More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1467 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1467  heavy metal efflux P-type ATPase  100 
 
 
950 aa  1961    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.897361  hitchhiker  0.000055818 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1645  heavy metal translocating P-type ATPase  90.21 
 
 
964 aa  1751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.029405  hitchhiker  0.00127131 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1619  heavy metal translocating P-type ATPase  65.74 
 
 
965 aa  1248    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.265996  unclonable  0.00000000106661 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  35.95 
 
 
811 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  42.91 
 
 
812 aa  373  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  39.54 
 
 
811 aa  340  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  40.64 
 
 
834 aa  337  7.999999999999999e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  39.56 
 
 
815 aa  335  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1813  heavy metal translocating P-type ATPase  28.71 
 
 
809 aa  333  9e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  40.85 
 
 
824 aa  331  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  40.91 
 
 
882 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
824 aa  328  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  38.87 
 
 
846 aa  326  1e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  39.73 
 
 
816 aa  323  9.999999999999999e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19950  Copper-translocating P-type ATPase  40.47 
 
 
800 aa  323  9.999999999999999e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.677512  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  38.92 
 
 
795 aa  319  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
803 aa  318  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  37.6 
 
 
826 aa  317  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  37.87 
 
 
799 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  37.87 
 
 
799 aa  317  7e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  37.67 
 
 
799 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  39.92 
 
 
838 aa  316  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
803 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1996  copper-translocating P-type ATPase  40.19 
 
 
823 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.369514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  39.84 
 
 
824 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
803 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  36.06 
 
 
799 aa  314  5.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  37.23 
 
 
794 aa  313  7.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  37.1 
 
 
819 aa  312  2e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3579  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 
814 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
802 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.34 
 
 
794 aa  310  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 
807 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
799 aa  309  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  39.53 
 
 
802 aa  307  6e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  35.79 
 
 
790 aa  307  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  37.43 
 
 
806 aa  307  8.000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
787 aa  306  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2078  heavy metal translocating P-type ATPase  28.06 
 
 
817 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.972968 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  36.8 
 
 
791 aa  305  4.0000000000000003e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  35.4 
 
 
813 aa  301  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  37.48 
 
 
799 aa  300  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
839 aa  300  1e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3223  heavy metal translocating P-type ATPase  28.15 
 
 
814 aa  298  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
799 aa  297  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  36.01 
 
 
797 aa  295  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  35.46 
 
 
787 aa  295  4e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  39.17 
 
 
847 aa  292  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  40.43 
 
 
849 aa  290  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  35.76 
 
 
820 aa  290  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  38.72 
 
 
851 aa  289  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1102  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
847 aa  289  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165186  normal  0.905045 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 
796 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1689  copper-translocating P-type ATPase  33.7 
 
 
798 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  36.96 
 
 
765 aa  285  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  28.86 
 
 
836 aa  284  6.000000000000001e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  43.65 
 
 
791 aa  280  8e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
861 aa  280  9e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  37.01 
 
 
792 aa  280  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2781  heavy metal translocating P-type ATPase  35.44 
 
 
805 aa  278  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000811697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0774  copper-translocating P-type ATPase  27.35 
 
 
797 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  42.04 
 
 
792 aa  274  6e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  27.57 
 
 
838 aa  273  9e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0285  heavy metal translocating P-type ATPase  34.62 
 
 
793 aa  273  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
835 aa  273  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0087  heavy metal translocating P-type ATPase  29.37 
 
 
792 aa  273  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.908745  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3888  heavy metal translocating P-type ATPase  35.84 
 
 
1087 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.840701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10987  metal cation transporter P-type ATPase ctpV  33.99 
 
 
792 aa  271  4e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0884747  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  32.66 
 
 
805 aa  270  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  34.05 
 
 
818 aa  270  1e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1113  heavy metal translocating P-type ATPase  34.02 
 
 
794 aa  268  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.570312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0987  heavy metal translocating P-type ATPase  33.53 
 
 
839 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000433891  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1879  heavy metal translocating P-type ATPase  26.07 
 
 
836 aa  268  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.753132  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 
818 aa  267  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1801  copper-translocating P-type ATPase  34.33 
 
 
797 aa  265  3e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2080  heavy metal translocating P-type ATPase  34.94 
 
 
814 aa  264  6e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0351429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3746  heavy metal translocating P-type ATPase  35.43 
 
 
1071 aa  263  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.698803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13170  putative metal transporting P-type ATPase  27.37 
 
 
792 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5929  copper-translocating P-type ATPase  34.58 
 
 
757 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.711138 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2413  heavy metal translocating P-type ATPase  34.12 
 
 
840 aa  261  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.66549  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  36.22 
 
 
810 aa  261  3e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  33.6 
 
 
803 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2982  heavy metal translocating P-type ATPase  32.54 
 
 
821 aa  260  8e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000528062  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1653  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
817 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00461929  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1187  putative metal transporting P-type ATPase  27.18 
 
 
792 aa  259  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  34.88 
 
 
857 aa  259  2e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  33.78 
 
 
832 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5293  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 
817 aa  259  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  35.5 
 
 
811 aa  258  4e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  31.85 
 
 
889 aa  258  4e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2266  heavy metal translocating P-type ATPase  27.75 
 
 
790 aa  258  5e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123408  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  32.06 
 
 
805 aa  258  5e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  33.07 
 
 
894 aa  257  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  32.06 
 
 
805 aa  257  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  32.06 
 
 
805 aa  257  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  32.06 
 
 
805 aa  257  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  32.26 
 
 
806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0287  heavy metal translocating P-type ATPase  32.3 
 
 
827 aa  256  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  31.79 
 
 
805 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  33.77 
 
 
824 aa  256  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>