More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2975 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2975  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 448 aa  898    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.0575809 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2953  GntR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2829  GntR family transcriptional regulator  53.76 
 
 		 452 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2860  GntR family transcriptional regulator  54.2 
 
 		 451 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2669  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 476 aa  263  4e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3037  transcriptional regulator, putative  36.5 
 
 		 468 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00850156  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2910  regulatory protein, GntR  37.78 
 
 		 468 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.779971  normal  0.0177788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1831  transcriptional regulator  38.31 
 
 		 482 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  27.6 
 
 		 468 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  27.15 
 
 		 463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 477 aa  120  6e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.38 
 
 		 461 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  23.09 
 
 		 480 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.91 
 
 		 487 aa  109  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.37 
 
 		 479 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38250  putative transcriptional regulator  25.61 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293552 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 473 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3253  putative transcriptional regulator  26.17 
 
 		 474 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0471959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5531  GntR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433178 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1599  GntR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2450  GntR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 469 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00121397  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3543  transcriptional regulator  25.42 
 
 		 479 aa  106  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.735344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 479 aa  106  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  25.05 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4744  transcriptional regulator  25.32 
 
 		 475 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.0066637  normal  0.499437 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  26.35 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 470 aa  106  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.13 
 
 		 476 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.68 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 470 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.49 
 
 		 480 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.05 
 
 		 470 aa  103  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.41 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  26 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4449  GntR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 521 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000599789 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5785  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.88 
 
 		 483 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  24.84 
 
 		 470 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.96 
 
 		 474 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0240  GntR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3949  GntR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 473 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.905833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6190  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.04 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3280  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  25 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5088  GntR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 473 aa  100  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  24.57 
 
 		 478 aa  100  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 532 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.73 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5194  transcriptional regulator  26.51 
 
 		 478 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5727  transcriptional regulator  24.57 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.769586 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1713  aminotransferase, classes I and II superfamily  25.65 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1778  aminotransferase, classes I and II superfamily  25.65 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3836  GntR family transcriptional regulator  24.25 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  26.05 
 
 		 474 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  26.05 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1562  aminotransferase, classes I and II superfamily  25.65 
 
 		 474 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4578  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 473 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6902  transcriptional regulator  26.79 
 
 		 488 aa  98.2  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.78999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  26.49 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3790  GntR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 473 aa  97.8  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 473 aa  97.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 477 aa  97.1  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1939  transcriptional regulator  23.5 
 
 		 476 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0234327  normal  0.0215976 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 489 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0214  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  22.83 
 
 		 478 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0766  GntR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 473 aa  96.3  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.124102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  24.94 
 
 		 478 aa  95.5  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5787  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  23.67 
 
 		 483 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  24.95 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3052  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  23.11 
 
 		 477 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.383361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0209  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  22.61 
 
 		 474 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0910  GntR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  24.15 
 
 		 487 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 483 aa  94.4  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0195  transcriptional regulator  24.72 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.344664  hitchhiker  0.000191089 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 472 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  24.47 
 
 		 469 aa  93.6  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  25.37 
 
 		 493 aa  93.6  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2129  GntR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 469 aa  93.6  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.98832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2639  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.19 
 
 		 477 aa  93.6  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0568  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2611  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.36 
 
 		 479 aa  93.2  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.892437  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4391  transcriptional regulator  28.2 
 
 		 477 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.046272 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6904  transcriptional regulator  25.12 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0096  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, class I  23.32 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 470 aa  92.8  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 471 aa  92.8  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4500  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 472 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.705718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5025  transcriptional regulator  25.99 
 
 		 472 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0230  transcriptional regulator GntR  23.16 
 
 		 473 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0983  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25 
 
 		 517 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5327  transcriptional regulator  25 
 
 		 496 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.898471  normal  0.06298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>