105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1833 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1833  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  100 
 
 		 243 aa  485  1e-136  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.36996 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2951  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  37.44 
 
 		 206 aa  141  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1495  hypothetical protein  36.29 
 
 		 234 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1438  hypothetical protein  34.98 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2267  hypothetical protein  32.33 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.311902 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1413  hypothetical protein  36.14 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0598562  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3050  hypothetical protein  32.9 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2731  hypothetical protein  34.07 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1628  hypothetical protein  33.63 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00936248 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2748  hypothetical protein  33.48 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.668199  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2824  hypothetical protein  33.48 
 
 		 245 aa  102  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2426  hypothetical protein  31.94 
 
 		 221 aa  102  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3437  hypothetical protein  38.69 
 
 		 203 aa  98.6  8e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.631868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2512  hypothetical protein  29.95 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721906  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2225  hypothetical protein  36.8 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02165  isoquinoline 1-oxidoreductase maturation factor  28.62 
 
 		 289 aa  82  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.892695  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0279  hypothetical protein  30.84 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2641  MobA-related protein  25.93 
 
 		 394 aa  75.5  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1481  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.1 
 
 		 538 aa  66.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.475919  hitchhiker  0.00908696 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0236  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  24.76 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.892544  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2139  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.48 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2003  MobA-like protein-like  25.83 
 
 		 455 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000020239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2761  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.58 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2187  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  27.03 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4136  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00743019 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1700  hypothetical protein  30.29 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.361045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5190  MobA-like protein-like protein  30.77 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.802275  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2955  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.91 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0118  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.27 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.176077  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0710  hypothetical protein  26.83 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107525 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2712  MobA-like protein-like  26.76 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0886  hypothetical protein  29 
 
 		 187 aa  58.5  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1433  hypothetical protein  29.37 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.238729  normal  0.170444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61110  hypothetical protein  27.94 
 
 		 192 aa  57  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2658  hypothetical protein  27.67 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0421379  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3932  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  24.65 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.123559  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2140  molybdenum cofactor biosynthesis protein  26.7 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0124  hypothetical protein  27.36 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.362943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2601  molybdopterin binding domain-containing protein  26.85 
 
 		 534 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.205872  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0611  MobA-like protein-like protein  25.37 
 
 		 187 aa  55.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.819429  normal  0.87026 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1294  molybdopterin molybdochelatase / molybdenum cofactor cytidylyltransferase  29.05 
 
 		 538 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.572199  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1142  MobA-like protein-like protein  25.59 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.484774 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2901  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  26.51 
 
 		 202 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.150492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5992  hypothetical protein  31.37 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.361176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3554  hypothetical protein  28.21 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.704282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2921  hypothetical protein  25.81 
 
 		 216 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.627898 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2390  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.95 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.905629 
 
 
-
 
NC_003296  RS05439  hypothetical protein  25.59 
 
 		 199 aa  52.4  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232404  normal  0.0351098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5312  molybdenum cofactor cytidylyltransferase / molybdopterin molybdochelatase  26.57 
 
 		 534 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.664625 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0825  MobA-like protein-like protein  32.48 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00207801  normal  0.0863561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4563  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  24.88 
 
 		 575 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2617  hypothetical protein  24.53 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2227  hypothetical protein  32.48 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1573  hypothetical protein  30.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0210508  normal  0.559729 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4656  hypothetical protein  26.89 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.720744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1745  hypothetical protein  27.92 
 
 		 185 aa  51.2  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1630  hypothetical protein  26.48 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.670304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1224  MobA-like protein-like protein  22.52 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.607114  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0055  hypothetical protein  25.24 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.447473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2771  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D- erythritolsynthas e  25.62 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2928  hypothetical protein  25.69 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.796136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0971  hypothetical protein  24.32 
 
 		 546 aa  49.3  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.84805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5429  hypothetical protein  24.54 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0659  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  23.41 
 
 		 208 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1686  hypothetical protein  26.21 
 
 		 195 aa  48.9  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2199  molybdopterin binding protein  29.01 
 
 		 534 aa  48.5  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3554  uncharacterized MobA-related protein  31.9 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4813  uncharacterized MobA-related protein  31.9 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.913909 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5262  hypothetical protein  30.43 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5470  uncharacterized MobA-related protein  31.9 
 
 		 194 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0663776 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1415  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  29.27 
 
 		 204 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2489  hypothetical protein  25.6 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.152259  normal  0.0142288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1637  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  27.64 
 
 		 534 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.545096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0921  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A-like protein  27.01 
 
 		 200 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.370175  normal  0.499649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4204  MobA-like protein-like protein  24.51 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212178  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4802  hypothetical protein  25.71 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.394051  normal  0.300169 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0201  hypothetical protein  27.27 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.741251  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3725  hypothetical protein  25.71 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1568  molybdenum cofactor cytidylyltransferase  25.12 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0328767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3790  uncharacterized MobA-related protein  31.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0141357 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2695  hypothetical protein  26.09 
 
 		 202 aa  46.6  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0332984  normal  0.676262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4726  hypothetical protein  27.8 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.048995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2483  hypothetical protein  24.09 
 
 		 199 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4019  hypothetical protein  31.62 
 
 		 194 aa  45.4  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0410736 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4718  uncharacterized MobA-related protein-like protein  28.95 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.819957 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1079  molybdopterin biosynthesis enzyme  26.17 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0104  hypothetical protein  26.79 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.808072 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4230  hypothetical protein  26.94 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2392  hypothetical protein  24.3 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.831976 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0890  uncharacterized MobA-related protein  25.37 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.28742  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3672  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.49 
 
 		 533 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4195  MobA-like protein-like protein  28.95 
 
 		 194 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3796  hypothetical protein  26.2 
 
 		 185 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.328726  normal  0.349027 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1380  metal dependent phosphohydrolase  25.6 
 
 		 367 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1894  hypothetical protein  24.75 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1707  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.34 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1620  molybdopterin-guanine dinucleotide biosynthesis protein A  26.34 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1634  MobA-like protein  26.94 
 
 		 188 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4320  4-diphosphocytidyl-2C-methyl-D-erythritol synthase  25.57 
 
 		 533 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2928  hypothetical protein  29.33 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>