More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1988 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  100 
 
 		 196 aa  398  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  48.95 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  44.39 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  45.74 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  43.68 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2185  hypothetical protein  46.11 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  42.49 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0892  YceI family protein  46.67 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.228936  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  41.42 
 
 		 212 aa  155  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1047  YceI  47.37 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.151047 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  44 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1401  YceI family protein  49.7 
 
 		 190 aa  154  6e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.845742 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01052  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.772796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2590  YceI family protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.549032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01060  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.880778  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2272  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1435  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.383161  normal  0.170982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2074  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.598885  normal  0.498469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  42.86 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2216  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933696  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2544  hypothetical protein  46.74 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.162419  normal  0.478359 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1179  hypothetical protein  46.74 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.537467  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2032  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1224  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.984654  normal  0.418516 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1268  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  152  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1178  hypothetical protein  47.28 
 
 		 191 aa  153  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1570  hypothetical protein  44.79 
 
 		 192 aa  151  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.599107 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  43.45 
 
 		 237 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1931  hypothetical protein  43.59 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1821  hypothetical protein  43.59 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2224  hypothetical protein  43.59 
 
 		 192 aa  151  7e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0021514  hitchhiker  0.00838786 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  43.45 
 
 		 237 aa  150  8e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1253  hypothetical protein  46.74 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.845086 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  42.29 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0359  YceI family protein  46.11 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  43.17 
 
 		 207 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  42.25 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  41.05 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1609  YceI family protein  45.45 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0484  hypothetical protein  50 
 
 		 192 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.611751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5030  hypothetical protein  49.36 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  44.26 
 
 		 191 aa  145  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  43.75 
 
 		 191 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03910  YceI like family  44.19 
 
 		 254 aa  144  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4981  hypothetical protein  48.08 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.94461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0457  hypothetical protein  46.07 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4854  hypothetical protein  48.08 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.393068  normal  0.0523451 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  41.71 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  41.11 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5071  YceI-like family protein  45.51 
 
 		 192 aa  141  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  44.15 
 
 		 179 aa  141  6e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03250  YceI-like protein  44.38 
 
 		 192 aa  140  9e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  42.93 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2518  hypothetical protein  43.27 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0765  YceI family protein  42.86 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  38.55 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  40.91 
 
 		 193 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  38.58 
 
 		 205 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2823  hypothetical protein  42.11 
 
 		 192 aa  137  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  39.46 
 
 		 207 aa  136  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5284  hypothetical protein  41.84 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.547725  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  40.11 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  41.14 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  41.18 
 
 		 216 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  42 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  40.32 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  41.76 
 
 		 211 aa  130  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  40 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  39.05 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1739  hypothetical protein  43.23 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000033243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  40.7 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1314  hypothetical protein  44.52 
 
 		 198 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0185349  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  36.87 
 
 		 192 aa  128  5.0000000000000004e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2233  YceI family protein  38.86 
 
 		 199 aa  128  6e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.329585  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  42.05 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  37.82 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  40.91 
 
 		 182 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  38.12 
 
 		 183 aa  127  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  37.93 
 
 		 205 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1178  hypothetical protein  37.82 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000879388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1249  hypothetical protein  38.95 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00199018  normal  0.506862 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1179  hypothetical protein  37.82 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000115477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  37.93 
 
 		 206 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1680  YceI family protein  37.76 
 
 		 200 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  36.73 
 
 		 196 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  37.57 
 
 		 183 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  38.73 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2702  hypothetical protein  37.82 
 
 		 191 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.120827  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  41.44 
 
 		 182 aa  125  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03828  YceI  41.28 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  37.76 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3041  hypothetical protein  37.31 
 
 		 191 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000749458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  41.04 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  36.87 
 
 		 196 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  37.64 
 
 		 183 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3198  hypothetical protein  37.31 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  normal  0.576975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1323  hypothetical protein  37.31 
 
 		 191 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00141701  normal  0.012746 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  40.23 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  40.23 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>