More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3919 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3981  sensor histidine kinase  46.91 
 
 		 738 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2192  sensor histidine kinase  51.39 
 
 		 687 aa  698    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2519  histidine kinase  50.9 
 
 		 728 aa  755    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1790  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.5 
 
 		 723 aa  738    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 722 aa  757    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.856072  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1839  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 722 aa  759    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1737  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.66 
 
 		 719 aa  749    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 722 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.65 
 
 		 725 aa  756    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.355217  normal  0.132598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3919  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 750 aa  1545    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681981  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2495  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.34 
 
 		 738 aa  746    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  normal  0.73238 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2203  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.31 
 
 		 719 aa  753    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2280  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  52.45 
 
 		 719 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.372267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1622  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 		 723 aa  738    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03558  putative sensor histidine kinase  56.34 
 
 		 722 aa  827    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2451  histidine kinase  51.94 
 
 		 722 aa  758    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0542472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2413  ATPase domain-containing protein  52.45 
 
 		 719 aa  754    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0954524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2006  sensor histidine kinase  51.94 
 
 		 719 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.251569 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1015  sensor histidine kinase  30.79 
 
 		 690 aa  283  1e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3686  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 678 aa  221  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1202  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 519 aa  158  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.868764  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1237  ATPase domain-containing protein  26.76 
 
 		 616 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1399  histidine kinase  26.76 
 
 		 616 aa  122  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.216663  normal  0.406832 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2048  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 501 aa  121  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.542862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0442  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 607 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1178  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.49 
 
 		 616 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.375911  normal  0.307553 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 		 596 aa  114  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.948253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0045  two-component sensor histidine kinase protein  27.37 
 
 		 590 aa  114  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2091  sensor histidine kinase BvrS, putative  25.9 
 
 		 601 aa  114  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 615 aa  114  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2011  putative sensor histidine kinase BvrS  25.9 
 
 		 589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.128135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4295  histidine kinase  28.03 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 605 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0347  Signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 611 aa  111  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0360  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 581 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340361  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2657  sensory histidine kinase CreC  26.72 
 
 		 475 aa  109  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 597 aa  108  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0134346 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0075  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 540 aa  108  4e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1333  sensor histidine kinase BvrS  24.86 
 
 		 607 aa  108  5e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.642449  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2440  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 577 aa  108  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.361958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2846  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 602 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.541285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 599 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.927229  normal  0.192666 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3572  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 		 589 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5434  histidine kinase  24.72 
 
 		 605 aa  106  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.212441  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 		 525 aa  106  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0368  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 563 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0162025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 601 aa  106  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.774704 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1883  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 549 aa  105  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0596  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 566 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0401  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 529 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0202652  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0315  histidine kinase  26.01 
 
 		 572 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0211  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 572 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1682  two-component sensor histidine kinase  26.01 
 
 		 572 aa  102  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3423  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 564 aa  99.8  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0537  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.5 
 
 		 574 aa  98.6  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7368  signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 605 aa  98.6  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.389172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 440 aa  98.6  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 611 aa  97.8  6e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0375883 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 467 aa  97.4  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  25.44 
 
 		 467 aa  97.4  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2564  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 		 550 aa  97.4  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.754787  normal  0.709441 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2740  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 627 aa  97.1  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.273109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 459 aa  97.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.21 
 
 		 1162 aa  96.3  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.43 
 
 		 559 aa  96.3  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.119322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 613 aa  95.5  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  26.64 
 
 		 443 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.03 
 
 		 465 aa  95.1  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  26.98 
 
 		 472 aa  94.7  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2726  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 		 467 aa  93.6  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  25.35 
 
 		 459 aa  94  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  25.82 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 460 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 614 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 		 476 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 488 aa  91.7  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  26.3 
 
 		 443 aa  91.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  24.17 
 
 		 469 aa  91.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  24.44 
 
 		 465 aa  91.7  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 460 aa  91.3  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 		 492 aa  91.3  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1748  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  27.93 
 
 		 466 aa  90.9  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.050043  normal  0.338144 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 614 aa  90.9  7e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.899415  normal  0.0476359 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0754  signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 357 aa  90.5  9e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 359 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 		 546 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4934  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 466 aa  90.1  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.602259  normal  0.31234 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.99 
 
 		 487 aa  90.5  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  25.19 
 
 		 466 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 425 aa  89.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.81 
 
 		 389 aa  89.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06625  sensory histidine kinase CreC  22.74 
 
 		 481 aa  89.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3928  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 507 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.27 
 
 		 1010 aa  89.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3177  sensory histidine kinase CreC  22.69 
 
 		 474 aa  89  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.210044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 		 469 aa  89  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0766  histidine kinase  25.95 
 
 		 476 aa  88.6  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.607957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>