More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2669 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2669  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 476 aa  959    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250088 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2910  regulatory protein, GntR  46.65 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.779971  normal  0.0177788 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1831  transcriptional regulator  50 
 
 		 482 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3037  transcriptional regulator, putative  47.94 
 
 		 468 aa  387  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00850156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2975  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 448 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.23319  normal  0.0575809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2860  GntR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 451 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2953  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 450 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0756027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2829  GntR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4612  aminotransferase  25.43 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2744  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27 
 
 		 483 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003147  GntR-family regulatory protein  26.08 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00323958  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1524  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain protein  27.84 
 
 		 483 aa  137  4e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.790712  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2257  putative transcriptional regulator  25.48 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1725  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.809338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0803  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.72 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.284256  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26590  GntR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 479 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.079349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4810  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.9 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0244404  hitchhiker  0.0000000000137556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3154  GntR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 469 aa  134  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5854  transcriptional regulator, GntR family/aminotransferase, classes I and II  27.68 
 
 		 470 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.491083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1184  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.78 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.823264 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3723  transcriptional regulator  27.46 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0850  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.16 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2226  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.62 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.47 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1425  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  25.55 
 
 		 472 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1450  GntR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00080879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3375  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.4 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2858  transcriptional regulator  28.3 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.640766 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6695  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.65 
 
 		 461 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4568  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4886  GntR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.344602  normal  0.838171 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01894  hypothetical protein  24.95 
 
 		 463 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2520  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.36 
 
 		 473 aa  130  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0126986  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3656  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.13 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4112  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282871 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3572  transcriptional regulator  27.16 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.529399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3448  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4761  aminotransferase, classes I and II superfamily  27.05 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000386  transcriptional regulator GntR family  26.12 
 
 		 471 aa  126  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.882947  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4479  GntR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1126  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1656  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.928604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0494  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 471 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4197  GntR family transcriptional regulator  25.05 
 
 		 530 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4094  GntR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.541503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3769  transcriptional regulator  25.05 
 
 		 480 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.492539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0915  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0965  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  27.4 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3521  transcriptional regulator  24.63 
 
 		 480 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3795  regulatory protein GntR HTH  23.89 
 
 		 471 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 433 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0924  GntR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.674436  normal  0.279711 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0599  putative transcription regulator protein  26.86 
 
 		 504 aa  123  9e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0558391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2454  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.201497  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2190  transcriptional regulator, GntR family  25.9 
 
 		 479 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4066  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 478 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.974396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2000  regulatory protein, GntR  25.9 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0975801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1972  GntR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 470 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3396  GntR family transcriptional regulator  23.22 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.644089  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0157  GntR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00565529  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0931  GntR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 479 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3059  GntR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 473 aa  121  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0865812  hitchhiker  0.000973023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2701  GntR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 502 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.193287  normal  0.0380236 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1940  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 469 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00494484 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3876  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.3 
 
 		 476 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2529  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 487 aa  119  9e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2175  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.51 
 
 		 498 aa  119  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2921  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.51 
 
 		 475 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06858  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3726  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  26.54 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1266  GntR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 473 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0592211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0750  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  24.79 
 
 		 472 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0724533  normal  0.938313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0929  GntR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.892808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2580  GntR family regulatory protein  23.89 
 
 		 493 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.882118  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0018  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 478 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.422778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1253  GntR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.413574  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1073  GntR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0498  GntR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.645809  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4467  transcriptional regulator  23.65 
 
 		 473 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.652401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0226  GntR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 472 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1338  GntR family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 472 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1420  GntR family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 472 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2096  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 471 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.698776  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2931  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 500 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.99384 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3544  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.384624  normal  0.66471 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1932  GntR family transcriptional regulator  27 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00018992  normal  0.474146 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000881  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.458944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1487  GntR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.539495  normal  0.767107 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4005  GntR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.723654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2379  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.228366  normal  0.534962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1063  GntR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 470 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0528  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  27.34 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0959  hypothetical protein  26.48 
 
 		 500 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2460  GntR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 478 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1716  aminotransferase, classes I and II superfamily  24.84 
 
 		 474 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1421  GntR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.694482  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4152  transcriptional regulator  26.74 
 
 		 483 aa  114  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.322922  normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1743  aminotransferase  24.84 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.455944  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>