189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1142 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  100 
 
 		 197 aa  391  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  49.2 
 
 		 188 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  45.9 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  47.49 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  51.11 
 
 		 188 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  50.56 
 
 		 188 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  48.11 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  44.92 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  49.18 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  48.62 
 
 		 191 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0530  hypothetical protein  40.31 
 
 		 207 aa  134  7.000000000000001e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  40.31 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  42.41 
 
 		 208 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  41.41 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  39.01 
 
 		 199 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  35.05 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  29.38 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  37.43 
 
 		 534 aa  94.7  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  36.79 
 
 		 575 aa  94  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4015  hypothetical protein  38.95 
 
 		 233 aa  92  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.49 
 
 		 204 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  38.86 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  33.33 
 
 		 214 aa  89.4  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  33.85 
 
 		 216 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  33.5 
 
 		 546 aa  89  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0123  MobA-like protein  39.79 
 
 		 190 aa  88.6  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.14106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  36.02 
 
 		 534 aa  88.6  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.65 
 
 		 534 aa  87.8  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4167  hypothetical protein  37.88 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0348908  normal  0.0855326 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  39.36 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  32.84 
 
 		 455 aa  87.8  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.67 
 
 		 533 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  39.36 
 
 		 194 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0475  MobA-like protein-like protein  37.37 
 
 		 539 aa  86.7  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  32.99 
 
 		 539 aa  86.7  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  37.23 
 
 		 194 aa  86.3  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  32.86 
 
 		 221 aa  85.5  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2831  molybdenum hydroxylase accessory protein, YgfJ family  34.9 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 		 533 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  38.3 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  38.3 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  38.3 
 
 		 194 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  30.05 
 
 		 189 aa  84.7  9e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  34.95 
 
 		 534 aa  84.3  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  42.03 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3911  molybdopterin binding domain-containing protein  36.6 
 
 		 544 aa  84  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0211  hypothetical protein  38.16 
 
 		 346 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0194719  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  43.7 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2648  molybdenum cofactor biosynthesis protein  31.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  36.65 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  29.59 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  38.34 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.68 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  39.68 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2205  hypothetical protein  32.84 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  40 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  35.35 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  36.46 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1788  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  34.21 
 
 		 533 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.148843  normal  0.17866 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  35.05 
 
 		 202 aa  77.4  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  24.74 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1199  hypothetical protein  38.95 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.570343  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1386  purine catabolism protein PucB  42.31 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0889472 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  34.15 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1058  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  37.24 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.134734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0358  hypothetical protein  35.2 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0203  hypothetical protein  31.41 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.761699  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  38.24 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  38.24 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.65 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0836  hypothetical protein  30.16 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  32.81 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2534  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.18 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243799 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  30 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2020  hypothetical protein  32.09 
 
 		 191 aa  72.8  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  35.2 
 
 		 538 aa  72.4  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2037  hypothetical protein  31.68 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0186754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3432  metal dependent phosphohydrolase  29.32 
 
 		 408 aa  72  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1188  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  36.5 
 
 		 197 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.143953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1467  metal-dependent phosphohydrolase HD sub domain protein  28.5 
 
 		 368 aa  72  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700168  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1881  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  71.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  30.15 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  30.81 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  30.81 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.28 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13070  uncharacterized MobA-like protein  32.95 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0865  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.41 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0423814  normal  0.0468502 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  31.94 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1545  metal dependent phosphohydrolase  31.94 
 
 		 393 aa  68.9  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3139  metal dependent phosphohydrolase  32.12 
 
 		 389 aa  68.6  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5193  hypothetical protein  33 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1757  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  35.08 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.79956  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0199  hypothetical protein  35.29 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0182952  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3555  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.919996  normal  0.404 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  30.89 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1816  hypothetical protein  27.84 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  30.93 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1519  hypothetical protein  25.51 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  32.61 
 
 		 187 aa  65.5  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2410  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  33.16 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>