More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2482 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2536  copper-exporting ATPase  45.23 
 
 
795 aa  735    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0679  E1-E2 ATPase-associated domain protein  45.21 
 
 
797 aa  698    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.203098  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2482  Copper-exporting ATPase  100 
 
 
799 aa  1647    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.113169  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3569  ATPase, P-type (transporting), HAD superfamily, subfamily IC  46.02 
 
 
804 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.532443 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1133  Cu(I)-translocating P-type ATPase  42.11 
 
 
799 aa  658    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.710134  normal  0.817689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5325  Copper-exporting ATPase  43.55 
 
 
823 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0185531  normal  0.215692 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2068  heavy metal translocating P-type ATPase  28.32 
 
 
791 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2011  heavy metal translocating P-type ATPase  27.5 
 
 
803 aa  305  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000954051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2112  heavy metal translocating P-type ATPase  26.91 
 
 
803 aa  300  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.237749  normal  0.362751 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1964  heavy metal translocating P-type ATPase  27.03 
 
 
803 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0125075 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1048  cation transporter E1-E2 family ATPase  27.17 
 
 
790 aa  298  2e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.582758  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1842  heavy metal translocating P-type ATPase  30.53 
 
 
732 aa  297  6e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21425  normal  0.57874 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02060  copper-translocating P-type ATPase  26.91 
 
 
796 aa  292  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.600497  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0164  heavy metal translocating P-type ATPase  25.59 
 
 
846 aa  290  6e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.914587 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1796  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.48 
 
 
795 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.135451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1790  heavy metal translocating P-type ATPase  27.08 
 
 
815 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003472  copper-translocating P-type ATPase  27.18 
 
 
787 aa  288  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.154282  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1819  heavy metal translocating P-type ATPase  26.38 
 
 
806 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.543484  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1960  heavy metal translocating P-type ATPase  25.3 
 
 
828 aa  286  1.0000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2359  cation transporter E1-E2 family ATPase  26.22 
 
 
799 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  26.29 
 
 
794 aa  283  9e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02298  cation transport ATPase  26.89 
 
 
787 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1450  heavy metal translocating P-type ATPase  27.6 
 
 
792 aa  281  5e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0366901  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  27.15 
 
 
839 aa  279  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2015  heavy metal translocating P-type ATPase  27.26 
 
 
797 aa  277  6e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.467794  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  24.21 
 
 
838 aa  276  8e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2215  heavy metal translocating P-type ATPase  25.31 
 
 
799 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.948139  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2360  heavy metal translocating P-type ATPase  27.12 
 
 
818 aa  276  9e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2206  heavy metal translocating P-type ATPase  25.06 
 
 
799 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.107808  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0934  heavy metal translocating P-type ATPase  26.83 
 
 
802 aa  275  2.0000000000000002e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701132  normal  0.512838 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1990  heavy metal translocating P-type ATPase  26.47 
 
 
807 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4492  hypothetical protein  25.06 
 
 
799 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2165  heavy metal translocating P-type ATPase  25.19 
 
 
799 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0742745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2416  cation transport ATPase  26.37 
 
 
794 aa  275  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2216  heavy metal translocating P-type ATPase  26.48 
 
 
792 aa  275  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2219  heavy metal translocating P-type ATPase  25.31 
 
 
799 aa  273  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000412933  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1954  heavy metal translocating P-type ATPase  26.22 
 
 
799 aa  271  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2043  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.95 
 
 
849 aa  272  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1576  heavy metal translocating P-type ATPase  26.17 
 
 
807 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3851  heavy metal translocating P-type ATPase  30.59 
 
 
731 aa  270  1e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1172  heavy metal translocating P-type ATPase  27.16 
 
 
783 aa  270  1e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1874  heavy metal translocating P-type ATPase  26.41 
 
 
819 aa  269  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.439106  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0540  heavy metal translocating P-type ATPase  29.43 
 
 
737 aa  269  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0576  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.88 
 
 
817 aa  269  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.176053  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1526  heavy metal translocating P-type ATPase  28.39 
 
 
738 aa  268  2.9999999999999995e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0573  heavy metal translocating P-type ATPase  27.03 
 
 
783 aa  268  2.9999999999999995e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113758  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0635  heavy metal translocating P-type ATPase  26.3 
 
 
806 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1846  heavy metal translocating P-type ATPase  26.17 
 
 
813 aa  268  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.418126  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1116  copper-translocating P-type ATPase  25.25 
 
 
793 aa  267  5.999999999999999e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0451  heavy metal translocating P-type ATPase  27.6 
 
