More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0860 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  305  2.0000000000000002e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  92.8  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 151 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2812  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0746607  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 158 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  30.83 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 170 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01612  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1852  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00181712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  31.01 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2354  transcriptional regulator SlyA  31.43 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00255065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  31.78 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 155 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  30.53 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.71 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1428  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.03 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1921  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.153298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  27.74 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.71 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  29.46 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 171 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  26.5 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  31.54 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0628  regulatory protein MarR  31.36 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  30.77 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 176 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  31.01 
 
 		 144 aa  52  0.000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  28.68 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.66 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  32.82 
 
 		 144 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1536  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 162 aa  50.4  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.646102  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 		 168 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.69 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3109  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.0089778  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3838  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 154 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.47 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>