70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2115 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  100 
 
 		 68 aa  140  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  75 
 
 		 68 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  75 
 
 		 68 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1241  hypothetical protein  66.67 
 
 		 55 aa  82  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1009  hypothetical protein  50.75 
 
 		 76 aa  73.9  0.0000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000893941  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  56.14 
 
 		 72 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  50.94 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  46.67 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  54 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  54 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  43.1 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1234  protein of unknown function UPF0150  42.42 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.07931 
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  54 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0206  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00139417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0210  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  40 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  42 
 
 		 57 aa  53.5  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0719  hypothetical protein  51.16 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.08984  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  54 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  38.81 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1541  hypothetical protein  58.97 
 
 		 56 aa  50.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4102  hypothetical protein  52.78 
 
 		 47 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1787  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0443  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0276188 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0034  hypothetical protein  47.92 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  0.586089  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  36.23 
 
 		 74 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  39.06 
 
 		 74 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  45.65 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1442  hypothetical protein  37.04 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2743  hypothetical protein  42.22 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  39.62 
 
 		 64 aa  45.1  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1108  hypothetical protein  48.98 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 130 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3101  hypothetical protein  45.65 
 
 		 56 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.031062  normal  0.0887922 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4580  hypothetical protein  36.62 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.520083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  43.18 
 
 		 74 aa  43.5  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 67 aa  43.5  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  35.56 
 
 		 69 aa  43.9  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 67 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  38 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5716  hypothetical protein  37.93 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  47.83 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  40.48 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2428  hypothetical protein  44.44 
 
 		 122 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  36.17 
 
 		 67 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  35.56 
 
 		 69 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0158  protein of unknown function UPF0150  44.44 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0847  protein of unknown function UPF0150  35.19 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  35.42 
 
 		 71 aa  41.2  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2553  hypothetical protein  41.67 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0369521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1324  protein of unknown function UPF0150  44.9 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2639  protein of unknown function UPF0150  42.22 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0153  hypothetical protein  40.74 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0455  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2449  hypothetical protein  31.25 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  35.71 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  41.67 
 
 		 137 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>