More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1344 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1752  hypothetical protein  97.38 
 
 		 497 aa  995    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1344  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1018    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.38694  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1640  hypothetical protein  79.68 
 
 		 498 aa  815    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.616022  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3741  hypothetical protein  79.88 
 
 		 498 aa  812    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.733185  decreased coverage  0.00529979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1672  hypothetical protein  76.61 
 
 		 544 aa  797    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3229  hypothetical protein  83.87 
 
 		 496 aa  860    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4097  polyphosphate:AMP phosphotransferase  82.49 
 
 		 504 aa  864    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1360  hypothetical protein  93.36 
 
 		 497 aa  962    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0227982  normal  0.362611 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34920  hypothetical protein  78.86 
 
 		 494 aa  804    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.195205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19410  hypothetical protein  76.61 
 
 		 496 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.139805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3962  hypothetical protein  97.18 
 
 		 497 aa  994    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.701093  normal  0.023635 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3059  protein of unknown function DUF344  60.93 
 
 		 495 aa  594  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000557156  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0728  hypothetical protein  57.61 
 
 		 492 aa  589  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.156252  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3585  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.91 
 
 		 501 aa  582  1.0000000000000001e-165  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.699024  normal  0.181512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1113  polyphosphate:AMP phosphotransferase  55.51 
 
 		 497 aa  556  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1544  hypothetical protein  56.39 
 
 		 521 aa  547  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3178  hypothetical protein  48.59 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1873  hypothetical protein  49.4 
 
 		 497 aa  480  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.771606  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0223  polyphosphate:AMP phosphotransferase  48.2 
 
 		 534 aa  479  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2533  protein of unknown function DUF344  48.37 
 
 		 491 aa  471  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1024  polyphosphate:AMP phosphotransferase  46.27 
 
 		 499 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0970051  normal  0.793106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2483  hypothetical protein  49.2 
 
 		 496 aa  452  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0802177  normal  0.278006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3113  hypothetical protein  45.92 
 
 		 490 aa  443  1e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.895216  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0486  protein of unknown function DUF344  45.36 
 
 		 495 aa  423  1e-117  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0493  hypothetical protein  43.8 
 
 		 494 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.429622 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0250  protein of unknown function DUF344  42.34 
 
 		 497 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.328476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4140  protein of unknown function DUF344  39.92 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1989  protein of unknown function DUF344  40.98 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.210937 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4180  protein of unknown function DUF344  39.92 
 
 		 496 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0333  protein of unknown function DUF344  40.45 
 
 		 486 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1080  hypothetical protein  37.99 
 
 		 532 aa  362  9e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0834  protein of unknown function DUF344  38.29 
 
 		 549 aa  362  9e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1052  hypothetical protein  37.78 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0280365  normal  0.329166 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2786  hypothetical protein  38.13 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1051  hypothetical protein  39.21 
 
 		 494 aa  351  2e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0734812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2856  polyphosphate:AMP phosphotransferase  39.87 
 
 		 502 aa  350  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.10057  hitchhiker  0.00199594 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01720  hypothetical protein  36.26 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0787  hypothetical protein  38.1 
 
 		 556 aa  326  7e-88  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1612  hypothetical protein  35.87 
 
 		 498 aa  324  2e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0690  hypothetical protein  36.88 
 
 		 556 aa  319  6e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0715  polyphosphate:AMP phosphotransferase  36.54 
 
 		 551 aa  316  6e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0721  protein of unknown function DUF344  34.95 
 
 		 578 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000055361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1576  protein of unknown function DUF344  34.35 
 
 		 492 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000036062  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2140  hypothetical protein  33.48 
 
 		 474 aa  271  2.9999999999999997e-71  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04180  hypothetical protein  53.48 
 
 		 609 aa  256  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.648389  normal  0.925232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1100  hypothetical protein  53.65 
 
 		 288 aa  252  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00431541  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3513  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.85 
 
