More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1645 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1645  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 606 aa  1221    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.417198  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3407  UvrD/REP helicase  85.6 
 
 		 604 aa  1003    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0218597  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0039  UvrD/REP helicase  63.55 
 
 		 599 aa  730    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.830062  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5487  putative ATP-dependent DNA helicase Rep  44.28 
 
 		 591 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2560  putative ATP-dependent DNA helicase, Rep  41.94 
 
 		 520 aa  361  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.742452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.65 
 
 		 1032 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 1089 aa  157  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 625 aa  157  7e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 785 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.99 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  26.05 
 
 		 723 aa  150  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.78 
 
 		 741 aa  150  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 706 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.83 
 
 		 722 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 678 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.14 
 
 		 690 aa  148  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 768 aa  148  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 648 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  23.97 
 
 		 648 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 678 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 721 aa  145  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.02 
 
 		 737 aa  145  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 678 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.21 
 
 		 726 aa  143  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  28.66 
 
 		 668 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.24 
 
 		 786 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 659 aa  141  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 1075 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  26.38 
 
 		 727 aa  141  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 743 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.68 
 
 		 754 aa  139  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  26.57 
 
 		 722 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  25.65 
 
 		 757 aa  139  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.32 
 
 		 722 aa  137  4e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 678 aa  137  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  25.72 
 
 		 721 aa  137  5e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  26.32 
 
 		 722 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.31 
 
 		 722 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.68 
 
 		 806 aa  137  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.52 
 
 		 731 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.31 
 
 		 722 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.31 
 
 		 722 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.5 
 
 		 696 aa  137  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.44 
 
 		 722 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 845 aa  135  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 707 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 738 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.87 
 
 		 739 aa  135  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  25.24 
 
 		 721 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 681 aa  134  5e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  27.07 
 
 		 728 aa  134  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.6 
 
 		 736 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 722 aa  134  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 722 aa  134  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 		 724 aa  134  6.999999999999999e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 738 aa  133  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2965  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 682 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.460273  normal  0.889017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  27.52 
 
 		 717 aa  133  7.999999999999999e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.92 
 
 		 729 aa  133  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23 
 
 		 751 aa  133  7.999999999999999e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 668 aa  133  9e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.55 
 
 		 837 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.15 
 
 		 751 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1516  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 		 688 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.200062  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  23.41 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.31 
 
 		 762 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 723 aa  132  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 742 aa  132  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 		 1001 aa  131  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  27.01 
 
 		 724 aa  131  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  28.19 
 
 		 1082 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  23.76 
 
 		 749 aa  130  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.99 
 
 		 747 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.98 
 
 		 663 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 755 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 		 830 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.36 
 
 		 805 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 805 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0779  UvrD/REP helicase  23.52 
 
 		 630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.14 
 
 		 663 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2555  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.09 
 
 		 671 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000614472  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 753 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.53 
 
 		 762 aa  126  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  26.52 
 
 		 677 aa  126  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  26.42 
 
 		 657 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.38 
 
 		 829 aa  125  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 725 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  28.95 
 
 		 726 aa  124  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 717 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2007  UvrD/REP helicase  26.76 
 
 		 714 aa  124  6e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0358603  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  26.99 
 
 		 720 aa  124  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.31 
 
 		 718 aa  124  6e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.55 
 
 		 765 aa  124  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 		 781 aa  124  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 769 aa  124  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 1023 aa  123  8e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  24.03 
 
 		 655 aa  123  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3362  UvrD family helicase  24.29 
 
 		 630 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.753608  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 728 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>