49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3517 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5265  putative methylase/helicase  43.79 
 
 		 1412 aa  990    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2494  putative methylase/helicase  51.99 
 
 		 1529 aa  1487    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.207281 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6191  putative methylase/helicase  61.24 
 
 		 1463 aa  1744    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.255382  hitchhiker  0.00747336 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3921  hypothetical protein  43.89 
 
 		 1425 aa  1047    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2784  putative methylase/helicase  80.69 
 
 		 1440 aa  2303    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.847517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1475  putative methylase/helicase  74.1 
 
 		 1435 aa  2122    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3334  putative methylase/helicase  69.81 
 
 		 1437 aa  1939    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0476558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7413  putative methylase/helicase  78.52 
 
 		 1444 aa  2232    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.741196  normal  0.925564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7717  putative methylase/helicase  75.58 
 
 		 1474 aa  2171    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.256661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2128  methylase/helicase  75.93 
 
 		 1446 aa  2174    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3174  methylase/helicase  77.2 
 
 		 1451 aa  2232    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3065  probably methylase/helicase  79.06 
 
 		 1448 aa  2224    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1218  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1439 aa  2903    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3517  putative methylase/helicase  100 
 
 		 1439 aa  2903    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.646689  normal  0.782963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0720  putative methylase/helicase  79.62 
 
 		 1440 aa  2291    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.649111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3026  methylase/helicase  79.21 
 
 		 1447 aa  2234    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5206  putative methylase/helicase  46.89 
 
 		 1414 aa  1134    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5352  methylase/helicase  46.58 
 
 		 1421 aa  1097    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.686845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1533  methylase/helicase  79.5 
 
 		 1440 aa  2271    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0293999 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3828  methylase/helicase  75.89 
 
 		 1449 aa  2154    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0535  methylase/helicase  77.25 
 
 		 1444 aa  2200    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3850  putative methylase/helicase  52.39 
 
 		 1536 aa  1484    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.829414 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5567  probably methylase/helicase  56.05 
 
 		 1458 aa  1479    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.368773  normal  0.186844 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4223  putative methylase/helicase  65.37 
 
 		 896 aa  1146    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.233912  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4155  putative methylase/helicase  62.22 
 
 		 1498 aa  1762    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2652  methylase/helicase  65.77 
 
 		 1396 aa  1800    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0582946 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0108  hypothetical protein  49.12 
 
 		 1440 aa  1327    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0377  putative methylase/helicase  65.18 
 
 		 1459 aa  1816    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.27856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3919  methylase/helicase  73.67 
 
 		 1459 aa  2091    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3566  methylase/helicase  73.07 
 
 		 1455 aa  2077    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2208  putative methylase/helicase  45.36 
 
 		 1413 aa  1070    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4008  putative methylase/helicase  46.57 
 
 		 836 aa  602  1e-170  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.621017  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3699  putative methylase/helicase  46 
 
 		 836 aa  591  1e-167  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0441  putative methylase/helicase  43.23 
 
 		 824 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.683443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4601  putative methylase/helicase  53.58 
 
 		 684 aa  569  1e-160  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0437  putative methylase/helicase  47.76 
 
 		 611 aa  512  1e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3082  hypothetical protein  67.25 
 
 		 515 aa  493  9.999999999999999e-139  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4003  hypothetical protein  43.11 
 
 		 623 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3694  hypothetical protein  42.83 
 
 		 623 aa  405  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.228295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40550  predicted protein  35.31 
 
 		 950 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30868  predicted protein  31.65 
 
 		 1487 aa  191  8e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.186936  normal  0.423198 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4470  hypothetical protein  67.05 
 
 		 397 aa  130  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0597  helicase  62.96 
 
 		 137 aa  80.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.952522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0003  helicase. putatve  21.89 
 
 		 2133 aa  74.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5392  helicase domain protein  23.9 
 
 		 2123 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3582  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  33.51 
 
 		 254 aa  70.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  28.34 
 
 		 557 aa  47  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0032  hypothetical protein  31.65 
 
 		 187 aa  46.6  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0058  hypothetical protein  31.65 
 
 		 187 aa  45.8  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.546148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>