101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2987 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2987  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  344  5e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.221024  normal  0.129145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3552  OmpA/MotB  59.9 
 
 		 196 aa  174  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237192  normal  0.244916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3940  OmpA/MotB domain-containing protein  57.54 
 
 		 174 aa  164  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0125128  normal  0.230028 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2055  OmpA/MotB domain-containing protein  60.45 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0263919  normal  0.321427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1878  OmpA/MotB domain protein  60.45 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2800  OmpA/MotB domain-containing protein  53.93 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705658  normal  0.415796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  67.5 
 
 		 823 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.9 
 
 		 842 aa  130  9e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3709  OmpA/MotB domain protein  44.69 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 517 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 517 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 517 aa  84.3  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 525 aa  84.3  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 525 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  56.25 
 
 		 525 aa  84.3  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  54.74 
 
 		 525 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1793  OmpA/MotB  38.17 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.557894 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  70.31 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  70.31 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  70.31 
 
 		 532 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  67.69 
 
 		 557 aa  82  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  52.63 
 
 		 538 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  68.75 
 
 		 535 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  68.75 
 
 		 532 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  68.75 
 
 		 535 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  68.75 
 
 		 531 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  55.21 
 
 		 525 aa  80.9  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  52.63 
 
 		 544 aa  78.6  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0102  outer membrane related peptidoglycan-associated lipoprotein  52.08 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207037  normal  0.26967 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.63 
 
 		 560 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  30.3 
 
 		 543 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1725  OmpA/MotB family outer membrane protein  38.32 
 
 		 286 aa  53.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.972471  normal  0.729969 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  29.27 
 
 		 544 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  28.66 
 
 		 542 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1787  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 569 aa  51.6  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  46.38 
 
 		 364 aa  48.9  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3241  OmpA/MotB domain-containing protein  35.85 
 
 		 383 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.809781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2312  OmpA/MotB  35.56 
 
 		 225 aa  48.5  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1412  OmpA/MotB domain-containing protein  30.56 
 
 		 321 aa  48.1  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.166227  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3893  OmpA/MotB  33.01 
 
 		 300 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.369181 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  33.33 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1066  OmpA/MotB  33.65 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  36.94 
 
 		 262 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2763  OmpA/MotB domain-containing protein  39.19 
 
 		 499 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.621533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  33.64 
 
 		 263 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  28.32 
 
 		 373 aa  45.1  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4156  sodium-type flagellar protein MotY, putative  34.67 
 
 		 301 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.37097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1087  OmpA family outer membrane protein  33.33 
 
 		 317 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0287  OmpA/MotB  46.81 
 
 		 513 aa  44.3  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791122 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5618  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.271834  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6202  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 239 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0965154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5982  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.078439  hitchhiker  0.000830094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1128  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4325  OmpA/MotB domain-containing protein  34.31 
 
 		 308 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6475  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.539086  normal  0.133518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08396  OmpA/MotB  27.88 
 
 		 424 aa  43.9  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  32.52 
 
 		 218 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2260  OmpA/MotB  38.46 
 
 		 830 aa  43.5  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  32.41 
 
 		 261 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  33.9 
 
 		 727 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3127  OmpA domain-containing protein  28.36 
 
 		 550 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1116  OmpA/MotB domain-containing protein  35.29 
 
 		 324 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3257  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 576 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  27.56 
 
 		 613 aa  43.5  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0796  OmpA/MotB  35.9 
 
 		 170 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.53166  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7373  OmpA/MotB family outer membrane protein  34.95 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0351523  normal  0.436422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16630  putative outer membrane protein, OmpA  28.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0638477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51710  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  33.33 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000147686  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1446  outer membrane protein  28.71 
 
 		 261 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4535  peptidoglycan associated lipoprotein OprL precursor  33.33 
 
 		 169 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2453  sodium-type flagellar protein MotY, putative  31.17 
 
 		 280 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.230815  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  36.05 
 
 		 330 aa  42.4  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1223  peptidoglycan-associated lipoprotein OprL  31.82 
 
 		 166 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2645  OmpA/MotB  39.06 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4518  OmpA/MotB  30 
 
 		 302 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  32.04 
 
 		 648 aa  42.4  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18720  OmpA family membrane protein  30.3 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.746177  normal  0.130207 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  38.27 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2832  OmpA/MotB domain-containing protein  34.29 
 
 		 512 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  35 
 
 		 487 aa  42  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1252  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.82 
 
 		 166 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0470873  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2746  OmpA family protein  36.63 
 
 		 451 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0862852  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2786  OmpA/MotB  30.37 
 
 		 481 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.187099  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1164  ompA family protein  32.88 
 
 		 229 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.867796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1005  OmpA/MotB  32.88 
 
 		 229 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.558785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  33.78 
 
 		 260 aa  41.6  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0244  outer membrane protein  38.27 
 
 		 331 aa  41.6  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1621  outer membrane protein  30.3 
 
 		 321 aa  41.6  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0517761  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5931  OmpA/MotB domain-containing protein  36.45 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.639892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4195  peptidoglycan-associated lipoprotein  31.06 
 
 		 166 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.678066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.51 
 
 		 170 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  41.2  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4097  OmpA/MotB domain protein  29.63 
 
 		 285 aa  41.2  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.386824  normal  0.160252 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1676  hypothetical protein  32.69 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.223351 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1278  OmpA domain-containing protein  33.01 
 
 		 166 aa  40.8  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0630955  normal  0.378402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 		 356 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2203  ompA family protein  26.79 
 
 		 290 aa  40.8  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.505527  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2674  OmpA/MotB  36.84 
 
 		 169 aa  40.8  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  30.77 
 
 		 498 aa  40.8  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>