187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1986 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1986  phosphoribosyltransferase  100 
 
 		 186 aa  370  1e-102  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0798  phosphoribosyltransferase  78.45 
 
 		 181 aa  304  4.0000000000000004e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000521483 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0877  phosphoribosyltransferase  78.77 
 
 		 208 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.267757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1964  phosphoribosyltransferase  74.16 
 
 		 180 aa  287  5.0000000000000004e-77  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0577675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3178  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  41.61 
 
 		 206 aa  130  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00229089 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0750  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1686  phosphoribosyltransferase  41.14 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.820077  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2827  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  38.96 
 
 		 206 aa  123  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0982  phosphoribosyltransferase  41.25 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1796  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 220 aa  121  5e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.129569 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1680  phosphoribosyltransferase  35.58 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1674  phosphoribosyltransferase  40.62 
 
 		 220 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.132511  normal  0.892675 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0836  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0620  phosphoribosyltransferase  35.8 
 
 		 256 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0446  phosphoribosyltransferase  37.58 
 
 		 238 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0365147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0750  phosphoribosyltransferase  36.21 
 
 		 207 aa  112  5e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.167668  normal  0.0224381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1334  phosphoribosyltransferase  34.51 
 
 		 232 aa  111  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1412  phosphoribosyltransferase  35.19 
 
 		 206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.734426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0383  phosphoribosyltransferase  39.33 
 
 		 186 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0167235  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2592  phosphoribosyltransferase  32.21 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.987222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0430  phosphoribosyltransferase  30.28 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.364272  normal  0.111073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0154  phosphoribosyltransferase  37.82 
 
 		 205 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1425  phosphoribosyltransferase  36.05 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2740  phosphoribosyltransferase  29.66 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.306639  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0850  phosphoribosyltransferase  31.03 
 
 		 230 aa  99.8  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0913  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.92 
 
 		 224 aa  98.2  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.108987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0744  phosphoribosyltransferase  36.59 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0776004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0637  phosphoribosyltransferase  32.37 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.31901  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22270  predicted phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 170 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0228  phosphoribosyltransferase  36.84 
 
 		 179 aa  88.6  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1738  phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0119  phosphoribosyltransferase  37.67 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1984  putative transferase  35.9 
 
 		 173 aa  83.2  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116476 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2856  phosphoribosyltransferase  34.62 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.736332 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10220  predicted phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0977  phosphoribosyltransferase  28.67 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2343  phosphoribosyltransferase  35.46 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1712  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 169 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3161  phosphoribosyltransferase  33.55 
 
 		 174 aa  72  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1451  phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.930666  normal  0.536266 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0024  phosphoribosyltransferase  33.58 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.128172 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1435  phosphoribosyltransferase  33.54 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011265  normal  0.560383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2199  phosphoribosyltransferase  32.28 
 
 		 174 aa  69.7  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2887  phosphoribosyltransferase  30.26 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0833  phosphoribosyltransferase  29.61 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.892512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5008  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 174 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1102  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1182  phosphoribosyltransferase  31.65 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895318  normal  0.356088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2945  phosphoribosyltransferase  32.45 
 
 		 184 aa  62.4  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0395  phosphoribosyltransferase  28.46 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3943  phosphoribosyltransferase  31.61 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.648544  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2295  phosphoribosyltransferase  31.45 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2596  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.351489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2342  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1884  phosphoribosyltransferase  31.41 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.209133  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1017  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.14 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1591  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.56 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1386  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.08 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.205195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1245  phosphoribosyltransferase  32.64 
 
 		 166 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00148991  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3582  phosphoribosyltransferase  30.13 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00933631 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1335  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.4 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0193971  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1731  hypothetical protein  29.61 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2602  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 165 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0226362  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1049  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.48 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.902845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3234  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 		 161 aa  57  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1160  phosphoribosyltransferase  28.75 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.951906  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1684  phosphoribosyltransferase  24.65 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0855  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 		 165 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.899266  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0279  phosphoribosyltransferase  28.47 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5270  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.19 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.312295 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1415  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  29.25 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.982851  normal  0.391906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7666  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.93 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1046  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0960  phosphoribosyltransferase  26.92 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6953  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0372547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2188  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.35 
 
 		 168 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2095  phosphoribosyltransferase  28.85 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.330855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1146  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.92 
 
 		 176 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.0000218222  normal  0.206234 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2133  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.21 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1928  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  27.52 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.266105  normal  0.026765 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0821  phosphoribosyltransferase  27.45 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1485  outer membrane fibronectin-binding protein  24.16 
 
 		 146 aa  52.4  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2075  phosphoribosyltransferase  28.21 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1751  phosphoribosyltransferase  31.1 
 
 		 178 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487396  normal  0.531805 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0213  Xanthine phosphoribosyltransferase  26.99 
 
 		 163 aa  52  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.90776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3776  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1793  xanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.83 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000757815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2246  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.65 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175037  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1474  phosphoribosyltransferase  28.24 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0201  phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 169 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3586  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3653  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0652  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.41857  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3834  putative hypoxanthine phosphoribosyltransferase  29.03 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.6949  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1562  putative nucleotide phosphoribosyltransferase  24.29 
 
 		 147 aa  52  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0807  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0820  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0725  hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase  26.06 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1822  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.65 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1094  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  27.65 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>