More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2112 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_2112  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
462 aa  931    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1088  glycosyl transferase family 2  50.11 
 
 
458 aa  466  9.999999999999999e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0335  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
459 aa  155  1e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0649  glycosyl transferase family protein  35.65 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.113034 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0708  glycosyl transferase family protein  28.07 
 
 
513 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.43114  normal  0.211707 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1655  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
553 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00101138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1754  glycosyl transferase family protein  28.03 
 
 
505 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0500  glycosyl transferase family protein  26.88 
 
 
497 aa  110  5e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0197  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
426 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.823444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1567  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
492 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1826  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  28.21 
 
 
480 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.039758  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0770  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
499 aa  101  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.131456  normal  0.56836 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1730  glycosyl transferase family protein  27.43 
 
 
420 aa  96.7  8e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.461107  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1766  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 
505 aa  94  6e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.214339  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6620  glycosyl transferase family 2  25.61 
 
 
508 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0714  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
501 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0487319  decreased coverage  0.00470024 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0444  glycosyl transferase family protein  25.78 
 
 
688 aa  90.5  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000329644 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0095  glycosyl transferase family 2  26.12 
 
 
494 aa  90.5  6e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.176574  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3301  family 2 glycosyl transferase  26.87 
 
 
469 aa  88.6  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144563  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0060  putative glycosyltransferase  28.88 
 
 
439 aa  87.8  4e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4660  glycosyl transferase family 2  25.26 
 
 
488 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.116626  normal  0.331734 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1751  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
433 aa  86.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.121941  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1219  glycosyl transferase family 2  28.05 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0212289 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1257  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 
438 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2904  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
546 aa  85.5  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18491  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
433 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.468741  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21281  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
438 aa  84.7  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.133481  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3209  glycosyl transferase family 2  23.08 
 
 
868 aa  84.3  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.871407  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18491  glycosyl transferase family protein  29.14 
 
 
433 aa  83.6  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.249822  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0183  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 
395 aa  83.2  0.000000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00790444  normal  0.140907 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05410  glycosyltransferase  25.23 
 
 
490 aa  83.6  0.000000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0057  putative glycosyltransferase  27.54 
 
 
443 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18681  glycosyl transferase family protein  28.99 
 
 
433 aa  82  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2388  glycosyl transferase  25.75 
 
 
635 aa  80.9  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.445397  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1478  glycosyl transferase family 2  22.88 
 
 
533 aa  80.5  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  25.53 
 
 
509 aa  80.1  0.00000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0670  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
501 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.249955  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0014  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.47 
 
 
656 aa  79.7  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4425  glycosyl transferase family 2  27.02 
 
 
476 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0704  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
501 aa  77.4  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.441471  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0296  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.51 
 
 
630 aa  77.4  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2217  glycosyl transferase family protein  25.93 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.368513  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0705  glycosyl transferase family 2  23.53 
 
 
501 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.411435  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2839  glycosyl transferase family 2  22.18 
 
 
523 aa  76.6  0.0000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0311  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.12 
 
 
573 aa  76.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0614  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0599  glycosyl transferase family 2  27.79 
 
 
475 aa  76.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1779  glycosyl transferase family protein  25.98 
 
 
889 aa  75.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2166  general secretion pathway protein E  25.31 
 
 
698 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0984  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 
393 aa  75.5  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00499556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0992  cellulose synthase (UDP-forming)  23.69 
 
 
501 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.832352 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1949  General secretory system II protein E domain protein  24.3 
 
 
612 aa  74.7  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18489  predicted protein  23.97 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0623702  normal  0.762192 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2295  glycosyl transferase family protein  23.72 
 
 
509 aa  73.9  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2612  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
895 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.228291  hitchhiker  0.00221032 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  24.83 
 
 
740 aa  73.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
1129 aa  73.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0285  glycosyl transferase family protein  25.17 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4287  N-glycosyltransferase  24.82 
 
 
442 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4608  N-glycosyltransferase  23.64 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1338  glycosyl transferase family protein  25.23 
 
 
772 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0379  glycosyl transferase family protein  24.18 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2928  glycosyl transferase family 2  25.08 
 
 
944 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.904629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0752  N-glycosyltransferase  23.05 
 
 
433 aa  72.4  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2860  glycosyl transferase family protein  24.48 
 
 
899 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00529842  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0285  glycosyl transferase family protein  23.78 
 
 
476 aa  72.4  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.352995  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39140  Glycosyl transferase, family 2  24.69 
 
 
863 aa  71.6  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2747  N-glycosyltransferase  26.77 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2690  N-glycosyltransferase  26.77 
 
 
399 aa  71.2  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  22.96 
 
 
741 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4423  glycosyl transferase family protein  23.38 
 
 
905 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.501491  normal  0.0679911 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  21.7 
 
 
549 aa  71.2  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00631  glycosyl transferase family protein  26.81 
 
 
443 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2146  glycosyl transferase family protein  22.62 
 
 
903 aa  70.9  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.302574  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2600  glycosyl transferase family protein  24.14 
 
 
919 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0728813  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1698  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 
844 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000612337  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0081  glycosyltransferase  23.22 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000323026  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1280  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 
889 aa  70.1  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0531421  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1789  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
889 aa  69.3  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.121922  normal  0.0753716 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0753  glycosyl transferase family 2  21.17 
 
 
650 aa  69.7  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0746486  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
1140 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3996  N-glycosyltransferase  23.97 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706651  normal  0.0922124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4093  glycosyl transferase family protein  22.95 
 
 
863 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.363982  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0340  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  22.92 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00114469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1083  glycosyltransferase  25.09 
 
 
458 aa  68.9  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1245  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.620003 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0980  glycosyl transferase family 2  23.05 
 
 
512 aa  68.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.920286  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3513  N-glycosyltransferase  23.97 
 
 
423 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604039  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1454  glycosyl transferase family 2  24.36 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.959687  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1562  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4484  N-glycosyltransferase  24.15 
 
 
423 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.230285  normal  0.930554 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
1140 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  24.48 
 
 
1140 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2718  N-glycosyltransferase  23.15 
 
 
418 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1942  N-glycosyltransferase  23.77 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1089  glycosyl transferase family protein  24.25 
 
 
885 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2931  glycosyl transferase family 2  22.55 
 
 
664 aa  66.6  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2190  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
450 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0560  glycosyl transferase family protein  21.84 
 
 
917 aa  66.6  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.922438  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2749  glycosyl transferase family protein  26.85 
 
 
502 aa  66.6  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.924892  normal  0.61972 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>