 
811 aa  266  8.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0831309  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1291  heavy metal translocating P-type ATPase  27.16 
 
 
783 aa  266  1e-69  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  25.62 
 
 
834 aa  266  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2420  heavy metal translocating P-type ATPase  27.18 
 
 
792 aa  266  1e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000019165  hitchhiker  0.00000435833 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1990  copper-translocating P-type ATPase  23.47 
 
 
820 aa  265  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0465  heavy metal translocating P-type ATPase  27.99 
 
 
743 aa  265  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0752433  normal  0.273207 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0472  heavy metal translocating P-type ATPase  26.99 
 
 
781 aa  265  4e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0667  nitrogen fixation protein fixI  28.8 
 
 
729 aa  263  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5022  heavy metal translocating P-type ATPase  28.74 
 
 
762 aa  263  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29502  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2538  heavy metal translocating P-type ATPase  28.29 
 
 
727 aa  263  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3783  copper-translocating P-type ATPase  26.1 
 
 
811 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413939  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2345  heavy metal translocating P-type ATPase  29.1 
 
 
737 aa  261  4e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.289685  normal  0.231434 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3046  heavy metal translocating P-type ATPase  26.04 
 
 
806 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1568  putative cation-transporting ATPase  25.94 
 
 
791 aa  259  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.758768  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0463  copper-translocating P-type ATPase  29.18 
 
 
752 aa  259  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4956  heavy metal translocating P-type ATPase  28.63 
 
 
761 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00130227  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0267  copper-translocating P-type ATPase  25.95 
 
 
797 aa  258  3e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.594062  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0690  copper-translocating P-type ATPase, RdxI  28.71 
 
 
737 aa  258  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.247145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44440  putative cation-transporting P-type ATPase  25.92 
 
 
811 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.838322  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1420  copper-translocating P-type ATPase  26.26 
 
 
789 aa  258  3e-67  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2255  heavy metal translocating P-type ATPase  28.79 
 
 
746 aa  258  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.980827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2046  heavy metal translocating P-type ATPase  25.9 
 
 
861 aa  257  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504527  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  25.43 
 
 
806 aa  257  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  25.15 
 
 
812 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_004310  BR0357  nitrogen fixation protein FixI, putative  28.57 
 
 
752 aa  253  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1369  heavy metal translocating P-type ATPase  26.11 
 
 
814 aa  253  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3324  copper-translocating P-type ATPase  26.26 
 
 
809 aa  251  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2479  putative cation transport P-type ATPase  27.86 
 
 
765 aa  251  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.354353  normal  0.180774 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0009  copper-translocating P-type ATPase  26.73 
 
 
735 aa  251  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1875  heavy metal translocating P-type ATPase  24.85 
 
 
826 aa  250  7e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.796141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1274  cation-transporting ATPase lipoprotein transmembrane  25.15 
 
 
851 aa  250  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3421  copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  26.66 
 
 
824 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0860043 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2081  heavy metal translocating P-type ATPase  26.09 
 
 
808 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0785584  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5920  copper-translocating P-type ATPase  28.28 
 
 
755 aa  247  6e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.509848 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3784  heavy metal translocating P-type ATPase  26.66 
 
 
775 aa  247  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0161451  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0014  copper-translocating P-type ATPase  27.36 
 
 
732 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.190643  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0736  copper-translocating P-type ATPase  26.3 
 
 
731 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1365  heavy metal translocating P-type ATPase  26.86 
 
 
810 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.576345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1155  heavy metal translocating P-type ATPase  27.56 
 
 
728 aa  243  7.999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.302273  normal  0.0837932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1607  heavy metal translocating P-type ATPase  26.23 
 
 
824 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.183906  normal  0.0233029 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2773  heavy metal translocating P-type ATPase  25.45 
 
 
824 aa  241  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0011  heavy metal translocating P-type ATPase  26.5 
 
 
731 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.399414  normal  0.898775 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1816  copper-translocating P-type ATPase  26.6 
 
 
816 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4261  heavy metal translocating P-type ATPase  26.35 
 
 
882 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2816  heavy metal translocating P-type ATPase  25.31 
 
 
777 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102701  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1195  heavy metal translocating P-type ATPase  23.84 
 
 
847 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2610  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 
802 aa  237  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.116821  normal  0.696286 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6713  copper-translocating P-type ATPase  27.35 
 
 
758 aa  237  6e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3826  heavy metal translocating P-type ATPase  26.11 
 
 
824 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7463  copper-translocating P-type ATPase  27.85 
 
 
758 aa  237  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2797  nitrogen fixation protein fixI  26.23 
 
 
733 aa  235  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350165  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>