More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1240 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1240  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
484 aa  996    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.208234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0877  aldehyde dehydrogenase  77.59 
 
 
487 aa  803    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1815  aldehyde dehydrogenase  81.38 
 
 
491 aa  832    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0813  aldehyde dehydrogenase  76.31 
 
 
482 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05501  hypothetical protein  77.69 
 
 
486 aa  808    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001563  aldehyde dehydrogenase B  77.89 
 
 
486 aa  808    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2128  aldehyde dehydrogenase  76.35 
 
 
486 aa  798    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0517784  hitchhiker  0.00570201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2694  aldehyde dehydrogenase family protein  63.69 
 
 
480 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.657549 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3058  aldehyde dehydrogenase  63.69 
 
 
480 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3862  aldehyde dehydrogenase family protein  61.52 
 
 
480 aa  610  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  59.87 
 
 
483 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3381  aldehyde dehydrogenase  58.96 
 
 
482 aa  598  1e-170  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.464458  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.33 
 
 
480 aa  511  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0828  aldehyde dehydrogenase  52.34 
 
 
479 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0391677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  52.92 
 
 
485 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  52.92 
 
 
485 aa  499  1e-140  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_004310  BR0210  aldehyde dehydrogenase family protein  51.69 
 
 
477 aa  495  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  51.7 
 
 
480 aa  498  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  51.28 
 
 
480 aa  495  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2844  aldehyde dehydrogenase  52.94 
 
 
482 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.281069  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
498 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1958  aldehyde dehydrogenase  51.55 
 
 
479 aa  496  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  51.48 
 
 
477 aa  498  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  52.22 
 
 
477 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  50.85 
 
 
477 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1478  aldehyde dehydrogenase  50.82 
 
 
481 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.696903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  50.64 
 
 
477 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0201  aldehyde dehydrogenase family protein  51.27 
 
 
477 aa  490  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6489  aldehyde dehydrogenase  52.85 
 
 
482 aa  491  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  50.95 
 
 
475 aa  490  1e-137  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
478 aa  485  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  51.06 
 
 
482 aa  483  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1598  aldehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
479 aa  480  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0247  aldehyde dehydrogenase  53.78 
 
 
482 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1732  Aldehyde Dehydrogenase  51.91 
 
 
478 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0174509  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0452  aldehyde dehydrogenase  51.6 
 
 
480 aa  475  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1119  aldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
479 aa  476  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.65747 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1043  Aldehyde Dehydrogenase  51.37 
 
 
483 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1025  aldehyde dehydrogenase  51.39 
 
 
480 aa  474  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3422  aldehyde dehydrogenase  50.74 
 
 
479 aa  472  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.228587  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2664  aldehyde dehydrogenase  50.73 
 
 
480 aa  474  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.350023  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5935  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
476 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  51.68 
 
 
446 aa  464  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2256  aldehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
478 aa  444  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.134767  hitchhiker  0.000000459097 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1054  aldehyde dehydrogenase  57.75 
 
 
441 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.395537  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3017  aldehyde dehydrogenase  48.09 
 
 
478 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3959  Aldehyde Dehydrogenase  44.26 
 
 
482 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.424065  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  43.01 
 
 
482 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4482  Aldehyde Dehydrogenase  39.34 
 
 
479 aa  349  7e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0437923  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  39.16 
 
 
496 aa  341  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1856  aldehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
488 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 
505 aa  334  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  39.66 
 
 
516 aa  331  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.95 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  39.96 
 
 
483 aa  327  3e-88  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
498 aa  326  5e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 
484 aa  326  6e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  40.75 
 
 
482 aa  326  6e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  39.29 
 
 
483 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  37.26 
 
 
500 aa  323  4e-87  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1779  aldehyde dehydrogenase  37.09 
 
 
485 aa  323  4e-87  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  36.92 
 
 
493 aa  322  6e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  36.94 
 
 
478 aa  322  7e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  37.37 
 
 
503 aa  319  7.999999999999999e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3763  aldehyde dehydrogenase  37.45 
 
 
481 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1826  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
485 aa  318  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.225626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
497 aa  318  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  35.77 
 
 
496 aa  318  2e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  35.86 
 
 
499 aa  316  7e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  37.76 
 
 
493 aa  315  8e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.64 
 
 
498 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2635  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 
474 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.311715 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3632  aldehyde dehydrogenase family protein  37.74 
 
 
482 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 
491 aa  310  2.9999999999999997e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2257  aldehyde dehydrogenase  41.01 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.955322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
496 aa  309  8e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.89 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.89 
 
 
480 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.58 
 
 
483 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.89 
 
 
480 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.67 
 
 
480 aa  299  7e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.67 
 
 
480 aa  298  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
479 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.52 
 
 
483 aa  297  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.25 
 
 
482 aa  297  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  36.79 
 
 
510 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.04 
 
 
482 aa  296  8e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.04 
 
 
482 aa  295  9e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.04 
 
 
482 aa  295  9e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  36.11 
 
 
482 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  36.11 
 
 
482 aa  295  1e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.03 
 
 
480 aa  295  1e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.11 
 
 
482 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1476  betaine aldehyde dehydrogenase  35.33 
 
 
490 aa  295  1e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 
498 aa  295  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.11 
 
 
482 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2262  aldehyde dehydrogenase  37.05 
 
 
493 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3441  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.17 
 
 
479 aa  294  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.301737  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.74 
 
 
479 aa  293  3e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2295  2-hydroxymuconic semialdehyde dehydrogenase  37.92 
 
 
491 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>