250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2697 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2697  flagellar hook-associated protein FlgK  100 
 
 		 486 aa  957    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2964  flagellar hook-associated protein FlgK  44.24 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.517324 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3378  flagellar hook-associated protein FlgK  42.39 
 
 		 485 aa  340  4e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1304  flagellar hook-associated protein FlgK  44.44 
 
 		 481 aa  339  8e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2737  flagellar hook-associated protein FlgK  44.03 
 
 		 476 aa  325  9e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4174  flagellar hook-associated protein FlgK  38.07 
 
 		 487 aa  291  1e-77  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2940  flagellar hook-associated protein FlgK  34.85 
 
 		 482 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.323756 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2852  hypothetical protein  29.62 
 
 		 727 aa  134  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1100  hypothetical protein  32.45 
 
 		 622 aa  133  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.782435  normal  0.13317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0765  flagellar hook-associated protein FlgK  25.89 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1332  flagellar hook-associated protein  30.65 
 
 		 619 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.143121  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3556  flagellar hook-associated protein FlgK  29.11 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.83285 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5250  flagellar hook-associated protein FlgK  29.03 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.516905 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0060  flagellar hook-associated protein FlgK  27.72 
 
 		 457 aa  124  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0658  flagellar hook-associated protein FlgK  29.32 
 
 		 489 aa  123  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.897346  normal  0.563505 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0109  flagellar hook-associated protein FlgK  28.32 
 
 		 485 aa  121  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0066  flagellar hook-associated protein FlgK  26.28 
 
 		 457 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1112  flagellar hook-associated protein FlgK  26.29 
 
 		 490 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0317461  normal  0.701676 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1121  flagellar hook-associated protein FlgK  27.62 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1486  flagellar hook-associated protein  28.36 
 
 		 626 aa  116  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0043  flagellar hook-associated protein FlgK  28.13 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4192  flagellar hook-associated protein FlgK  29.4 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5530  flagellar hook-associated protein FlgK  27.44 
 
 		 486 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2543  flagellar hook-associated protein FlgK  30.52 
 
 		 613 aa  113  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.24751  normal  0.159596 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6507  flagellar hook-associated protein FlgK  27.35 
 
 		 483 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0419399 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0278  flagellar hook-associated protein FlgK  30.48 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0616827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0339  flagellar hook-associated protein FlgK  27.15 
 
 		 495 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295463  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2014  flagellar hook-associated protein  30.41 
 
 		 618 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1706  flagellar hook-associated protein FlgK  27.33 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.127972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0371  flagellar hook-associated protein FlgK  27.59 
 
 		 495 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.294715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3816  flagellar hook-associated protein  29.77 
 
 		 623 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308813  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1138  flagellar hook-associated protein FlgK  28.82 
 
 		 484 aa  109  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1668  flagellar hook-associated protein  29.72 
 
 		 623 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.121705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3478  flagellar hook-associated protein FlgK  26.6 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.109948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4454  flagellar hook-associated protein FlgK  29.88 
 
 		 623 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0715  flagellar hook-associated protein FlgK  30.63 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0684  flagellar hook-associated protein FlgK  28.6 
 
 		 487 aa  104  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.145832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2529  hypothetical protein  24.85 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.704785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5544  flagellar hook-associated protein FlgK  29.95 
 
 		 627 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0695  flagellar hook-associated protein FlgK  28.21 
 
 		 487 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.946799  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0914  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 		 632 aa  100  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0951  flagellar hook-associated protein FlgK  27.9 
 
 		 632 aa  100  6e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0338024 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5536  putative flagellar hook-associated protein 1 (HAP1, FlgK protein)  28.27 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0277  flagellar hook-associated protein FlgK  28.92 
 
 		 472 aa  100  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3569  flagellar hook-associated protein FlgK  26.24 
 
 		 454 aa  99.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.303644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2311  flagellar hook-associated protein FlgK  28.57 
 
 		 623 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0348946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0768  flagellar hook-associated protein  29.78 
 
 		 588 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.274286  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3043  flagellar hook-associated protein FlgK  24.06 
 
 		 477 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0890  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 		 632 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0218  flagellar hook-associated protein FlgK  23.77 
 
