More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0795 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 444 aa  894    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.68 
 
 		 449 aa  510  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 		 448 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.04 
 
 		 471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  41.67 
 
 		 446 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 463 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  34.37 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 445 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 457 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  35.2 
 
 		 445 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  35.89 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  34.57 
 
 		 446 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 448 aa  211  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  34.3 
 
 		 446 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  33.92 
 
 		 446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 442 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  33.64 
 
 		 442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 448 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  29.23 
 
 		 455 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  28.97 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 389 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 419 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 420 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  40.92 
 
 		 381 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31140  sensory histidine protein kinase  41.23 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0370261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  39.86 
 
 		 416 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 454 aa  176  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  36.45 
 
 		 452 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  31.13 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.41 
 
 		 421 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 445 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  30.3 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 449 aa  172  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  30.3 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  33.9 
 
 		 472 aa  168  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.67 
 
 		 465 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00937  sensor histidine kinase  26.5 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000560614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 		 469 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03089  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  40.63 
 
 		 365 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.435396 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  29.04 
 
 		 457 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 		 449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  39.42 
 
 		 480 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 449 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  27.74 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  34.15 
 
 		 449 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  35.57 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  27.85 
 
 		 457 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 429 aa  159  6e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 		 446 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 454 aa  159  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 440 aa  157  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  36.24 
 
 		 446 aa  157  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 458 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  32.79 
 
 		 458 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  35.54 
 
 		 429 aa  156  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  29.81 
 
 		 456 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.86 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2868  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 		 439 aa  155  2e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  30.05 
 
 		 468 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 442 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 449 aa  153  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  31.82 
 
 		 458 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2302  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0020202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1625  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 		 570 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 446 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 455 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 459 aa  150  4e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  34.07 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  28.73 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 457 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  35.56 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 362 aa  147  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0747597 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 563 aa  145  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 446 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  33.11 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  31.83 
 
 		 453 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 446 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  32.42 
 
 		 423 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  25.67 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  33.46 
 
 		 445 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  33.46 
 
 		 445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7490  Signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0318  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 		 554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00056793  hitchhiker  0.000000160297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1563  two-component sensor protein  33.97 
 
 		 462 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0211218  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  31.67 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.08 
 
 		 462 aa  128  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.35 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>