61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0445 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0445  prophage LambdaSo, tail assembly protein K  100 
 
 		 249 aa  518  1e-146  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2777  NLP/P60  42.57 
 
 		 254 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0126559 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0783  hypothetical protein  38.67 
 
 		 256 aa  198  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08270  hypothetical protein  38.67 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000264439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2421  NlpC/P60 family protein  37.7 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3930  NLP/P60 protein  37.6 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2948  prophage LambdaSo, tail assembly protein K, putative  41.46 
 
 		 237 aa  191  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2578  NLP/P60 protein  38.96 
 
 		 242 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.536782 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1695  phage HK022 GP19-like protein  38.21 
 
 		 236 aa  178  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.155814  normal  0.173867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3384  NLP/P60 protein  38.27 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0474396  hitchhiker  0.000000000102411 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3880  NLP/P60 protein  34.38 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.877885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2383  NlpC/P60 family protein  34.57 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.886238  normal  0.903838 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3098  NLP/P60 protein  33.74 
 
 		 236 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19861  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2222  NLP/P60 protein  33.74 
 
 		 236 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.878909 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1692  hypothetical protein  32.81 
 
 		 250 aa  142  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.982855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1060  hypothetical protein  32.95 
 
 		 250 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.07451  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1635  hypothetical protein  33.47 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.537061  n/a   
 
 
-
 
NC_009726  CBUD_A0035  tail assembly protein  31.43 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.360646  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1091  tail assembly protein  36 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.352892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2170  tail assembly protein  35.2 
 
 		 247 aa  126  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.206428 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2876  tail assembly protein  37.04 
 
 		 245 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00156382 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2107  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 247 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1636  tail assembly protein  33.86 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.359398 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0911  tail assembly protein  33.86 
 
 		 247 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1556  tail assembly protein  36.21 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.269135  hitchhiker  0.000129562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1201  tail assembly protein  32.67 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000820398 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1470  tail assembly protein  33.2 
 
 		 247 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1156  tail assembly protein  34.55 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1421  tail assembly protein  34.55 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  normal  0.0356562 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3123  tail assembly protein  36.67 
 
 		 211 aa  112  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0880302 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1875  tail assembly protein  36.19 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.14941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3191  tail assembly protein  36.19 
 
 		 211 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000381124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1198  tail assembly protein  36.19 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2765  tail assembly protein  36.19 
 
 		 211 aa  109  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.693268 
 
 
-
 
NC_010115  COXBURSA331_0051  NlpC/P60 domain-containing protein  31.98 
 
 		 169 aa  103  3e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.990014  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1084  tail assembly protein  34.15 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.544737 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0092  NlpC/P60 family protein  27.89 
 
 		 252 aa  99.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00748  hypothetical protein  33.99 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10052  tail component  33.99 
 
 		 199 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7022  NLP/P60 protein  29.43 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6224  NLP/P60 protein  30.69 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3880  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3529  NLP/P60 protein  31.68 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5752  NLP/P60 protein  31.19 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4059  NLP/P60 protein  30.69 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5049  NLP/P60 protein  30.69 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2943  hypothetical protein  36.46 
 
 		 85 aa  57.4  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1086  conserved hypothetical protein  36.49 
 
 		 113 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.845267  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1678  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.18 
 
 		 148 aa  53.1  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.543929  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3497  NLP/P60 protein  29.3 
 
 		 263 aa  49.3  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2114  hypothetical protein  39.73 
 
 		 110 aa  48.9  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.503004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3049  PAD1/JAB1 superfamily metal-dependent protease  34.34 
 
 		 156 aa  48.5  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296838  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1753  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.91 
 
 		 137 aa  47.8  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1159  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.12 
 
 		 142 aa  45.4  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3942  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.97 
 
 		 132 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000169504  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0316  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  30.39 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.12023 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1722  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  29.29 
 
 		 139 aa  43.5  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.57293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3709  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  26.6 
 
 		 133 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0929993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2908  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.19 
 
 		 155 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1109  Mov34/MPN/PAD-1  28.87 
 
 		 155 aa  42  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0762321  normal  0.216508 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3188  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  25.19 
 
 		 155 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.307175 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>