More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2961 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3220  ABC transporter, ATP-binding protein  71.37 
 
 		 539 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94364  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3091  nickel ABC transporter, ATP-binding protein, putative  91.16 
 
 		 548 aa  950    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00987515  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2961  ABC transporter  100 
 
 		 547 aa  1079    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18700  ABC transporter, ATP binding component  75.37 
 
 		 542 aa  750    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.106187  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3752  ABC transporter related  58.19 
 
 		 597 aa  566  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3513  ABC transporter related protein  53.06 
 
 		 541 aa  513  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.709638  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2416  ABC transporter related  59.8 
 
 		 505 aa  505  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.48904  normal  0.517623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0298  ABC transporter related  52.28 
 
 		 565 aa  505  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4819  ABC transporter related  50.69 
 
 		 619 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  48.38 
 
 		 571 aa  503  1e-141  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  47.92 
 
 		 573 aa  501  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4177  ABC transporter related  50.94 
 
 		 561 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7172  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  50.28 
 
 		 547 aa  492  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.892646  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0942  ABC transporter related  51.29 
 
 		 551 aa  494  9.999999999999999e-139  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.337051  normal  0.0501434 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0030  ABC transporter related  50.93 
 
 		 558 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4459  ABC transporter related protein  50.28 
 
 		 565 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1962  ABC transporter related protein  50.44 
 
 		 573 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0028  ABC transporter related  51.33 
 
 		 546 aa  486  1e-136  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0987785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1054  ABC transporter related  52.13 
 
 		 563 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.763117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11080  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.56 
 
 		 643 aa  487  1e-136  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34300  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  50 
 
 		 661 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.183589 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1128  ABC transporter related  47.42 
 
 		 588 aa  479  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.716333  normal  0.0608285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3912  ABC transporter related protein  47.44 
 
 		 594 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3154  ABC transporter-related protein  50.37 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4851  putative ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 546 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.508729  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0472  ABC transporter related  52.5 
 
 		 545 aa  459  9.999999999999999e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.197295  normal  0.707988 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13693  dipeptide-transport ATP-binding protein ABC transporter dppD  50.37 
 
 		 548 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.373881  normal  0.206528 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2746  ABC transporter related  49.01 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.212206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  46.49 
 
 		 619 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2574  ABC transporter related  47.05 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2194  ABC transporter related  44.95 
 
 		 600 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.966605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  45.19 
 
 		 613 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2662  ABC transporter related  50.37 
 
 		 538 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3130  ABC transporter related  46.9 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.713797  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05580  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  48.98 
 
 		 583 aa  437  1e-121  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.158462  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31110  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain protein  44.19 
 
 		 586 aa  437  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  44.86 
 
 		 606 aa  437  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  47.39 
 
 		 584 aa  432  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1832  ABC transporter related  45.74 
 
 		 606 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2314  ABC transporter related  49.63 
 
 		 536 aa  432  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.399989  normal  0.717185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.93 
 
 		 593 aa  431  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  46.83 
 
 		 553 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  43.18 
 
 		 543 aa  430  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0609  ABC transporter related  45.57 
 
 		 609 aa  429  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0436309  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.57 
 
 		 617 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  43.06 
 
 		 611 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  43.76 
 
 		 612 aa  427  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5116  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.45 
 
 		 555 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  42.91 
 
 		 615 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 		 541 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0788  ABC transporter related  47.05 
 
 		 576 aa  424  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.588139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4449  ABC transporter related  45.66 
 
 		 545 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.875798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  48.13 
 
 		 531 aa  425  1e-117  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2549  ABC transporter related  44.51 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.165477 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7191  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.28 
 
 		 564 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.453207  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  43.8 
 
 		 562 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 		 550 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  44.92 
 
 		 539 aa  423  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0701  peptide ABC transporter ATPase  45.27 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  43.66 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.78 
 
 		 626 aa  420  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  46.3 
 
 		 547 aa  420  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  42.96 
 
 		 623 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  41.98 
 
 		 609 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4080  ABC transporter related  46.38 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2356  ABC transporter related  45.45 
 
 		 543 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.10022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0245  ABC transporter related  46.3 
 
 		 542 aa  421  1e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0658  ABC peptide transporter  44.98 
 
 		 533 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 623 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7201  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (peptide)  45.08 
 
 		 543 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0277171  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.76 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3363  ABC transporter related  45.45 
 
 		 542 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0529  ABC transporter related  44.69 
 
 		 533 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.328091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.48 
 
 		 633 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 		 633 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4135  ABC transporter related  45.29 
 
 		 545 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  41.81 
 
 		 623 aa  415  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 		 629 aa  418  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4108  ABC transporter related  42.55 
 
 		 623 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.486076  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  43.19 
 
 		 568 aa  415  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0532  putative peptide ABC transporter, ATP-binding protein  44.3 
 
 		 530 aa  412  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2386  peptide ABC transporter  45.7 
 
 		 536 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  40.91 
 
 		 578 aa  412  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0142  ABC transporter  45.13 
 
 		 527 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5258  putative ABC transporter ATP-binding protein  44.36 
 
 		 548 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.170302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3744  ABC transporter-like  45.32 
 
 		 537 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.398747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3860  ABC transporter related  45.15 
 
 		 531 aa  415  1e-114  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3487  ABC transporter related  46.49 
 
 		 552 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15540  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  45.32 
 
 		 616 aa  413  1e-114  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  44.34 
 
 		 613 aa  412  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.01 
 
 		 624 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3482  ABC transporter related  44.91 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  43.45 
 
 		 640 aa  414  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1804  ABC transporter related  44.34 
 
 		 537 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.147708 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1541  ABC transporter related  44.03 
 
 		 541 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  42.43 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 627 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>