135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0085 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0085  Ferritin Dps family protein  100 
 
 		 165 aa  340  5e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2674  Ferritin, Dps family protein  87.8 
 
 		 164 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00193061  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0092  Ferritin Dps family protein  85.98 
 
 		 164 aa  305  1.0000000000000001e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.523921  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2196  Ferritin Dps family protein  82.1 
 
 		 164 aa  288  2e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.717028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0582  bacterioferritin  81.1 
 
 		 164 aa  287  4e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0017201  normal  0.223999 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1979  bacterioferritin  79.88 
 
 		 164 aa  287  5.0000000000000004e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0104  Ferritin Dps family protein  81.48 
 
 		 164 aa  285  2e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0104  Ferritin Dps family protein  66.67 
 
 		 167 aa  233  6e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0131  Ferritin and Dps  59.76 
 
 		 164 aa  226  1e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1706  Ferritin Dps family protein  65.61 
 
 		 167 aa  225  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2517  Ferritin Dps family protein  65.61 
 
 		 167 aa  224  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.239409 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0906  Ferritin, Dps family protein  60.25 
 
 		 164 aa  218  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000158924  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1760  Ferritin and Dps  53.66 
 
 		 171 aa  189  2e-47  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0793  Ferritin Dps family protein  46.3 
 
 		 167 aa  121  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000048868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3513  Ferritin, Dps family protein  35.62 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2836  Ferritin Dps family protein  35.62 
 
 		 181 aa  87  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.596859  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3866  Ferritin, Dps family protein  34.93 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5602  putative bacterioferritin  33.33 
 
 		 177 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0567  Ferritin and Dps  33.57 
 
 		 176 aa  84  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.8657  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64520  putative bacterioferritin  32.64 
 
 		 177 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5724  ferritin Dps family protein  32.9 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0602256  normal  0.927599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0147  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0139  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3021  Ferritin Dps family protein  32.62 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.331122 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2901  rubrerythrin:Ferritin and Dps  31.94 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.778034  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0389  Ferritin, Dps family protein  32.17 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0951533 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1702  Ferritin Dps family protein  34.03 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.766547 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4448  Ferritin and Dps  32.17 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4913  Ferritin Dps family protein  33.11 
 
 		 176 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6426  Ferritin Dps family protein  31.29 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.714636  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4734  Ferritin, Dps family protein  33.11 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000711152 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4856  bacterioferritin, putative  33.11 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.192046  hitchhiker  0.00133905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4648  Ferritin Dps family protein  32.34 
 
 		 176 aa  80.9  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.732955  normal  0.0579106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4114  Ferritin Dps family protein  34.29 
 
 		 186 aa  80.5  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0888  Ferritin Dps family protein  33.33 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1509  Ferritin Dps family protein  33.57 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55793  normal  0.936849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4906  bacterioferritin, putative  32.17 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02642  bacterioferritin  29.58 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2663  Ferritin and Dps  34.03 
 
 		 257 aa  74.3  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0360  DNA protection protein DPS  36.6 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000011303  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0377  DNA protection protein DPS  36.6 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00170457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2233  putative bacterioferritin (cytochrome b1)  32.12 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.305727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1264  DNA protection protein DPS  34.01 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.561505  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2795  Ferritin Dps family protein  34.01 
 
 		 188 aa  63.9  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1402  Ferritin, Dps family protein  31.69 
 
 		 182 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2926  DNA protection protein DPS  32.47 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00617656  hitchhiker  0.00193455 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1498  DNA protection protein DPS  33.12 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.328213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0895  Ferritin Dps family protein  28.67 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.743965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1908  bacterioferritin  31.29 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000155674  hitchhiker  0.0000000236672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2657  Ferritin Dps family protein  34.04 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454229  normal  0.6432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0011  Ferritin Dps family protein  33.8 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2771  Ferritin Dps family protein  31.85 
 
 		 151 aa  60.5  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0415  DNA protection protein DPS  32.47 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1121  DNA protection protein DPS  33.09 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.543654 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2218  Ferritin Dps family protein  30.37 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.471897 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0209  DNA protection protein DPS  31.82 
 
 		 183 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.15724  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1760  DNA protection protein DPS  31.82 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0542681  normal  0.035833 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1459  bacterioferritin  34.04 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.491219  normal  0.567081 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  28.15 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0908  Ferritin Dps family protein  29.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2579  bacterioferritin  29.93 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0971213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  28.19 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0588  bacterioferritin  26.57 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.865953  normal  0.942884 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2592  bacterioferritin  28.29 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0593549 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0062  Ferritin and Dps  33.91 
 
 		 142 aa  50.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4048  bacterioferritin  32.12 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1837  bacterioferritin  31.25 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.355339  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0605  Ferritin Dps family protein  29.1 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0482  bacterioferritin  28.95 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000422336 
 
 
-
 
NC_002936  DET0955  bacterioferritin domain-containing protein  30.77 
 
 		 275 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0154546  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3342  bacterioferritin  28.57 
 
 		 165 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95444  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0465  bacterioferritin  29.66 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.541924  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4273  bacterioferritin  30.07 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2993  bacterioferritin  27.92 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.720861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3026  bacterioferritin  25.83 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  29.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1070  rubrerythrin  30.61 
 
 		 172 aa  48.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3888  bacterioferritin  29.53 
 
 		 161 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0532893 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0616  bacterioferritin  28.66 
 
 		 161 aa  47.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.250309  normal  0.347955 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0966  bacterioferritin  28.17 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00605271  hitchhiker  0.0000000255708 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1768  bacterioferritin  30.56 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.616192  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0066  Ferritin Dps family protein  29.27 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  32.81 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3626  bacterioferritin  29.2 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.931483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0191  bacterioferritin  28.89 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.492849  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4212  bacterioferritin  28.86 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.106736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1675  Ferritin, Dps family protein  39.71 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0882  bacterioferritin  25.93 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.525786  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3707  bacterioferritin  39.13 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.437251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3139  bacterioferritin  26.71 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.214002  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2930  Ferritin Dps family protein  34.78 
 
 		 156 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00884055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  27.07 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0415  Ferritin Dps family protein  26.95 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.366327 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  25.19 
 
 		 160 aa  44.7  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  26.67 
 
 		 158 aa  44.7  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2125  hypothetical protein  29.63 
 
 		 192 aa  44.3  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.25809  hitchhiker  0.00273266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1932  bacterioferritin  25 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1981  Ferritin Dps family protein  39.39 
 
 		 199 aa  44.3  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0293  Ferritin Dps family protein  36.62 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2087  Ferritin Dps family protein  26.9 
 
 		 169 aa  44.3  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>