More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3535 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3535  pantoate--beta-alanine ligase  100 
 
 
284 aa  577  1e-164  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000260902  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2079  pantoate--beta-alanine ligase  63.21 
 
 
282 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0111678  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0958  pantoate--beta-alanine ligase  63.21 
 
 
283 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1706  pantoate--beta-alanine ligase  61.43 
 
 
283 aa  355  3.9999999999999996e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1643  pantoate--beta-alanine ligase  60 
 
 
283 aa  347  1e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.966928  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3011  pantoate--beta-alanine ligase  59.29 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1239  pantoate--beta-alanine ligase  58.21 
 
 
279 aa  333  3e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000121643 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1980  pantoate--beta-alanine ligase  55.91 
 
 
282 aa  332  5e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1789  pantoate--beta-alanine ligase  53.41 
 
 
281 aa  308  5e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1667  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
280 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1740  pantoate--beta-alanine ligase  51.79 
 
 
280 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0369  pantoate--beta-alanine ligase  53.05 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.397358 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0901  pantoate--beta-alanine ligase  51.96 
 
 
281 aa  302  5.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00163902  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1524  pantoate--beta-alanine ligase  53.07 
 
 
280 aa  301  7.000000000000001e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1571  pantoate--beta-alanine ligase  51.43 
 
 
280 aa  300  2e-80  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0161  pantoate--beta-alanine ligase  50.54 
 
 
281 aa  299  3e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.253183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1829  pantoate--beta-alanine ligase  52.69 
 
 
283 aa  298  8e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0426  pantoate--beta-alanine ligase  50 
 
 
283 aa  297  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0155  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  292  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0141  pantothenate synthetase  51.6 
 
 
283 aa  291  6e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1610  pantoate--beta-alanine ligase  50.71 
 
 
280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.228935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1669  pantoate--beta-alanine ligase  50.53 
 
 
282 aa  285  7e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1423  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1707  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000103153  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1596  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
282 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0472681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3749  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.94763  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1450  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1422  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1563  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.371985  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1634  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0402516 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1786  pantoate/beta-alanine ligase  48.55 
 
 
281 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.300346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2117  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
282 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0102  pantoate--beta-alanine ligase  48.23 
 
 
282 aa  278  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.346263  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0042  pantoate--beta-alanine ligase  51.85 
 
 
273 aa  278  6e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000112642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1465  pantoate--beta-alanine ligase  49.82 
 
 
282 aa  275  7e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3014  pantoate/beta-alanine ligase  46.4 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.207166 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2606  pantoate/beta-alanine ligase  48.19 
 
 
288 aa  273  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0342  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
282 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4743  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.16561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0502  pantoate--beta-alanine ligase  51.25 
 
 
300 aa  271  7e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1667  pantoate--beta-alanine ligase  46.74 
 
 
282 aa  271  7e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2430  pantoate/beta-alanine ligase  51.85 
 
 
288 aa  269  5e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.680362  normal  0.870169 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0320  pantoate--beta-alanine ligase  46.01 
 
 
282 aa  268  7e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0329  pantoate--beta-alanine ligase  48.4 
 
 
293 aa  267  1e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0117  pantoate/beta-alanine ligase  50 
 
 
279 aa  268  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0241  pantoate--beta-alanine ligase  50.18 
 
 
281 aa  268  1e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.139282  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0744  pantoate--beta-alanine ligase  51.97 
 
 
278 aa  267  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.809915  hitchhiker  0.00112992 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0346  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
293 aa  265  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.900978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1263  pantoate--beta-alanine ligase  47.33 
 
 
282 aa  266  4e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.933341  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0333  pantoate--beta-alanine ligase  49.46 
 
 
278 aa  265  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4812  pantoate--beta-alanine ligase  47 
 
 
286 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.257734  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0749  pantoate/beta-alanine ligase  46.48 
 
 
289 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0722466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0666  pantoate--beta-alanine ligase  50.36 
 
 
282 aa  263  3e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4700  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
287 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.497355  hitchhiker  0.000822225 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3426  pantoate/beta-alanine ligase  54.37 
 
 
294 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0960  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
283 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2060  pantoate--beta-alanine ligase  46.79 
 
 
291 aa  260  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.047141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4565  pantoate--beta-alanine ligase  48.06 
 
 
287 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0650903 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2151  pantoate--beta-alanine ligase  46.59 
 
 
286 aa  259  2e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1266  pantoate/beta-alanine ligase  45.55 
 
 
289 aa  260  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3460  pantoate--beta-alanine ligase  46.43 
 
 
276 aa  260  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4699  pantoate--beta-alanine ligase  47.69 
 
 
287 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.021644  hitchhiker  0.00466856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2674  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
283 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2620  pantoate--beta-alanine ligase  44.44 
 
 
283 aa  258  6e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4487  pantoate/beta-alanine ligase  50.71 
 
 
287 aa  258  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1876  pantoate/beta-alanine ligase  47.2 
 
 
288 aa  257  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3808  pantoate--beta-alanine ligase  51.62 
 
 
289 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0471604 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0728  pantoate--beta-alanine ligase  45 
 
 
277 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.41941  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4723  pantoate--beta-alanine ligase  45.52 
 
 
309 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0426  pantoate--beta-alanine ligase  46.26 
 
 
289 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188172  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0733  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
287 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.536898  hitchhiker  0.0000595497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0827  pantoate--beta-alanine ligase  46.98 
 
 
283 aa  256  3e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000353148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3066  pantothenate synthetase  48.08 
 
 
283 aa  255  7e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3593  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1498  pantoate--beta-alanine ligase  47.86 
 
 
281 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00126611  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3681  pantoate--beta-alanine ligase  54.01 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.963286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9160  Pantoate--beta-alanine ligase  49.23 
 
 
285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3904  pantoate--beta-alanine ligase  48.16 
 
 
281 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3281  pantoate--beta-alanine ligase  45.68 
 
 
284 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0039  pantothenate synthetase  49.25 
 
 
289 aa  253  3e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1707  pantoate--beta-alanine ligase  46.1 
 
 
290 aa  251  7e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62590  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 
283 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1683  pantoate--beta-alanine ligase  45.49 
 
 
287 aa  251  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.708165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5447  pantoate--beta-alanine ligase  48.2 
 
 
283 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1012  pantoate--beta-alanine ligase  46.32 
 
 
284 aa  251  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0272809  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4683  pantoate--beta-alanine ligase  43.37 
 
 
300 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3473  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
284 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.623251  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3344  pantoate--beta-alanine ligase  46.64 
 
 
284 aa  250  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000501191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3803  pantoate--beta-alanine ligase  46.69 
 
 
281 aa  250  2e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0604878  hitchhiker  0.00446449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42720  pantoate--beta-alanine ligase  48.92 
 
 
283 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002560  pantoate--beta-alanine ligase  47.48 
 
 
301 aa  249  3e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0445865  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0122  pantoate--beta-alanine ligase  48.04 
 
 
293 aa  249  3e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0223415  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_708  pantothenate synthetase  44.29 
 
 
277 aa  249  4e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3319  pantoate--beta-alanine ligase  47.02 
 
 
286 aa  249  5e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0670  pantoate--beta-alanine ligase  51.71 
 
 
296 aa  249  5e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0101  pantoate--beta-alanine ligase  48.75 
 
 
327 aa  248  7e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.86 
 
 
511 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.48 
 
 
511 aa  248  8e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03451  pantoate--beta-alanine ligase  46.4 
 
 
300 aa  247  1e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0787  pantoate--beta-alanine ligase  47.14 
 
 
283 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.232916  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>