More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2313 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2313  response regulator receiver protein  100 
 
 		 275 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3214  putative transcriptional regulator  45.59 
 
 		 269 aa  244  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  40.86 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3674  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.027909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5309  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383621  normal  0.611504 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1159  two component transcriptional regulator  32.28 
 
 		 230 aa  74.3  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5700  two component transcriptional regulator  34.62 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.663569  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.3 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.63 
 
 		 234 aa  72  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  41.11 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  33.6 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  27.86 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0544  winged helix family two component response transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  32.8 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3871  two component transcriptional regulator, winged helix family  27.42 
 
 		 227 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000473157  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  35.04 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 232 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  33.04 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  40.86 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  30.08 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  42.05 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  34.51 
 
 		 233 aa  67  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2842  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.35 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.77 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0963  two component transcriptional regulator  35.48 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3122  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 235 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  30.83 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.68 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1933  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10381  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.3 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0923  two-component response regulator; MrsR2 protein  32.99 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.227452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0906  response regulator  32.99 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  40.22 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8200  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.64 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  25.85 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17451  two-component response regulator  39.78 
 
 		 269 aa  65.9  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0153  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.711737  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.21 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3169  regulatory protein VanR  33.33 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.16404  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1529  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.96 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1172  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.2 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1487  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 232 aa  65.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.487145  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 246 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0109  two component transcriptional regulator  39.78 
 
 		 253 aa  65.5  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.427788  normal  0.468211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21090  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  25.6 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.664911  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  40.22 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  40.22 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  40.22 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  39.78 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.29 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2969  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.69 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  34.41 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  32.22 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  32.22 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_94  DNA-binding response regulator  28.8 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  32.41 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.67 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  32.22 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0042  response regulator  35.64 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.382747  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  34.02 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  29.91 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  35.64 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  32.63 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  29.84 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0286  two component transcriptional regulator  30 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0255  two component transcriptional regulator  32.8 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000922211  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1238  response regulator receiver  38.14 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0821  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.321247  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.83 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0798  two component transcriptional regulator  34.34 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3164  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.38 
 
 		 238 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  33.33 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1380  DNA binding response regulator  37.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 239 aa  63.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  31.68 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08380  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.78 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0276649  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  34.38 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  32 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>