More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1039 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1039  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 321 aa  662    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.204243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1556  LysR family transcriptional regulator  73.46 
 
 		 309 aa  474  1e-132  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00011369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3346  LysR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.773676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4012  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 298 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5102  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5504  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3073  LysR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 304 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0975  LysR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00417013 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1466  LysR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2659  OsmT protein  34.55 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4128  LysR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3576  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.300569  normal  0.06186 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6323  MarR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 294 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.482978  normal  0.771209 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0586  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  32.34 
 
 		 304 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5866  transcriptional regulator, LysR family  31.49 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3178  LysR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 305 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.0310919 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2683  OsmT protein  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.567691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2789  OsmT protein  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2617  OsmT protein  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2568  OsmT protein  33.77 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0008695  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6811  LysR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 309 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.659925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1626  transcriptional regulator, LysR family  32.34 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0614386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2826  LysR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17090  Transcriptional regulator, LysR family  34.39 
 
 		 299 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2504  transcriptional regulator, LysR family  32.12 
 
 		 298 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1268  putative HTH-type transcriptional regulator YbhD  33.77 
 
 		 297 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2054  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 298 aa  132  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3686  LysR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 297 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1573  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 297 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.117572  normal  0.71184 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4089  transcriptional regulator, LysR family  32.44 
 
 		 297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5443  LysR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.261718  normal  0.0544957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6026  transcriptional regulator, LysR family  34.95 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.306271 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1067  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0986  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1910  OsmT protein  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.580889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1757  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.233098  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1735  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0864805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1512  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0180  LysR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 300 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000907778  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2077  LysR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 296 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3296  putative transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02400  transcriptional regulator  31.74 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2569  LysR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0243965  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3294  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 294 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.438685 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1416  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.691659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1376  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809674  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2874  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000130864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3164  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3441  LysR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.985803  hitchhiker  0.000545962 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5612  LysR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2261  LysR family transcriptional regulator  34.14 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.015207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2894  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0369741  normal  0.204254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4655  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0129573  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0822  LysR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.835428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1221  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.301941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0871  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2590  transcriptional regulator, LysR family  29.71 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0791  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3334  transcriptional regulator, LysR family  30.34 
 
 		 302 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2130  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  31.86 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.809904  hitchhiker  0.00950877 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0795  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51620  LysR family transcriptional regulator protein  32 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1761  LysR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.982692  normal  0.0243449 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4635  LysR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.646338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4050  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0528  LysR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000454001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1735  LysR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.26615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5656  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3056  LysR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 293 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.20426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3691  transcriptional regulator, LysR family  31.02 
 
 		 301 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3512  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 304 aa  123  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.069263  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1141  LysR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.387698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3806  LysR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.335856 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1784  LysR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 308 aa  122  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.132591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1621  LysR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 297 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1470  LysR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4648  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3720  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101076  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4168  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.399858 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1913  LysR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283777  normal  0.375382 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4119  putative transcriptional regulator  30.06 
 
 		 298 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3165  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  29.66 
 
 		 302 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5385  transcriptional regulator, LysR family  29.04 
 
 		 313 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.121363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4046  putative transcriptional regulator  29.75 
 
 		 298 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0811  LysR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 296 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1494  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1013  LysR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 300 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1036  transcriptional regulator, LysR family  29.58 
 
 		 300 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4367  LysR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.764337  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1166  transcriptional regulator, LysR family  30.36 
 
 		 299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38680  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5388  transcriptional regulator, LysR family  42.57 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2001  transcriptional regulator, LysR family  27.65 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.536649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>