More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0754 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  100 
 
 		 268 aa  541  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  79.03 
 
 		 268 aa  436  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  53.33 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  54.84 
 
 		 277 aa  251  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  54.88 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  50.2 
 
 		 272 aa  241  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  48.41 
 
 		 292 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  47.6 
 
 		 270 aa  239  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  46.46 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  46.88 
 
 		 288 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  46.33 
 
 		 290 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  46.33 
 
 		 290 aa  230  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  50.93 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  46.33 
 
 		 290 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  46.25 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  45.95 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  45.95 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  45.95 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  45.95 
 
 		 290 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  49.12 
 
 		 270 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  45.17 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  45.17 
 
 		 285 aa  209  4e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  45.17 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  44.4 
 
 		 287 aa  208  9e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  47.44 
 
 		 271 aa  206  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  44.36 
 
 		 287 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  47.69 
 
 		 271 aa  205  5e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  48.15 
 
 		 275 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  42.34 
 
 		 266 aa  205  7e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  43.09 
 
 		 276 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  47.93 
 
 		 263 aa  202  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  45.78 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  43.88 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  42 
 
 		 260 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  42.75 
 
 		 256 aa  197  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  46.95 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  48.68 
 
 		 286 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  48.61 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  41.2 
 
 		 260 aa  195  6e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  47.22 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  43.08 
 
 		 263 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  45.16 
 
 		 286 aa  192  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  43.78 
 
 		 288 aa  189  5e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  46.79 
 
 		 265 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  43.12 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  43.97 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  40.83 
 
 		 266 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  43.98 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  44.44 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  43.98 
 
 		 265 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  41.74 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  45.87 
 
 		 265 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  47.39 
 
 		 279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  45.45 
 
 		 272 aa  179  4.999999999999999e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  39.39 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  39.39 
 
 		 259 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.1 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  38.81 
 
 		 273 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  39.1 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  39.39 
 
 		 278 aa  175  8e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  38.53 
 
 		 276 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  38.53 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  37.96 
 
 		 271 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  41.98 
 
 		 272 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  38.58 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  40 
 
 		 275 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  40.53 
 
 		 276 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  37.31 
 
 		 281 aa  171  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  39.05 
 
 		 264 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  42.22 
 
 		 296 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0609  glutamate racemase  37.39 
 
 		 291 aa  171  2e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.765975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  39.39 
 
 		 278 aa  169  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.23 
 
 		 259 aa  168  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.4 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  38.04 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  36.8 
 
 		 288 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  42.79 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0126  glutamate racemase  40.27 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000153552  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  39.83 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  43.04 
 
 		 291 aa  165  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  40.59 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  43.04 
 
 		 291 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  36.29 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0179  glutamate racemase  39.11 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000377093  normal  0.781333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0174  glutamate racemase  39.11 
 
 		 272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000222817  normal  0.0305567 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0207  glutamate racemase  38.5 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2249  glutamate racemase  39.82 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.062681  normal  0.257999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  35.93 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0180  glutamate racemase  38.67 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000177762  normal  0.815538 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  35.51 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  35.12 
 
 		 281 aa  161  9e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  33.99 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  35.9 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  34.62 
 
 		 269 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  35.04 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  35.04 
 
 		 269 aa  159  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  37.14 
 
 		 271 aa  158  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3402  glutamate racemase  36.48 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.108965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  35.04 
 
 		 267 aa  158  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>