More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_0971 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_0971  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 193 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.820775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0735  NUDIX hydrolase  91.62 
 
 		 193 aa  366  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3294  NUDIX hydrolase  79.06 
 
 		 194 aa  325  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389654  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3214  NUDIX hydrolase  76.32 
 
 		 191 aa  313  8e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.157336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3483  NUDIX hydrolase  71.66 
 
 		 191 aa  287  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.142952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2962  NUDIX hydrolase  62.83 
 
 		 191 aa  254  8e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.510189 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2613  NUDIX family hydrolase  63.93 
 
 		 191 aa  249  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.819816 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2746  NUDIX family hydrolase  63.39 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3688  hydrolase, NUDIX family  63.39 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2835  hydrolase, NUDIX family  63.39 
 
 		 191 aa  248  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02358  predicted NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 191 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1203  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 191 aa  247  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1210  NUDIX hydrolase  62.84 
 
 		 191 aa  247  1e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02320  hypothetical protein  62.84 
 
 		 191 aa  247  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2596  NUDIX family hydrolase  62.84 
 
 		 191 aa  247  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1276  NUDIX family hydrolase  67.38 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2843  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2710  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1390  NUDIX hydrolase  67.38 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.136474  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2787  NUDIX family hydrolase  67.38 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0175603 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2621  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  241  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2736  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.738659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2670  putative hydrolase YffH  62.3 
 
 		 191 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1170  NUDIX hydrolase  61.38 
 
 		 193 aa  240  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3936  NUDIX hydrolase  59.16 
 
 		 195 aa  239  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6151  NUDIX hydrolase  57.51 
 
 		 193 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.389113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3674  NUDIX hydrolase  61.33 
 
 		 199 aa  226  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.569185 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2947  NTP pyrophosphohydrolases including oxidative damage repair enzymes  61.29 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.78552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1164  hypothetical protein  61.29 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2793  NUDIX family hydrolase  61.29 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0273  hypothetical protein  61.29 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0740  NUDIX hydrolase  58.66 
 
 		 196 aa  221  4e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0621  hypothetical protein  58.2 
 
 		 224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2220  NUDIX hydrolase  57.53 
 
 		 194 aa  221  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0391514  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3265  NUDIX hydrolase  58.38 
 
 		 195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4950  NUDIX hydrolase  60.44 
 
 		 195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.17081  normal  0.0998667 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3332  NUDIX hydrolase  55.9 
 
 		 202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1763  hypothetical protein  57.98 
 
 		 198 aa  209  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00769782  normal  0.0120574 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4044  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  57.3 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0463  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0904  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.682548 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0942  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  56.22 
 
 		 199 aa  207  5e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2291  NUDIX hydrolase  55.68 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.259047  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2260  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 198 aa  204  7e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.229118  hitchhiker  0.000399165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0802  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  55.68 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5088  NUDIX hydrolase  56.22 
 
 		 200 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2191  NUDIX hydrolase  53.26 
 
 		 199 aa  202  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4842  NUDIX hydrolase  55.26 
 
 		 195 aa  197  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3567  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  55.85 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267523 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2384  hypothetical protein  51.06 
 
 		 193 aa  188  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.227212  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01200  protein containing C-terminal region of TrgB protein  52.27 
 
 		 236 aa  178  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0219  hypothetical protein  44.27 
 
 		 192 aa  176  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.170349  normal  0.191205 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2697  NUDIX hydrolase  51.09 
 
 		 335 aa  175  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0790  NUDIX hydrolase  50.82 
 
 		 198 aa  169  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.14892  normal  0.428027 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2255  NUDIX hydrolase  47.67 
 
 		 198 aa  170  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3473  NUDIX hydrolase  50.28 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0862  NUDIX hydrolase  45.5 
 
 		 193 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.102995  normal  0.491513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1092  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0217104  hitchhiker  0.00264715 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1566  NTP pyrophosphohydrolase MutT family  44.39 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.250643  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1238  NUDIX hydrolase  47.06 
 
 		 197 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0804984  hitchhiker  0.0000559773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0324  NUDIX hydrolase  46.11 
 
 		 209 aa  154  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0106053  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7290  NUDIX hydrolase  38.12 
 
 		 204 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0864  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 188 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426746  normal  0.334935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0904  NUDIX hydrolase  36.93 
 
 		 188 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0381833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0832  NUDIX hydrolase  36.52 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.341274  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5997  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2012  MutT/nudix family protein  34.78 
 
 		 208 aa  98.6  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000517661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0105  NUDIX hydrolase  33.52 
 
 		 201 aa  98.6  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0726  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.7 
 
 		 203 aa  95.9  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0027035  hitchhiker  0.000778949 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5218  NUDIX hydrolase  37.91 
 
 		 195 aa  95.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0431  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.61 
 
 		 206 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000737623  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2991  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 204 aa  92.8  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499993 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5388  NUDIX hydrolase  34.1 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0775  ADP-ribose diphosphatase  33.7 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000156265  unclonable  0.0000000000726693 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4194  ADP-ribose diphosphatase  32.6 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.105257  hitchhiker  0.00339235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3235  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  32.6 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00707793  hitchhiker  0.00000215101 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3682  UDP-sugar diphosphatase  35.57 
 
 		 190 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0545  ADP-ribose diphosphatase  31.49 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0754  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  33.15 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0370949  hitchhiker  0.0055541 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3903  MutT/nudix family protein  33.15 
 
 		 200 aa  88.6  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5441  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 191 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.391972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3447  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  29.57 
 
 		 210 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0514  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 189 aa  88.6  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0222532  hitchhiker  0.000757753 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004521  ADP-ribose pyrophosphatase  32.07 
 
 		 216 aa  88.2  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000302738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0782  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 200 aa  88.2  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000245239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0807  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000627891  hitchhiker  0.0000000000549987 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0814  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00725628  normal  0.399443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3331  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.38 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0444683  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3577  NUDIX hydrolase  32.6 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368158  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3661  UDP-sugar diphosphatase  34.9 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44580  nudix hydrolase, YffH family  31.72 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1355  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  29.84 
 
 		 201 aa  84.7  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.127377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3359  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.49 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0950071 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02906  ADP-ribose pyrophosphatase  28.49 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4180  ADP-ribose pyrophosphatase  31.79 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4348  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.49 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0495  nucleoside diphosphate pyrophosphatase  31.38 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0663  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.49 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16672  normal  0.0141721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02856  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3212  ADP-ribose pyrophosphatase NudF  28.49 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00741682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>