More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0623 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4798  lytic murein transglycosylase  92.47 
 
 		 438 aa  806    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.287921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4817  HopAJ2 protein  70.75 
 
 		 445 aa  635    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4961  lytic murein transglycosylase  74.94 
 
 		 440 aa  665    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4673  lytic murein transglycosylase  92.69 
 
 		 438 aa  806    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4851  lytic murein transglycosylase  92.92 
 
 		 438 aa  810    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0623  lytic murein transglycosylase  100 
 
 		 438 aa  887    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4357  hypothetical protein  70.52 
 
 		 445 aa  630  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08490  lytic murein transglycosylase  64.97 
 
 		 438 aa  539  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0470585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12160  putative murein transglycosylase  63.26 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.396872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1115  putative lipoprotein  62.76 
 
 		 448 aa  518  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1939  lytic murein transglycosylase  62.73 
 
 		 427 aa  482  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421247 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3790  lytic murein transglycosylase  61.42 
 
 		 418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0051  lytic murein transglycosylase  49.14 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2786  lytic murein transglycosylase  51.62 
 
 		 419 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.245296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1125  membrane bound lytic murein transglycosylase B  49.13 
 
 		 417 aa  377  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.170659  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0016  lytic murein transglycosylase  46.56 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0388549  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0852  type III helper protein HopAJ1  47.8 
 
 		 413 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0904  lytic murein transglycosylase  51.34 
 
 		 430 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1902  lytic murein transglycosylase  46.28 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2510  lytic murein transglycosylase  50.27 
 
 		 417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.577172 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2991  lytic murein transglycosylase  49.73 
 
 		 455 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.729746  normal  0.516476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1837  lytic murein transglycosylase  49.49 
 
 		 474 aa  361  2e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.436573 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1848  lytic murein transglycosylase  47.85 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1688  lytic murein transglycosylase  48.97 
 
 		 466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3237  lytic murein transglycosylase  49.87 
 
 		 470 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.50789  normal  0.403321 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0327  lytic murein transglycosylase  46.62 
 
 		 434 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1030  lytic murein transglycosylase  49.47 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0850  lytic murein transglycosylase  46.65 
 
 		 432 aa  350  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4208  transglycolase  48.53 
 
 		 398 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2024  lytic murein transglycosylase  46.75 
 
 		 457 aa  351  2e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.796607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49280  transglycolase  47.99 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.520721  normal  0.0136859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  49.33 
 
 		 454 aa  347  3e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3055  lytic murein transglycosylase  47.01 
 
 		 413 aa  345  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1653  lytic murein transglycosylase  49.46 
 
 		 424 aa  342  7e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.725775 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0498  lytic murein transglycosylase  45.43 
 
 		 409 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000929833  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3255  lytic murein transglycosylase  47.29 
 
 		 418 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.278323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3279  lytic murein transglycosylase  46.79 
 
 		 413 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.991349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0959  lytic murein transglycosylase  47.31 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5276  lytic murein transglycosylase  46.38 
 
 		 398 aa  338  8e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.960843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3997  lytic murein transglycosylase  46.13 
 
 		 422 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.162973  normal  0.0839045 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  50.53 
 
 		 390 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4521  lytic murein transglycosylase  45.19 
 
 		 464 aa  331  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0042  lytic murein transglycosylase  45.04 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0388  lytic murein transglycosylase  44.63 
 
 		 443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.143881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4844  lytic murein transglycosylase  45.66 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00837309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5203  lytic murein transglycosylase  46.22 
 
 		 398 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.511887 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0968  lytic murein transglycosylase  44.2 
 
 		 461 aa  326  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164156  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0064  putative transglycosylase  46.17 
 
 		 412 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0357  lytic murein transglycosylase  47.99 
 
 		 514 aa  326  6e-88  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4736  lytic murein transglycosylase  46.35 
 
 		 398 aa  325  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6960  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative signal peptide  44.75 
 
