More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1184 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1184  trigger factor  100 
 
 		 437 aa  894    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0453455  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1929  trigger factor  56.88 
 
 		 440 aa  528  1e-149  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1793  trigger factor  48.01 
 
 		 431 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1874  trigger factor  45.79 
 
 		 433 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00213864  hitchhiker  0.00627328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1914  trigger factor  42.13 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3012  trigger factor  42.73 
 
 		 435 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1271  trigger factor  42.26 
 
 		 435 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.254971  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1690  trigger factor  37.91 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675856  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2692  trigger factor  30.86 
 
 		 443 aa  239  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538517  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0864  trigger factor  32.18 
 
 		 428 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3422  trigger factor  31.07 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.375201  normal  0.212187 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14950  trigger factor  33.18 
 
 		 429 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000821588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3500  trigger factor  30.61 
 
 		 429 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3436  trigger factor  30.61 
 
 		 429 aa  226  8e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2588  trigger factor  33.1 
 
 		 428 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000707375  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3354  trigger factor  30.37 
 
 		 429 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1101  trigger factor  32.48 
 
 		 446 aa  223  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.355325 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2739  trigger factor  32.72 
 
 		 428 aa  216  4e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.18941  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2563  trigger factor  31.96 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000372878  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3643  trigger factor  29.26 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000676288  normal  0.562655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0708  trigger factor  32.65 
 
 		 438 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0109  trigger factor  28.97 
 
 		 432 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.17984 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1239  trigger factor  29.88 
 
 		 433 aa  210  4e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00475597  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1846  trigger factor  32.54 
 
 		 435 aa  209  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000327269  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1657  trigger factor  32.14 
 
 		 438 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.186849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0572  trigger factor  30.16 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.19365 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0198  trigger factor  28.97 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1480  trigger factor  30.88 
 
 		 438 aa  206  6e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000182138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0938  trigger factor  28.97 
 
 		 436 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.401032  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4984  trigger factor  28.41 
 
 		 448 aa  203  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0510  trigger factor  27.84 
 
 		 448 aa  202  8e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.155195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1733  trigger factor  30.07 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000517183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1767  trigger factor  30.07 
 
 		 433 aa  202  8e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0101  trigger factor  30.77 
 
 		 435 aa  202  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295209  normal  0.0149701 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3187  trigger factor  31.57 
 
 		 427 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1841  trigger factor  28.5 
 
 		 434 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00619817  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0652  trigger factor  30.72 
 
 		 436 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000093301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4591  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0423813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1735  trigger factor  28.47 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0657081  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0643  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.143322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4609  trigger factor  31.81 
 
 		 425 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000116057  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4318  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  199  6e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.694533  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4564  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.769811  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4560  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4370  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00100486  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4206  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0389445  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4217  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000155995  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4705  trigger factor  31.57 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0400876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0376  trigger factor  31.08 
 
 		 428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.119844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2302  trigger factor  29.95 
 
 		 432 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0018362  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0809  trigger factor  28.5 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4378  trigger factor  29.59 
 
 		 426 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000799754  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2222  trigger factor  27.67 
 
 		 438 aa  196  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.939539  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1648  trigger factor  32.51 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.56288  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1386  trigger factor  32.24 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00824823  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3605  trigger factor  29.93 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2341  trigger factor  28.44 
 
 		 435 aa  192  8e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0955017  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1746  trigger factor  28.18 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.132696 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2049  trigger factor  27.31 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431317  normal  0.217945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3727  trigger factor  27.94 
 
 		 436 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.267155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0307  trigger factor  28.44 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000121023  normal  0.638239 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2647  trigger factor  27.3 
 
 		 488 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1901  trigger factor  27.55 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.191378  hitchhiker  0.00938494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1741  trigger factor  27.11 
 
 		 437 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658695 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2299  trigger factor  27.31 
 
 		 443 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457193 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0527  trigger factor  31.52 
 
 		 446 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000228546  normal  0.800279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004045  cell division trigger factor  28.37 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000395206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3356  trigger factor  27.56 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.185732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3470  trigger factor  27.08 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000745697 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2922  trigger factor  28.38 
 
 		 460 aa  184  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.583147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2047  trigger factor  28.18 
 
 		 448 aa  184  4.0000000000000006e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109899  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3497  trigger factor  25.93 
 
 		 436 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0314111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23550  trigger factor  26.93 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2682  trigger factor  27.8 
 
 		 434 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000115435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0690  trigger factor  27.99 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.110264  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1830  trigger factor  28.22 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1677  trigger factor  29.34 
 
 		 443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.294765  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2524  trigger factor  29.43 
 
 		 474 aa  180  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1826  trigger factor  28.33 
 
 		 443 aa  179  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3698  trigger factor  27.65 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41250  trigger factor  25.46 
 
 		 436 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.755772 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0751  trigger factor  27.55 
 
 		 437 aa  179  7e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.173993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1561  trigger factor  28.92 
 
 		 437 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.528079  decreased coverage  0.00345443 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1214  trigger factor  27.53 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1431  trigger factor  27.78 
 
 		 432 aa  178  1e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0842369  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00387  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000419065  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3173  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000698649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0479  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000713029  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00391  hypothetical protein  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000262738  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0522  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000233962  normal  0.478364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3196  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000193083  hitchhiker  0.000427763 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1607  trigger factor  26.5 
 
 		 444 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0513  trigger factor  29.14 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.68965e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1538  trigger factor  31.34 
 
 		 478 aa  178  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0550  trigger factor  30.61 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000250017  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2509  trigger factor  28.54 
 
 		 434 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000731467  normal  0.870147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0373  trigger factor  31.25 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2313  trigger factor  29.43 
 
 		 430 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1549  trigger factor  28.01 
 
 		 463 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0472  trigger factor  28.9 
 
 		 432 aa  177  4e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>