More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2165 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2165  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 277 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1688  AraC family transcriptional regulator  60.07 
 
 		 280 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2505  transcriptional regulator, AraC family  56.88 
 
 		 277 aa  329  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470919  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0033  transcriptional regulator, AraC family  58.71 
 
 		 281 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3237  AraC family transcriptional regulator  51.42 
 
 		 281 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.601996 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4280  AraC family transcriptional regulator  52.16 
 
 		 281 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.682937 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4318  AraC family transcriptional regulator  55.09 
 
 		 272 aa  289  3e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103262  normal  0.531817 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1732  AraC family transcriptional regulator  52.52 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4086  AraC family transcriptional regulator  51.8 
 
 		 281 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1385  AraC family transcriptional regulator  54.51 
 
 		 272 aa  284  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.791872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4183  AraC family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 282 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.43701  normal  0.806695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3705  AraC family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 282 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2497  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 260 aa  279  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190674  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3439  AraC family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2324  AraC family transcriptional regulator  53.01 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3855  AraC family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 285 aa  271  7e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2434  AraC family transcriptional regulator  53.05 
 
 		 273 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  36.6 
 
 		 280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1665  transcriptional regulator, AraC family  36.96 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.127281  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 269 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0043  AraC family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 266 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 269 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4782  negative transcriptional regulator of cel operon  36.09 
 
 		 271 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0663748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4856  negative transcriptional regulator of cel operon  36.09 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 269 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4141  helix-turn-helix domain-containing protein  30.86 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000207295  hitchhiker  0.0000292463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1551  transcriptional regulator, AraC family  30.18 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2399  transcriptional regulator, AraC family  29.72 
 
 		 277 aa  126  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 278 aa  125  8.000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  32.97 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  29.89 
 
 		 277 aa  125  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 276 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  28.93 
 
 		 275 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.6 
 
 		 284 aa  116  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4452  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 275 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.686924 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0918  transcriptional regulator, AraC family  28.62 
 
 		 283 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473523  normal  0.595819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3138  AraC family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 279 aa  113  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.606385 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2537  AraC family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 284 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06279  hypothetical protein  28.4 
 
 		 275 aa  112  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1762  AraC/XylS family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1187  transcriptional regulator, AraC-family  26.1 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2300  AraC family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 274 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.457981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 285 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0667  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 280 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002090  transcriptional regulator AraC/XylS family  28.68 
 
 		 265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1460  AraC family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 278 aa  109  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3689  AraC family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00346  AraC family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 279 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0688  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0698  AraC family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5582  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  27.24 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0693  AraC family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1801  AraC family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 278 aa  106  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 278 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4394  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 266 aa  105  6e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.140673 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1562  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1599  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000366861  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 276 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 270 aa  105  9e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5726  transcriptional regulator, AraC family  31.3 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1568  AraC family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2781  transcriptional regulator, AraC family  27.05 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.109963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 277 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0617  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 273 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0294699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 276 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  30.27 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3068  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 300 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0382  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 274 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0321  transcriptional regulator, AraC family  31.15 
 
 		 264 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141392  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0866  transcriptional regulator, AraC family  30.47 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70530  AraC family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.204165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 277 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0766  AraC/XylS family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 273 aa  99.4  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  25.84 
 
 		 276 aa  99.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6118  putative transcriptional regulator  29.64 
 
 		 266 aa  99  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4288  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.170174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2075  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 278 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>