134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4562 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4562  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  179  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4535  hypothetical protein  98.9 
 
 		 98 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.858749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6564  hypothetical protein  52.17 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6297  hypothetical protein  49.4 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.21149  normal  0.389023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6278  hypothetical protein  50.72 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00531992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3868  hypothetical protein  51.52 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2045  hypothetical protein  53.73 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.928225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2299  hypothetical protein  46.39 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502645  normal  0.300694 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1290  hypothetical protein  49.28 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.434421  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6541  hypothetical protein  49.28 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5510  hypothetical protein  47.83 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.269299 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6075  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69008  normal  0.152537 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1985  hypothetical protein  46.15 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.448564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0401  hypothetical protein  53.23 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0681518 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0406  hypothetical protein  46.38 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1733  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1836  hypothetical protein  46.51 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1967  hypothetical protein  46.38 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.619841  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1876  hypothetical protein  46.38 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.257011  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6148  hypothetical protein  46.38 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137676  normal  0.19662 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3242  hypothetical protein  49.3 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3430  hypothetical protein  55.71 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0092  protein of unknown function DUF305  47.14 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.62579 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6657  protein of unknown function DUF305  51.39 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.50824 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3895  hypothetical protein  42.86 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1535  hypothetical protein  46.97 
 
 		 113 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.619429  normal  0.733742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0261  hypothetical protein  46.05 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.188703  normal  0.0101728 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2666  hypothetical protein  46.05 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5806  hypothetical protein  53.12 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0541  hypothetical protein  46.15 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1508  hypothetical protein  51.47 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000100839  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6904  protein of unknown function DUF305  47.44 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.147564  normal  0.887388 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0461  protein of unknown function DUF305  48.44 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.607138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0506  protein of unknown function DUF305  49.18 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0184859 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0108  protein of unknown function DUF305  46.88 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0926  hypothetical protein  48.33 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1517  hypothetical protein  46.58 
 
 		 263 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0547298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0997  protein of unknown function DUF305  50.82 
 
 		 148 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.495486  normal  0.061691 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6903  protein of unknown function DUF305  38.36 
 
 		 194 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.912049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5398  hypothetical protein  56.36 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2829  hypothetical protein  45.16 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.137612 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6259  hypothetical protein  51.85 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.510981 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1101  protein of unknown function DUF305  45.31 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5736  protein of unknown function DUF305  48.44 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.470482 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3056  protein of unknown function DUF305  46.67 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7165  protein of unknown function DUF305  44.59 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277418  normal  0.663487 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5614  protein of unknown function DUF305  46.38 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6656  protein of unknown function DUF305  50.88 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.817107 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5874  protein of unknown function DUF305  48.28 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3856  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.422416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4933  protein of unknown function DUF305  44.44 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.913389  normal  0.245188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0312  hypothetical protein  48.53 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.153905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0057  hypothetical protein  38.75 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0179  hypothetical protein  46.15 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0473864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2947  protein of unknown function DUF305  43.55 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3796  hypothetical protein  52.94 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4129  protein of unknown function DUF305  44.3 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.933838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4586  hypothetical protein  45 
 
 		 265 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0285  hypothetical protein  50.91 
 
 		 279 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1097  protein of unknown function DUF305  40.54 
 
 		 223 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000215144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0132  protein of unknown function DUF305  50 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6516  protein of unknown function DUF305  35.94 
 
 		 218 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2579  hypothetical protein  37.04 
 
 		 202 aa  53.1  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9856  hypothetical protein  47.46 
 
 		 142 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0815  hypothetical protein  42.11 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3538  protein of unknown function DUF305  36.59 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.396776 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2580  protein of unknown function DUF305  39.74 
 
 		 224 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2536  hypothetical protein  40.96 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.608732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5258  hypothetical protein  48.28 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.355958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1338  hypothetical protein  46.55 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.031335  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0305  hypothetical protein  52.83 
 
 		 192 aa  51.6  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3032  protein of unknown function DUF305  38.75 
 
 		 206 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.709279 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0071  hypothetical protein  44.44 
 
 		 136 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.316359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0315  hypothetical protein  37.18 
 
 		 213 aa  50.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3676  hypothetical protein  35.9 
 
 		 243 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0963625  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0885  protein of unknown function DUF305  34.18 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1610  hypothetical protein  37.21 
 
 		 219 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.506361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3980  hypothetical protein  38.46 
 
 		 207 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3230  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.49 
 
 		 517 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.476229  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1571  conserved hypothetical protein (DUF305 domain protein)  43.33 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5698  hypothetical protein  35.06 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.472111  normal  0.587955 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0174  hypothetical protein  39.06 
 
 		 205 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5311  hypothetical protein  35.06 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.126804  normal  0.734032 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18400  hypothetical protein  37.65 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1099  protein of unknown function DUF305  39.19 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3873  hypothetical protein  42.31 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0357  protein of unknown function DUF305  42.59 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3672  protein of unknown function DUF305  42.86 
 
 		 210 aa  47  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0147  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.404622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4244  protein of unknown function DUF305  42 
 
 		 217 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.827618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2595  protein of unknown function DUF305  42 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.974704  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0156  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.908882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0137  hypothetical protein  37.97 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0732771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4123  hypothetical protein  44.44 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2316  hypothetical protein  39.8 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.865879 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4487  hypothetical protein  35.9 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161376  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2783  hypothetical protein  40 
 
 		 202 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0736  hypothetical protein  38.98 
 
 		 270 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460895  hitchhiker  0.00701181 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2567  hypothetical protein  36.14 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4189  hypothetical protein  44 
 
 		 195 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.314897  normal  0.043987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3974  hypothetical protein  37.1 
 
 		 271 aa  45.1  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>