More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2166 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  100 
 
 		 698 aa  1385    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0659  general secretion pathway protein E  49.43 
 
 		 628 aa  555  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.814938  normal  0.16836 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0522  general secretion pathway protein E  49.61 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.450126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1872  glycosyl transferase family protein  50.73 
 
 		 604 aa  538  1e-151  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  44.26 
 
 		 654 aa  486  1e-136  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  45.06 
 
 		 635 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  48.85 
 
 		 509 aa  443  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2855  glycosyl transferase family 2  35.46 
 
 		 624 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.152901  normal  0.875286 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0424  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 		 652 aa  330  7e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.32532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1292  glycosyl transferase family protein  35.82 
 
 		 642 aa  321  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4110  glycosyl transferase family protein  33.23 
 
 		 626 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656691  normal  0.773085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0721  general secretion pathway protein E  32.96 
 
 		 606 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.831257  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2964  glycosyl transferase family 2  43.57 
 
 		 476 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0324251  hitchhiker  0.00721921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 		 664 aa  276  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 		 626 aa  263  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.59 
 
 		 630 aa  258  3e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0207  hypothetical protein  37.83 
 
 		 475 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.36 
 
 		 573 aa  254  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  38.01 
 
 		 512 aa  253  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0431  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.4 
 
 		 532 aa  249  9e-65  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.802283  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1064  glycosyl transferase family protein  34.88 
 
 		 650 aa  249  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.132947 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  39.47 
 
 		 612 aa  249  1e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3200  glycosyl transferase family protein  34.28 
 
 		 848 aa  247  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0525  hypothetical protein  37.18 
 
 		 464 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3769  glycosyl transferase family protein  41.98 
 
 		 632 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997629  normal  0.300264 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0547  hypothetical protein  36.97 
 
 		 464 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0886  glycosyl transferases  42.35 
 
 		 673 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0998  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 		 686 aa  243  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.759416  normal  0.641778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0535  hypothetical protein  40.05 
 
 		 417 aa  242  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3420  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 616 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.13 
 
 		 656 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0577  glycosyltransferase  38.83 
 
 		 664 aa  239  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2861  glycosyl transferase family protein  40.94 
 
 		 678 aa  239  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.623061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5168  glycosyl transferase family 2  34.77 
 
 		 683 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2888  glycosyl transferase family 2  38.06 
 
 		 615 aa  237  6e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.233699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2382  glycosyl transferase family protein  36.28 
 
 		 678 aa  233  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3549  glycosyl transferase family protein  34.44 
 
 		 614 aa  231  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.877744 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3225  glycosyl transferase family protein  40 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0693647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0496  glycosyl transferase family protein  37.98 
 
 		 537 aa  228  3e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.741629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1627  cell wall biogenesis glycosyltransferase  41.8 
 
 		 656 aa  225  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0402312  normal  0.167793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3092  hypothetical protein  35.68 
 
 		 492 aa  209  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 420 aa  134  5e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0209  putative glycosyl transferase  37.5 
 
 		 219 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0145  glycosyl transferase  38.46 
 
 		 216 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.51395  normal  0.856095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4863  glycosyl transferase family protein  37.65 
 
 		 461 aa  127  9e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.907872  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0149  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 		 450 aa  125  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.975549 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0203  glycosyl transferase family protein  43.35 
 
 		 465 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.678813  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3771  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 433 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5409  glycosyl transferase, group 2 family  26.06 
 
 		 433 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.39415  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0635  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 		 471 aa  110  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00269925  normal  0.0269839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5327  glycosyl transferase, group 2 family  26.1 
 
 		 433 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.76631e-28 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4918  glycosyl transferase  26.1 
 
 		 433 aa  109  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0768338  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5030  glycosyl transferase family protein  25.79 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5356  glycosyl transferase domain-containing protein  25 
 
 		 433 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4933  N-acetylglucosaminyltransferase  26.1 
 
 		 433 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.443938  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  31.47 
 
 		 395 aa  108  4e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5361  N-acetylglucosaminyltransferase  25.71 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.190593  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 546 aa  104  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0965  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  30.37 
 
 		 644 aa  102  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4704  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 		 483 aa  95.1  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0279225  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0070  glycosyl transferase family 2  33.47 
 
 		 431 aa  94.4  6e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 		 393 aa  93.6  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 508 aa  90.5  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  28.69 
 
 		 399 aa  88.6  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  27.02 
 
 		 501 aa  87  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1129  putative inner membrane glycosyltransferase  28.38 
 
 		 662 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2898  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.38 
 
 		 505 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 501 aa  84.7  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2745  putative inner membrane glycosyl transferase  28.38 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.00354883  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5475  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1315  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 520 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3621  glycosyl transferase family protein  28.35 
 
 		 509 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0342  glycosyl transferase, group 2 family protein, putative  28.2 
 
 		 633 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270731  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0852  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 520 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1333  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 520 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  27.83 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0430  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.912379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1831  glycosyltransferase  26.84 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  27.49 
 
 		 696 aa  80.5  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  28.83 
 
 		 1140 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 		 501 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 502 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  27.34 
 
 		 505 aa  79.7  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  21.71 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  23.03 
 
 		 494 aa  78.6  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2627  glycosyl transferase family protein  29.88 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.528621  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3365  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.21 
 
 		 789 aa  77.8  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  26.6 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  28 
 
 		 509 aa  77.4  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 		 549 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 475 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  28.06 
 
 		 868 aa  76.6  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  26.03 
 
 		 468 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  24.61 
 
 		 699 aa  76.3  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2112  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 462 aa  75.9  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>