More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1685 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  100 
 
 
269 aa  550  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0895373 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1741  enoyl-CoA hydratase  60.61 
 
 
265 aa  338  5.9999999999999996e-92  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0980296  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1685  enoyl-CoA hydratase/isomerase  66.79 
 
 
268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1906  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  63.53 
 
 
268 aa  322  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.177848  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3608  enoyl-CoA hydratase/isomerase  64.44 
 
 
268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610166  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7120  enoyl-CoA hydratase  63.02 
 
 
268 aa  308  6.999999999999999e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1012  enoyl-CoA hydratase  59.3 
 
 
264 aa  296  2e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0558214 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0995  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.92 
 
 
263 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.02 
 
 
262 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  46.35 
 
 
290 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.37 
 
 
259 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1852  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
292 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.178137  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0802  enoyl-CoA hydratase  43.85 
 
 
265 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  40.46 
 
 
265 aa  185  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1271  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
259 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1254  enoyl-CoA hydratase  46.12 
 
 
259 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497005  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1281  enoyl-CoA hydratase  45.71 
 
 
259 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0436813  normal  0.258373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11500  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.708034  normal  0.0989201 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4817  enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.44 
 
 
259 aa  182  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0238476 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2129  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.13 
 
 
255 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.135513  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2741  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 
276 aa  176  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.411296 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2482  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
277 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.847026  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2445  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2490  enoyl-CoA hydratase  38.95 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.154881  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3671  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.55 
 
 
270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.222847  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1879  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.112004 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0290  enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
267 aa  171  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.926213  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
261 aa  169  5e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  37.88 
 
 
266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
263 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
263 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1945  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
259 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.888371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1899  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
259 aa  162  6e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.920346  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3669  enoyl-CoA hydratase  41.2 
 
 
243 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.517909  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0337  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  36.23 
 
 
659 aa  161  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.598683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5520  enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
275 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181326 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2902  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
262 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.678896  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
259 aa  158  7e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
259 aa  156  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.360311  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 
263 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.35 
 
 
264 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.02 
 
 
259 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
277 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  36.43 
 
 
262 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
260 aa  152  4e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  34.22 
 
 
263 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0541  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding  37.5 
 
 
661 aa  151  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.000690617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
266 aa  150  2e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05310  enoyl-CoA hydratase/isomerase PhaB  37.65 
 
 
261 aa  150  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.344632  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3593  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.55 
 
 
264 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.127236  normal  0.0102117 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4886  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.51 
 
 
269 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  34.7 
 
 
265 aa  149  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
263 aa  149  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  35.32 
 
 
261 aa  149  7e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2692  enoyl-CoA hydratase  37.11 
 
 
270 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.191867  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1434  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  33.71 
 
 
662 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0508311  normal  0.0451179 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5501  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
264 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.85 
 
 
260 aa  145  6e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2207  enoyl-CoA hydratase  34.56 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00130556  hitchhiker  0.0060069 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2251  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.21 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1481  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1579  enoyl-CoA hydratase  35.21 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.34 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
273 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0841  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  35.23 
 
 
662 aa  144  1e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.21 
 
 
262 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.81 
 
 
260 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0453  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  34.85 
 
 
662 aa  143  3e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.840152  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  33.96 
 
 
263 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1395  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.6 
 
 
261 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  32.97 
 
 
296 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
257 aa  142  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1703  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.94 
 
 
260 aa  142  5e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0644  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.84 
 
 
260 aa  142  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  35.58 
 
 
291 aa  142  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.6 
 
 
268 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  34.59 
 
 
262 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  35.74 
 
 
260 aa  141  9e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.72 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.47 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0371  enoyl-CoA hydratase  33.33 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000104919  unclonable  0.0000000309848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0654  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.74 
 
 
263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1488  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
257 aa  139  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.5 
 
 
258 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4016  enoyl-CoA hydratase  35.04 
 
 
283 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.7 
 
 
274 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2097  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
257 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00356109  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1079  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  35.23 
 
 
256 aa  139  6e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.209168 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2682  enoyl-CoA hydratase  35.93 
 
 
278 aa  139  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.189349  normal  0.255718 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2136  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
260 aa  139  7e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.259318  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  35.09 
 
 
263 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>