267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1107 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1107  large-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 161 aa  322  1e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.545228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1202  large-conductance mechanosensitive channel  66.89 
 
 		 150 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00425466  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0025  large-conductance mechanosensitive channel  67.11 
 
 		 155 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00280832  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2788  large-conductance mechanosensitive channel  66.44 
 
 		 151 aa  201  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.43697  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1262  large conductance mechanosensitive channel protein  61.49 
 
 		 148 aa  194  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2606  large conductance mechanosensitive channel protein  56.08 
 
 		 148 aa  187  4e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1168  large conductance mechanosensitive channel, MscL family  57.52 
 
 		 157 aa  183  7e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000144587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1197  large-conductance mechanosensitive channel  57.52 
 
 		 154 aa  182  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.932903  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0108  large conductance mechanosensitive channel protein  54.05 
 
 		 156 aa  180  7e-45  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0747555 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0163  large-conductance mechanosensitive channel  49.69 
 
 		 155 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0167  large-conductance mechanosensitive channel  50 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2522  large-conductance mechanosensitive channel  49.32 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515588  normal  0.121482 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2860  large conductance mechanosensitive channel protein  51.01 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3260  large conductance mechanosensitive channel protein  51.01 
 
 		 151 aa  163  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2794  large-conductance mechanosensitive channel  49.66 
 
 		 143 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1671  large conductance mechanosensitive channel protein  48.7 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0394869  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  62.93 
 
 		 144 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.409185  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2389  large-conductance mechanosensitive channel  49.67 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000367491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1689  large conductance mechanosensitive channel protein  55.41 
 
 		 145 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.606027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0532  large conductance mechanosensitive channel protein  42.11 
 
 		 154 aa  150  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0647  large conductance mechanosensitive channel protein  66.67 
 
 		 139 aa  150  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0172  large conductance mechanosensitive channel protein  51.97 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.505473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0387  large conductance mechanosensitive channel protein  47.3 
 
 		 144 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0381  large conductance mechanosensitive channel protein  46.62 
 
 		 144 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0410  large-conductance mechanosensitive channel  51.22 
 
 		 137 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0318  large-conductance mechanosensitive channel  49.61 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.384644  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0334  large-conductance mechanosensitive channel  49.61 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0803754  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0747  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6045  large conductance mechanosensitive channel protein  49.62 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06660  large conductance mechanosensitive channel protein  45.51 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00600968  normal  0.0734515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2607  large conductance mechanosensitive channel protein  52 
 
 		 142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.681771 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0379  large conductance mechanosensitive channel protein  44.22 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0181396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2802  large conductance mechanosensitive channel protein  51.2 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.21352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2579  large conductance mechanosensitive channel protein  51.2 
 
 		 141 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0109  large conductance mechanosensitive channel protein  43.59 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0352  large conductance mechanosensitive channel protein  45.8 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.559193  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2265  large conductance mechanosensitive channel protein  54.78 
 
 		 145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898824  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1288  large conductance mechanosensitive channel protein  43.92 
 
 		 136 aa  125  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2379  large-conductance mechanosensitive channel  45.95 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.567154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3793  large-conductance mechanosensitive channel  44.27 
 
 		 137 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.832034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1501  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.917907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2521  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 199 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.334793  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2079  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.449669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2000  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3310  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00104042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2373  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140991  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2415  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1272  large-conductance mechanosensitive channel  47.58 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.404097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41090  large-conductance mechanosensitive channel  52.46 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.629414  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4693  large-conductance mechanosensitive channel  49.22 
 
 		 138 aa  124  6e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4639  large-conductance mechanosensitive channel  48.67 
 
 		 139 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1626  large conductance mechanosensitive channel protein  51.22 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000392194  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2005  large conductance mechanosensitive channel protein  42.21 
 
 		 147 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.323319  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0724  large-conductance mechanosensitive channel  45.27 
 
 		 146 aa  123  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3035  large conductance mechanosensitive channel protein  52.63 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4645  large-conductance mechanosensitive channel  48 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.51742 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3971  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3789  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4276  large-conductance mechanosensitive channel  51.52 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.348387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1928  large-conductance mechanosensitive channel  48.41 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.425698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3845  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0292  large-conductance mechanosensitive channel  47.15 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0480  large-conductance mechanosensitive channel  45.24 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3972  large-conductance mechanosensitive channel  43.51 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0532201  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1750  large conductance mechanosensitive channel protein  48.36 
 
 		 133 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61050  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 137 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4641  large conductance mechanosensitive channel protein  45.91 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5255  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 137 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.861371  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0037  large-conductance mechanosensitive channel  46.02 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4507  large-conductance mechanosensitive channel  47.33 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5262  large-conductance mechanosensitive channel  45.04 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0455479  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2443  large-conductance mechanosensitive channel  47.66 
 
 		 146 aa  120  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.582665 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0820  large-conductance mechanosensitive channel  46.34 
 
 		 151 aa  120  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.577469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1242  large conductance mechanosensitive channel protein  53.51 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000335343  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3722  large-conductance mechanosensitive channel  41.78 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.459106  hitchhiker  0.00604869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0435  large conductance mechanosensitive channel protein  41.26 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0611  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0263138  normal  0.217178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4887  large-conductance mechanosensitive channel  51.61 
 
 		 154 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1975  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0443039 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6128  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.316261  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0089  large conductance mechanosensitive channel protein  47.97 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1938  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3886  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 137 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00283568  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0312  large-conductance mechanosensitive channel  45.86 
 
 		 134 aa  120  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.929299  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1951  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1381  large conductance mechanosensitive channel protein  47.58 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1865  large-conductance mechanosensitive channel  46.77 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.568071  hitchhiker  0.00372648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03141  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0423  large conductance mechanosensitive channel protein  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3774  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0382022  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0423  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.465174  hitchhiker  0.0000168159 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3586  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515412  normal  0.131611 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0751  large-conductance mechanosensitive channel  52.25 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4613  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000924287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3677  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3484  large-conductance mechanosensitive channel  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.175922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0521  large-conductance mechanosensitive channel  45.97 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0520  large-conductance mechanosensitive channel  45.97 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0788  large-conductance mechanosensitive channel  52.25 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.112062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03092  hypothetical protein  40.69 
 
 		 136 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>