 		 267 aa  239  9e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1829  UDP-galactose-lipid carrier transferase  50.43 
 
 		 267 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1909  hypothetical protein  48.12 
 
 		 270 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4840  protein of unknown function DUF344  49.59 
 
 		 259 aa  233  5e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1945  hypothetical protein  48.09 
 
 		 270 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.180393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1685  hypothetical protein  48.09 
 
 		 270 aa  229  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1668  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.66 
 
 		 270 aa  228  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.105947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1644  UDP-galactose-lipid carrier transferase  47.66 
 
 		 270 aa  228  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1868  hypothetical protein  47.66 
 
 		 270 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.00208e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1688  hypothetical protein  47.66 
 
 		 254 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1823  hypothetical protein  47.66 
 
 		 254 aa  227  3e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.180216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0309  hypothetical protein  48.15 
 
 		 308 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1433  hypothetical protein  46.58 
 
 		 270 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3985  protein of unknown function DUF344  44.13 
 
 		 258 aa  209  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 264 aa  206  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0044  hypothetical protein  47.25 
 
 		 261 aa  203  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0000123179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1749  hypothetical protein  46.36 
 
 		 263 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.462127  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01607  UDP-galactose-lipid carrier transferase MED92  45.41 
 
 		 279 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0013  hypothetical protein  41.67 
 
 		 299 aa  180  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0981  polyphosphate kinase 2  38.94 
 
 		 262 aa  179  9e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0772  hypothetical protein  41.94 
 
 		 303 aa  179  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.861555  normal  0.621258 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1595  putative polyphosphate kinase 2  37.45 
 
 		 289 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0560788  normal  0.483146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1858  hypothetical protein  39.32 
 
 		 375 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4500  hypothetical protein  41.7 
 
 		 307 aa  176  7e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1833  hypothetical protein  38.36 
 
 		 263 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.795184  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16850  hypothetical protein  43.68 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.502638  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1572  hypothetical protein  39.75 
 
 		 322 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0713736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4684  hypothetical protein  37.5 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4762  hypothetical protein  40.18 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.457948 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01037  hypothetical protein  37.84 
 
 		 256 aa  172  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2934  hypothetical protein  40 
 
 		 318 aa  172  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.367284 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1067  hypothetical protein  41.59 
 
 		 337 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.37617  normal  0.971255 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0380  hypothetical protein  40.52 
 
 		 314 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34890  hypothetical protein  38.24 
 
 		 305 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0574306  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0117  hypothetical protein  40.09 
 
 		 300 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249433 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2513  protein of unknown function DUF344  42.49 
 
 		 405 aa  171  4e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.197532  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0297  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2217  hypothetical protein  37.31 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.326652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0310  hypothetical protein  40 
 
 		 319 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1311  hypothetical protein  41.12 
 
 		 359 aa  170  7e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.833916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0751  protein of unknown function DUF344  41.88 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000000230323  normal  0.562288 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0304  hypothetical protein  32.84 
 
 		 326 aa  169  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0192287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0309  hypothetical protein  35.89 
 
 		 326 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420571  normal  0.941075 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0187  protein of unknown function DUF344  40.55 
 
 		 296 aa  168  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.520088  normal  0.078005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6987  protein of unknown function DUF344  40.45 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.839871 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4575  protein of unknown function DUF344  41.95 
 
 		 304 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0554102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3677  hypothetical protein  41.2 
 
 		 274 aa  168  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1113  hypothetical protein  38.77 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.739002  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1900  protein of unknown function DUF344  39.09 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.276444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4924  hypothetical protein  35 
 
 		 331 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000671683 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0218  hypothetical protein  36.03 
 
 		 357 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2424  protein of unknown function DUF344  37.08 
 
 		 304 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2353  hypothetical protein  39.06 
 
 		 294 aa  167  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.146636  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1356  protein of unknown function DUF344  35.65 
 
 		 293 aa  167  4e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.442869  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>