284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0290 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  100 
 
 		 472 aa  942    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  34.33 
 
 		 471 aa  276  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  36.8 
 
 		 625 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  32.77 
 
 		 476 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  33.4 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.74 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.52 
 
 		 460 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.85 
 
 		 552 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  30.85 
 
 		 552 aa  211  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.09 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.68 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  31.36 
 
 		 475 aa  189  8e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  28.75 
 
 		 527 aa  177  3e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  27.31 
 
 		 524 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  27.57 
 
 		 523 aa  154  2e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  27.56 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  26.59 
 
 		 511 aa  151  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0971  oligogalacturonide transporter  26.56 
 
 		 525 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  27.62 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.75 
 
 		 444 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  28.54 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  28.27 
 
 		 467 aa  142  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  27.2 
 
 		 519 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  38.97 
 
 		 544 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.79 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  25.78 
 
 		 459 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2719  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.67 
 
 		 443 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0761738  normal  0.0687051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  26.61 
 
 		 508 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  24.3 
 
 		 467 aa  138  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  26.11 
 
 		 508 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  26.11 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  26.11 
 
 		 508 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2284  putative cation symporter  24 
 
 		 461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974122 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2049  Na+/melibiose symporter and related transporters-like protein  26.85 
 
 		 469 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  0.648168 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  26.12 
 
 		 451 aa  133  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0733  sodium:glactoside symporter family protein  26.68 
 
 		 465 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.958172  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  26.67 
 
 		 455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.71 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2993  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.05 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.624539  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.11 
 
 		 460 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17501  GPH family sugar transporter  26.15 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.276796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  27.55 
 
 		 459 aa  127  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.94 
 
 		 441 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.5 
 
 		 442 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3996  major facilitator transporter  24.2 
 
 		 443 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.14105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.56 
 
 		 441 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3565  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.13 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  27.57 
 
 		 443 aa  124  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1144  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.71 
 
 		 468 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.47 
 
 		 471 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0691  oligogalacturonide transporter  25 
 
 		 508 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0726  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 468 aa  124  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05681  GPH family sugar transporter  25.38 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0926  oligogalacturonide transporter  26.21 
 
 		 508 aa  123  8e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.33 
 
 		 448 aa  123  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4313  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.23 
 
 		 497 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0453293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  26.93 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3872  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.72 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4586  melibiose:sodium symporter  24.56 
 
 		 481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.15 
 
 		 442 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  26.93 
 
 		 460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2622  sugar transporter, glycoside-pentoside-hexuronide  26.64 
 
 		 479 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.455215  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.93 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3365  oligogalacturonide transporter  25.05 
 
 		 508 aa  121  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  26.93 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.83 
 
 		 441 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  26.93 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.4 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  26.93 
 
 		 460 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3907  melibiose:sodium symporter  24.56 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4361  melibiose:sodium symporter  24.56 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  26.93 
 
 		 479 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4674  melibiose:sodium symporter  24.56 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03991  melibiose:sodium symporter  24.72 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03952  hypothetical protein  24.72 
 
 		 469 aa  120  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2697  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.24 
 
 		 465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.296513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22670  Na+/melibiose symporter-like transporter  24.29 
 
 		 453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0388  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.991466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  25.72 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5634  melibiose:sodium symporter  24.78 
 
 		 481 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1070  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 471 aa  119  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  26.93 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  26.93 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02748  cation symporter  24.95 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 486 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.6 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  29.07 
 
 		 442 aa  118  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1026  ribosomal protein L9  25.66 
 
 		 522 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.814155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0020  xylose-proton symporter  25.81 
 
 		 457 aa  118  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000106497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13771  GPH family sugar transporter  25.33 
 
 		 472 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.66133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  31.21 
 
 		 442 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.25 
 
 		 481 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.32 
 
 		 476 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.31 
 
 		 471 aa  117  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  32.95 
 
 		 442 aa  117  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  25.5 
 
 		 454 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  26.61 
 
 		 443 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  22.35 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0070  putative transporter  26.71 
 
 		 464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.602143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>