47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1528 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1845  hypothetical protein  90.33 
 
 		 641 aa  1200    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 640 aa  1311    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.115207  normal  0.0226775 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2248  hypothetical protein  49.84 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0310793  normal  0.0143369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3258  Protein of unknown function DUF2081  44.88 
 
 		 615 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.111027 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3225  protein of unknown function DUF262  43.9 
 
 		 588 aa  484  1e-135  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4878  hypothetical protein  41.32 
 
 		 617 aa  479  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1940  protein of unknown function DUF262  43.24 
 
 		 592 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0192846  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2961  hypothetical protein  41.44 
 
 		 598 aa  480  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.310049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6163  protein of unknown function DUF262  42.76 
 
 		 593 aa  460  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3084  hypothetical protein  39.74 
 
 		 778 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00108127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1598  protein of unknown function DUF262  25.52 
 
 		 582 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0797  hypothetical protein  23.82 
 
 		 522 aa  120  7e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0228  hypothetical protein  23.69 
 
 		 548 aa  114  7.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.177924  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0789  hypothetical protein  24.05 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.171131  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4287  hypothetical protein  61.9 
 
 		 74 aa  84.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3603  hypothetical protein  23.89 
 
 		 570 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.136498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1685  hypothetical protein  21.28 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0364586  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1804  hypothetical protein  21.09 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3033  hypothetical protein  22.64 
 
 		 756 aa  78.6  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  42.22 
 
 		 760 aa  72.4  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5215  hypothetical protein  22.96 
 
 		 690 aa  70.1  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.741994  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  23.27 
 
 		 753 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.490973 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  25 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1061  hypothetical protein  21.66 
 
 		 575 aa  67.4  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0825  hypothetical protein  37.78 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0809  hypothetical protein  37.78 
 
 		 754 aa  67.4  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0336  hypothetical protein  21.77 
 
 		 705 aa  66.6  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3179  protein of unknown function DUF262  22.2 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2015  hypothetical protein  35 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.247694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02080  hypothetical protein  36.08 
 
 		 764 aa  57.4  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.701469  normal  0.633703 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0246  hypothetical protein  30.43 
 
 		 657 aa  56.2  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2482  hypothetical protein  32.69 
 
 		 751 aa  54.3  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0422177  normal  0.539881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  22.98 
 
 		 221 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  22.98 
 
 		 221 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0892  hypothetical protein  29.2 
 
 		 563 aa  52  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.82217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1684  hypothetical protein  29.2 
 
 		 137 aa  50.8  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0283025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  29.9 
 
 		 546 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3288  protein of unknown function DUF262  32.69 
 
 		 599 aa  48.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2266  hypothetical protein  25.93 
 
 		 593 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.607101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1486  protein of unknown function DUF262  32.08 
 
 		 576 aa  47  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  22.94 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02870  hypothetical protein  21.21 
 
 		 603 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0501  hypothetical protein  47.62 
 
 		 60 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0289  protein of unknown function DUF262  28 
 
 		 249 aa  45.4  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.409479 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  26.61 
 
 		 353 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4799  hypothetical protein  25.89 
 
 		 608 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.813087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  32.18 
 
 		 402 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>