More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0136 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  716    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  89.33 
 
 		 328 aa  607  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  60.79 
 
 		 329 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  58.31 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  51.07 
 
 		 330 aa  311  7.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  50.61 
 
 		 329 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  51.97 
 
 		 328 aa  301  1e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  52.81 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  49.39 
 
 		 331 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  48.18 
 
 		 330 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  50 
 
 		 329 aa  285  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  43.6 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  40.58 
 
 		 340 aa  236  3e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  38.28 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  37.8 
 
 		 324 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  36.56 
 
 		 330 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  37.5 
 
 		 324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  36.47 
 
 		 327 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  37.76 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  38.93 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  37.67 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  36.18 
 
 		 328 aa  190  4e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  35.4 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  37.41 
 
 		 329 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  36.72 
 
 		 333 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.17 
 
 		 339 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  35.49 
 
 		 330 aa  187  4e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  35.84 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  34.83 
 
 		 322 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.67 
 
 		 338 aa  182  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  31.95 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  37.24 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  36.05 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4526  twin-arginine translocation pathway signal  34.71 
 
 		 337 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  35.71 
 
 		 333 aa  179  4.999999999999999e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.47 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.54 
 
 		 322 aa  179  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  36.05 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  37.5 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.08 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  32.83 
 
 		 331 aa  176  4e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5315  hypothetical protein  35.76 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.248972  normal  0.736345 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  36.02 
 
 		 331 aa  176  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  35.4 
 
 		 323 aa  176  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  33.84 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  33.45 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  35.03 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3985  hypothetical protein  35.52 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.19648  normal  0.0884631 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  34.14 
 
 		 353 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  34.3 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  35.64 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  34.35 
 
 		 334 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  36.17 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.36 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3986  hypothetical protein  35.52 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.323954  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.32 
 
 		 326 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  32.92 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  32.01 
 
 		 328 aa  170  4e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  33.79 
 
 		 337 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4232  extra-cytoplasmic solute receptor  36.52 
 
 		 314 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.56 
 
 		 334 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  32.72 
 
 		 330 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  33.64 
 
 		 331 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  34.05 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  32.8 
 
 		 341 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  32.54 
 
 		 339 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2823  hypothetical protein  37.63 
 
 		 335 aa  169  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.628668  normal  0.0754293 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3975  hypothetical protein  33.1 
 
 		 336 aa  169  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  32.52 
 
 		 325 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6081  hypothetical protein  33.97 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  32.32 
 
 		 336 aa  169  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.02 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  32.73 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4354  hypothetical protein  31.79 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.110423  normal  0.165755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  34.68 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  33.33 
 
 		 337 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 325 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4314  hypothetical protein  32.65 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.210006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  33.91 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  31.97 
 
 		 327 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  32.88 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  34.05 
 
 		 327 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5388  hypothetical protein  35.45 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  33.91 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3526  hypothetical protein  32.65 
 
 		 371 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  33.79 
 
 		 358 aa  167  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  34.53 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  34.38 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  34.21 
 
 		 324 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3986  hypothetical protein  34.69 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0101  hypothetical protein  33.78 
 
 		 339 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.344081 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  31.97 
 
 		 332 aa  166  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0118  hypothetical protein  33.78 
 
 		 339 aa  166  8e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  32.76 
 
 		 330 aa  166  8e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  34.03 
 
 		 353 aa  166  8e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  34.02 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  35.35 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>