 		 464 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0871  lytic murein transglycosylase  49.33 
 
 		 429 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.874222  normal  0.184332 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2522  lytic murein transglycosylase  44.39 
 
 		 406 aa  322  9.999999999999999e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1704  lytic murein transglycosylase  47.61 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.030456  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1465  lytic murein transglycosylase  45.99 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20045 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3959  hypothetical protein  47.15 
 
 		 411 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315352  normal  0.0796345 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03307  transglycolase  45.99 
 
 		 720 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0752099  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4047  lytic murein transglycosylase  48.01 
 
 		 423 aa  319  7e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0041  lytic murein transglycosylase  45.04 
 
 		 398 aa  318  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.765237  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1132  lytic murein transglycosylase  43.98 
 
 		 481 aa  317  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4273  lytic murein transglycosylase  45.38 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2957  lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 470 aa  317  3e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.344089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3229  membrane-bound lytic murein transglycosylase B  46.35 
 
 		 462 aa  317  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3356  lytic murein transglycosylase  44.25 
 
 		 430 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3967  lytic murein transglycosylase  45.43 
 
 		 413 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4363  lytic murein transglycosylase  43.7 
 
 		 469 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.831397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3470  lytic murein transglycosylase  47.45 
 
 		 400 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0775  lytic murein transglycosylase  43.09 
 
 		 451 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.73463 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1174  lytic murein transglycosylase  47.72 
 
 		 392 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0070  transglycosylase, putative  44.85 
 
 		 408 aa  312  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.18416  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3599  lytic murein transglycosylase  43.92 
 
 		 410 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.522427  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3272  lytic murein transglycosylase  47.59 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3596  lytic murein transglycosylase  47.59 
 
 		 393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.662665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1233  lytic murein transglycosylase  46.22 
 
 		 405 aa  307  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0329877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1807  lytic murein transglycosylase  49.87 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3612  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2708  lytic murein transglycosylase  43.68 
 
 		 405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.384305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3314  lytic murein transglycosylase  43.65 
 
 		 407 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.949195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3645  lytic murein transglycosylase  44.12 
 
 		 419 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0107772  normal  0.911576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3727  lytic murein transglycosylase  43.54 
 
 		 405 aa  301  2e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2868  lytic murein transglycosylase  43.81 
 
 		 425 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0662  lytic murein transglycosylase  41.48 
 
 		 433 aa  296  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00608172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0167  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 445 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000010193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3846  lytic murein transglycosylase  45.12 
 
 		 416 aa  296  5e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.977376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0212  lytic murein transglycosylase  42.36 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.740075  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2740  lytic murein transglycosylase  44.59 
 
 		 407 aa  294  2e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.788715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00471  membrane-bound lytic transglycolase-related protein  40.21 
 
 		 421 aa  289  8e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2675  lytic murein transglycosylase  41.35 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00742108  normal  0.0400647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2313  lytic murein transglycosylase  41.75 
 
 		 415 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.429417  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0691  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.98 
 
 		 434 aa  288  2e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000567211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0061  lytic murein transglycosylase  42.12 
 
 		 434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.266485  normal  0.550387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2246  lytic murein transglycosylase  43.27 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.27518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1972  lytic murein transglycosylase  45.32 
 
 		 486 aa  285  1.0000000000000001e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00000000382948  normal  0.768189 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0286  lytic murein transglycosylase  44.39 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1213  lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 417 aa  282  7.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1952  transglycolase  44.18 
 
 		 491 aa  282  8.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.135275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0333  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.42 
 
 		 418 aa  282  1e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1904  lytic murein transglycosylase  39.29 
 
 		 396 aa  281  2e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000413322  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3573  lytic murein transglycosylase  39.81 
 
 		 381 aa  281  2e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.161419  decreased coverage  0.00457991 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2141  lytic murein transglycosylase  39.78 
 
 		 395 aa  280  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000982897  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>