86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3569 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  440  1e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  45.23 
 
 		 247 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  42.5 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  38.94 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 233 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  38.46 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  38.94 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  38.94 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  38.94 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  37.93 
 
 		 192 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  34.74 
 
 		 211 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  36.19 
 
 		 464 aa  112  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  37.5 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.99 
 
 		 201 aa  107  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.12 
 
 		 465 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  36.23 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  32.06 
 
 		 197 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  31.86 
 
 		 201 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  30.39 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  30.39 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.19 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.19 
 
 		 491 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  34.82 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.26 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.11 
 
 		 497 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  29.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  29.9 
 
 		 221 aa  79.7  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.4 
 
 		 477 aa  79  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  29.41 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  36.27 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.17 
 
 		 486 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.25 
 
 		 491 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  39.47 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  35.85 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 459 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  35.85 
 
 		 455 aa  77  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  28.64 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  34.91 
 
 		 458 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.91 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.91 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.91 
 
 		 456 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.91 
 
 		 455 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.91 
 
 		 455 aa  75.1  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  34.91 
 
 		 455 aa  74.7  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.91 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.91 
 
 		 455 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.41 
 
 		 481 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.77 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  38.38 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  32.71 
 
 		 456 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  29.45 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.54 
 
 		 471 aa  68.2  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.21 
 
 		 481 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.04 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.73 
 
 		 481 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 307 aa  65.1  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.73 
 
 		 481 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.73 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.73 
 
 		 481 aa  63.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  35.14 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  32.73 
 
 		 359 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.68 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.01 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.17 
 
 		 491 aa  58.2  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  26.62 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.59 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  29.2 
 
 		 388 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  29.2 
 
 		 389 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.83 
 
 		 473 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  30.28 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  26.67 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  27.83 
 
 		 393 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  30 
 
 		 389 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  23.78 
 
 		 378 aa  48.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  31.18 
 
 		 390 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  29.46 
 
 		 438 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  24.68 
 
 		 443 aa  45.4  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  27.27 
 
 		 306 aa  45.1  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  29.09 
 
 		 429 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  30.09 
 
 		 391 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>