More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1409 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1409  two component signal transduction response regulator  100 
 
 		 123 aa  250  5.000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000120114  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2308  response regulator receiver protein  66.94 
 
 		 123 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3143  response regulator receiver protein  65.29 
 
 		 124 aa  162  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  63.03 
 
 		 123 aa  156  8e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0758  response regulator receiver protein  62.18 
 
 		 132 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0540632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0743  response regulator receiver protein  61.34 
 
 		 132 aa  146  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.22 
 
 		 310 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1901  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 125 aa  110  9e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 231 aa  107  7.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14770  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.83 
 
 		 226 aa  106  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.383411  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0653  two-component response regulator PhoB  44.63 
 
 		 230 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.131558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  52.78 
 
 		 231 aa  105  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2062  response regulator receiver protein  48.74 
 
 		 217 aa  106  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0329  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.24 
 
 		 231 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1501  response regulator receiver protein  47.01 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.153095  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4150  response regulator receiver protein  42.37 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.583085 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2281  two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 229 aa  103  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.331932  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0783  two component transcriptional regulator  47.06 
 
 		 231 aa  103  8e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 234 aa  103  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 234 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  44.92 
 
 		 235 aa  101  3e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.74 
 
 		 593 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0849  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.74 
 
 		 593 aa  101  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.386146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  45.79 
 
 		 233 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0669  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 123 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2712  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 224 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00552555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1102  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 225 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  47.22 
 
 		 170 aa  100  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  46.73 
 
 		 233 aa  100  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3778  response regulator receiver domain-containing protein  42.37 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1701  DNA-binding response regulator  44.07 
 
 		 230 aa  100  8e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00672994  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4431  response regulator receiver domain-containing protein  42.98 
 
 		 125 aa  100  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.02 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.08 
 
 		 234 aa  98.6  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 124 aa  99  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2443  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 224 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  46.73 
 
 		 228 aa  99  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1133  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 217 aa  98.6  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  45.38 
 
 		 227 aa  98.6  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0090  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.28 
 
 		 228 aa  99.4  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1911  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 229 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.258551 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.67 
 
 		 231 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0882  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 230 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.148935 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3542  response regulator receiver protein  43.22 
 
 		 121 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  42.86 
 
 		 1373 aa  97.8  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.41 
 
 		 233 aa  97.8  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1271  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.68 
 
 		 350 aa  97.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2226  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.561592  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0573  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.087024  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  97.4  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1665  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 232 aa  97.4  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2083  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.96 
 
 		 237 aa  97.1  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.873655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2412  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.148654 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  50 
 
 		 239 aa  97.1  7e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  42.37 
 
 		 236 aa  96.7  8e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2951  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 236 aa  97.1  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3288  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 225 aa  97.1  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0366247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3620  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0597824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3396  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000765328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3358  transcriptional regulatory protein  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000200566  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3612  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.20142e-22 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3308  transcriptional regulatory protein  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000872353  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3627  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3661  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000222084  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0789  response regulator receiver protein  50 
 
 		 278 aa  96.7  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3709  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000227696  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1606  DNA-binding response regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.7  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00543423  hitchhiker  0.0000000112462 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  46.3 
 
 		 236 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.57 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2250  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 225 aa  96.3  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000295266  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.09 
 
 		 230 aa  96.3  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  42.37 
 
 		 245 aa  96.3  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.57 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  47.57 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2815  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  46.15 
 
 		 457 aa  96.7  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.631579  normal  0.0857187 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  46.23 
 
 		 232 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.66 
 
 		 235 aa  95.5  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1751  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.97 
 
 		 234 aa  95.9  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0251  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 126 aa  95.9  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.102048 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.32 
 
 		 237 aa  95.5  2e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 229 aa  95.9  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2695  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 186 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00269866  normal  0.78823 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3309  response regulator receiver domain-containing protein  43.22 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0791773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3039  response regulator receiver  42.37 
 
 		 121 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.403093  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  44.63 
 
 		 233 aa  95.5  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  43.59 
 
 		 235 aa  95.1  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  95.1  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  43.93 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  47.57 
 
 		 231 aa  95.1  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1865  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.79 
 
 		 226 aa  94.7  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  41.67 
 
 		 234 aa  95.1  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0206  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 123 aa  94.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.164513  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  40.37 
 
 		 239 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 238 aa  95.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5066  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.61 
 
 		 338 aa  95.1  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2442  response regulator PleD  42.98 
 
 		 457 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.696702  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  43.93 
 
 		 228 aa  95.1  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>