 		 453 aa  95.1  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4185  flagellar hook-associated protein FlgK  28.09 
 
 		 623 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.781196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1149  flagellar hook-associated protein  23.41 
 
 		 464 aa  91.3  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0438  flagellar hook-associated protein  23.03 
 
 		 477 aa  90.1  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1622  flagellar hook-associated protein FlgK  25.05 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3962  flagellar hook-associated protein FlgK  25.26 
 
 		 457 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3459  flagellar hook-associated protein FlgK  25.88 
 
 		 457 aa  88.2  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3455  flagellar hook-associated protein FlgK  22.99 
 
 		 456 aa  88.2  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04918  flagellar hook-associated protein  22.6 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0246  flagellar hook-associated protein FlgK  24.74 
 
 		 452 aa  87  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3642  flagellar hook-associated protein  24.74 
 
 		 457 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000731  flagellar hook-associated protein FlgK  23.69 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2357  flagellar hook-associated protein FlgK  25.15 
 
 		 459 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0193  flagellar hook-associated protein FlgK  23.74 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.363354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0272  lateral flagellar hook associated protein 1  24.28 
 
 		 458 aa  83.2  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.508781 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0451  flagellar hook-associated protein FlgK  24.04 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0874  flagellar hook-associated protein  30 
 
 		 588 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7241  putative flagellar hook-associated protein  26.18 
 
 		 599 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.52345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3362  flagellar hook-associated protein FlgK  23.66 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4381  flagellar hook-associated protein FlgK  26.95 
 
 		 680 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.920436 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0648  flagellar hook-associated protein FlgK  22.75 
 
 		 453 aa  79.7  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1767  flagellar hook-associated protein FlgK  27.95 
 
 		 549 aa  79.7  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4099  flagellar hook-associated protein FlgK  22.97 
 
 		 478 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1007  flagellar hook-associated protein FlgK  26.23 
 
 		 704 aa  78.2  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.159823  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1043  flagellar hook-associated protein FlgK  27.06 
 
 		 464 aa  78.2  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0691  flagellar hook-associated protein FlgK  27.42 
 
 		 713 aa  77.4  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.805138 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0150  flagellar hook-associated protein FlgK  24.22 
 
 		 657 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3784  flagellar hook-associated protein FlgK  23.93 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1226  flagellar hook-associated protein FlgK  22.55 
 
 		 637 aa  75.9  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.548532  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3722  flagellar hook-associated protein FlgK  27.34 
 
 		 682 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0864  flagellar hook-associated protein FlgK  24.77 
 
 		 858 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0841  flagellar hook-associated protein FlgK  24.47 
 
 		 858 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3000  flagellar hook-associated protein FlgK  29.91 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000379276 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4782  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.419966 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3705  flagellar hook-associated protein FlgK  25.5 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117062 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2709  flagellar hook-associated protein FlgK  25.55 
 
 		 566 aa  73.6  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2369  hypothetical protein  24.5 
 
 		 647 aa  73.2  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0902  flagellar hook-associated protein FlgK  25.87 
 
 		 695 aa  72.8  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.125146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2958  flagellar hook-associated protein FlgK  24.63 
 
 		 657 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360284 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0351  flagellar hook-associated protein FlgK  24.62 
 
 		 642 aa  72.4  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.309905  normal  0.119919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3152  flagellar hook-associated protein  24.03 
 
 		 696 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2243  flagellar hook-associated protein FlgK  23.78 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.39076  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3942  flagellar hook-associated protein FlgK  27.87 
 
 		 680 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0746  flagellar hook-associated protein FlgK  26.94 
 
 		 486 aa  71.6  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3275  flagellar hook-associated protein FlgK  24.24 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1205  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 		 547 aa  70.9  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.223316  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0393  flagellar hook-associated protein FlgK  22.44 
 
 		 818 aa  70.9  0.00000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.890303  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01078  flagellar hook-associated protein K  24.21 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0929939  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01086  hypothetical protein  24.21 
 
 		 547 aa  70.5  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0870613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2930  flagellar hook-associated protein  24.05 
 
 		 458 aa  70.5  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.685458  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2564  flagellar hook-associated protein FlgK  24.21 
 
 		 547 aa  70.1  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.141155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>