facilitator superfamily MFS_1  35.1 
 
 		 426 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.141692  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0256  major facilitator family transporter  43.6 
 
 		 332 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0891  twin-arginine translocation pathway signal  32.18 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.159875 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1035  twin-arginine translocation pathway signal  32.18 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1076  cyanate transport system protein  34.38 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1289  major facilitator transporter  33.95 
 
 		 402 aa  159  8e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000254153  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1260  cyanate MFS transporter  33.99 
 
 		 409 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.305339  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0746  major facilitator superfamily MFS_1  34.73 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.4441  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0977  cyanate transporter  32.08 
 
 		 426 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.811661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2258  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 404 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4246  cyanate transporter  31.79 
 
 		 426 aa  153  7e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1932  major facilitator transporter  36.31 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.618163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1009  cyanate transporter  32.08 
 
 		 426 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0340  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0350  major facilitator transporter  30.42 
 
 		 403 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.586381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0978  cyanate transport system protein  32.66 
 
 		 434 aa  150  5e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43490  putative cyanate MFS transporter  34.78 
 
 		 424 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0329  major facilitator transporter  30.16 
 
 		 403 aa  149  9e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0970  cyanate transporter  32.08 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1456  major facilitator transporter  32.68 
 
 		 401 aa  144  4e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4352  major facilitator superfamily MFS_1  34.69 
 
 		 430 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.174626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0951  major facilitator superfamily transporter  31.35 
 
 		 406 aa  143  7e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3476  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.126781 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4548  major facilitator superfamily MFS_1  31.74 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4620  major facilitator superfamily MFS_1  34.29 
 
 		 430 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.81527  normal  0.142468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3218  major facilitator transporter  32.09 
 
 		 407 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0868  major facilitator superfamily MFS_1  31.11 
 
 		 397 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3920  cynate permease protein  31.58 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.791953  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0017  major facilitator transporter  29.22 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3647  MFS family transporter  34.38 
 
 		 424 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01782  putative CYNX-related transport transmembrane protein  31.55 
 
 		 426 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1375  putative integral membrane transporter  32.03 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.537018  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0370  major facilitator transporter  31.3 
 
 		 404 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7247  putative transmembrane major facilitator superfamily transporter  29.43 
 
 		 409 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0299667  normal  0.140815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0360  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 413 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7924  MFS family transporter  28.3 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2702  major facilitator transporter  31.36 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11554  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1370  inner membrane transport protein YeaN  33.24 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.533792 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1899  inner membrane transport protein YeaN  33.24 
 
 		 394 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.222838  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0562  putative cyanate transport system protein CynX  32.11 
 
 		 391 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2079  inner membrane transport protein YeaN  33.24 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000109416 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0634  major facilitator transporter  34.42 
 
 		 405 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.271486 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1574  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.307108  normal  0.381879 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1387  inner membrane transport protein YeaN  33.24 
 
 		 394 aa  128  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000728504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2380  major facilitator transporter  33.43 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>