59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2358 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2358  hypothetical protein  100 
 
 		 1102 aa  2238    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0874  hypothetical protein  24.21 
 
 		 1080 aa  293  1e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1173  AsmA  25.05 
 
 		 1079 aa  280  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000700757  normal  0.126204 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1371  AsmA family protein  22.98 
 
 		 1104 aa  269  2.9999999999999995e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000870938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0763  AsmA family protein  24.01 
 
 		 1070 aa  248  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.116181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3362  AsmA family protein  24.12 
 
 		 1061 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596637 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0899  AsmA family protein  28.45 
 
 		 1061 aa  238  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00548137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2612  AsmA family protein  24.23 
 
 		 1094 aa  235  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.74213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3774  membrane protein-like  23.58 
 
 		 1234 aa  117  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0394533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1861  membrane protein-like protein  29.95 
 
 		 1144 aa  90.9  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.777283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0705  membrane protein-like protein  23.95 
 
 		 1224 aa  61.6  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.113545  hitchhiker  0.00000969857 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0928  hypothetical protein  24.88 
 
 		 655 aa  60.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.903286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4555  putative protease  25.26 
 
 		 1323 aa  60.5  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1971  AsmA family protein  28.4 
 
 		 892 aa  60.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.457681  normal  0.0391828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1218  hypothetical protein  28.74 
 
 		 1341 aa  55.1  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0577669  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1133  hypothetical protein  27.78 
 
 		 856 aa  54.3  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0659  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1398 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5159  hypothetical protein  27.53 
 
 		 1394 aa  54.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0634  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1398 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.913326  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2037  hypothetical protein  22.44 
 
 		 1088 aa  54.3  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.86999  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3957  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1232 aa  53.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2899  hypothetical protein  27.84 
 
 		 1283 aa  52.4  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0711  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1399 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.463012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0257  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1399 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.866424  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0741  hypothetical protein  28.23 
 
 		 1399 aa  51.6  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.77418  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2270  membrane protein-like protein  29.76 
 
 		 1304 aa  51.6  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3829  hypothetical protein  29.03 
 
 		 1399 aa  51.6  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2643  hypothetical protein  25.14 
 
 		 1399 aa  49.7  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.73761 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0510  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1261 aa  49.3  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2335  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1368 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3332  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0490  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2216  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1372 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0519007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3321  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1109  hypothetical protein  27.05 
 
 		 1397 aa  48.9  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.823265  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1298  hypothetical protein  24.28 
 
 		 1397 aa  48.5  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.438344  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3288  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1397 aa  48.5  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0218679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0728  hypothetical protein  28.69 
 
 		 1428 aa  48.5  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0555  hypothetical protein  20.29 
 
 		 843 aa  48.1  0.0009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0849  hypothetical protein  27.75 
 
 		 1384 aa  47.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3970  hypothetical protein  27.87 
 
 		 1430 aa  47.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.231617 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1776  membrane protein-like protein  22.27 
 
 		 1384 aa  47.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0579  hypothetical protein  24.53 
 
 		 1383 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0527  hypothetical protein  24.02 
 
 		 1454 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2449  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1243 aa  47.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.276493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1669  hypothetical protein  22.38 
 
 		 1210 aa  46.6  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.285065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4644  AsmA family protein  29.41 
 
 		 649 aa  46.2  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0752121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2333  hypothetical protein  22.78 
 
 		 1255 aa  46.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0634  hypothetical protein  20 
 
 		 856 aa  45.8  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1127  membrane protein-like protein  26.86 
 
 		 1294 aa  46.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.334782  normal  0.712644 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3001  hypothetical protein  24.56 
 
 		 1244 aa  46.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.11101 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4093  hypothetical protein  23.15 
 
 		 1390 aa  45.4  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0181  hypothetical protein  22.7 
 
 		 943 aa  45.4  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3169  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1149 aa  45.1  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3817  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1459 aa  45.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0993  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1398 aa  45.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.193482 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0523  hypothetical protein  23.53 
 
 		 1446 aa  45.1  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0502  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1441 aa  44.7  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0861  membrane protein-like protein  26.09 
 
 		 1273 aa  44.7  0.009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.835961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>