210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0971 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0971  oligogalacturonide transporter  100 
 
 		 525 aa  1068    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.203407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2444  major facilitator transporter  46.12 
 
 		 527 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0819  oligogalacturonide transporter  46.64 
 
 		 524 aa  502  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0853  major facilitator superfamily MFS_1  47.67 
 
 		 523 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3542  oligogalacturonide transporter  46.81 
 
 		 519 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.578582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3380  oligogalacturonide transporter  46.23 
 
 		 519 aa  478  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2835  putative transport protein  40.94 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3256  oligogalacturonide transporter  42.32 
 
 		 508 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2756  putative transport protein  40.94 
 
 		 508 aa  422  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000301777  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1449  putative transport protein  40.94 
 
 		 508 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0118167  normal  0.558521 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0691  oligogalacturonide transporter  41.83 
 
 		 508 aa  403  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0926  oligogalacturonide transporter  41.25 
 
 		 508 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3365  oligogalacturonide transporter  41.55 
 
 		 508 aa  392  1e-108  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1744  Na-galactoside symporter  32.21 
 
 		 508 aa  273  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0290  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  28.57 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000222424  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3583  galactoside symporter  28.75 
 
 		 475 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1406  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  28.43 
 
 		 471 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.455319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3858  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.36 
 
 		 469 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.784369  normal  0.0678057 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2706  hypothetical protein  29.8 
 
 		 625 aa  148  2.0000000000000003e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.33 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0571  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  26.65 
 
 		 457 aa  140  6e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.74034  normal  0.0218606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3190  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.28 
 
 		 460 aa  136  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2906  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.28 
 
 		 460 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3387  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 475 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0724765 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1592  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26 
 
 		 464 aa  100  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00442608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3697  sugar:cation symporter family protein  23.65 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.455392  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2498  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.47 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358109  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3738  hypothetical protein  25 
 
 		 467 aa  96.7  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00183877  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4954  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.83 
 
 		 463 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843133  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1614  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.69 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0329184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4367  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 493 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0200  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  29.3 
 
 		 544 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5398  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.43 
 
 		 471 aa  90.5  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.243683  normal  0.179969 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1395  hypothetical protein  25.37 
 
 		 443 aa  90.5  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00525698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2155  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.47 
 
 		 471 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00011339  normal  0.022313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1994  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.09 
 
 		 481 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00859833  hitchhiker  0.00113965 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2052  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.13 
 
 		 471 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2505  putative symporter YagG  22.65 
 
 		 442 aa  88.6  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1387  major facilitator superfamily transport protein  23.9 
 
 		 468 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0294045  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3708  sugar:cation symporter family protein  31.7 
 
 		 442 aa  88.2  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0576  GPH family sugar transporter  25.27 
 
 		 455 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2081  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.11 
 
 		 481 aa  87.4  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0834729  hitchhiker  0.000000228967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1702  Na+/melibiose symporter and related transporter protein  25.77 
 
 		 445 aa  87.4  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.574642  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3985  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  25.41 
 
 		 476 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.439786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2608  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.96 
 
 		 442 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1981  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  22.09 
 
 		 481 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00156524  hitchhiker  0.000367008 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3732  sugar:cation symporter family protein  29.36 
 
 		 443 aa  85.5  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.170381  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0776  Zinc finger-domain-containing protein  22.83 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0781581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4415  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  27.9 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1315  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.96 
 
 		 442 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1401  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  27.25 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.738999  normal  0.0455356 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4479  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  26.28 
 
 		 552 aa  84.7  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2602  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  21.43 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.178809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0456  putative symporter YagG  23.33 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0319555 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3335  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.17 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.736057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2816  major facilitator superfamily protein  22.66 
 
 		 459 aa  84.3  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3120  major facilitator transporter  21.89 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.448872  normal  0.243798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002666  galactose permease  24.09 
 
 		 462 aa  82.4  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1146  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  24.73 
 
 		 442 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0701  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.2 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.657348  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0248  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 486 aa  81.3  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.135747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3175  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  23.24 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0664881  normal  0.904255 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3868  putative transporter  24.22 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4161  putative transporter  24.22 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4030  putative transporter  24.63 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4000  putative transporter  24.22 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.947516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4076  putative transporter  24.63 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3967  putative transporter  24.63 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.286007  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1215  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.39 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.525269  normal  0.0570071 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0048  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  24.22 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4108  putative transporter  25.05 
 
 		 479 aa  80.1  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0054  putative transporter  24.22 
 
 		 460 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2992  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.35 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1130  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.56 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1182  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  30.56 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.020658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03515  predicted transporter  24.48 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.371706  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03467  hypothetical protein  24.48 
 
 		 460 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.333065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0353  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 464 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.939472  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3957  putative transporter  24.63 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0936  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.67 
 
 		 478 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5030  putative transporter  24.22 
 
 		 460 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0764  sugar glycoside-pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  24.01 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00819234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0748  sodium:glactoside symporter family protein  23.75 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.329176  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3350  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.11 
 
 		 477 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1245  Na+/xyloside symporter related transporter  25.1 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1691  glucuronide transporter  22.2 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2026  sugar (Glycoside-Pentoside-Hexuronide) transporter  22.2 
 
 		 457 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.232812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2327  glucuronide transporter  21.99 
 
 		 457 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2105  sodium:galactoside symporter family protein  23.15 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.366774  normal  0.477059 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0657  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  23.91 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.242235  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01585  glucuronide transporter  22.2 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01575  hypothetical protein  22.2 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.845658  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8054  Na+/melibiose symporter and related transporter- like protein  22.67 
 
 		 460 aa  76.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1824  glucuronide transporter  21.99 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0781  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.26 
 
 		 474 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0709  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.26 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0195  sugar (glycoside-Pentoside-hexuronide) transporter  25.26 
 
 		 474 aa  75.1  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0477575 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03437  putative permease  26.33 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03388  hypothetical protein  26.33 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0789  glucuronide transporter  26.51 
 
 		 469 aa  74.7  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>