More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3214 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3214  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  552  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2313  response regulator receiver protein  45.59 
 
 		 275 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  26.49 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.71 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  23.85 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3069  two component transcriptional regulator  23.95 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000467461  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3391  two component transcriptional regulator  25.47 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.141218  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3233  two component transcriptional regulator  25.77 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  24.71 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.64 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7594  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0426147 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.48 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  26.09 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1752  two component transcriptional regulator  37.25 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1382  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  31.53 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00248291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1347  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2514  two component transcriptional regulator, winged helix family  38 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.24701  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4712  two component transcriptional regulator  36.27 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.541483  normal  0.0134498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1365  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1381  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.497022 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  36 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4663  DNA-binding response regulator  25.77 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  37.89 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4365  two component transcriptional regulator  26.15 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4433  DNA-binding response regulator  26.15 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4272  response regulator  26.15 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.760233  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1539  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000287281  normal  0.103291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2549  response regulator receiver  31.87 
 
 		 222 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4777  DNA-binding response regulator  26.15 
 
 		 230 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3872  two component transcriptional regulator  34.69 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0547348  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3637  response regulator receiver  37.5 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.05 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  24.33 
 
 		 232 aa  66.2  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1009  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.14 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0833578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6310  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.96 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.534044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4650  DNA-binding response regulator  25 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4662  DNA-binding response regulator  25.38 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1433  response regulator receiver  37.37 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1467  two component transcriptional regulator  23.66 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0237528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3745  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.5489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1849  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.2 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4687  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.97 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000280381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4283  response regulator  24.62 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  30.07 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13275  two component system sensor transduction transcriptional regulatory protein mtrA  36.27 
 
 		 228 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.656178 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  35.87 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30940  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  38.04 
 
 		 225 aa  65.5  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3846  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.25 
 
 		 222 aa  65.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1765  two component transcriptional regulator  35 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0707  winged helix family two component transcriptional regulator  31.87 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 229 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01831  two-component response regulator  36.17 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0904  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0967  response regulator receiver  37.93 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.359698  normal  0.873584 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4122  two component transcriptional regulator, winged helix family  29.67 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4647  DNA-binding response regulator  25.38 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.92 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0459  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.025631  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0448  DNA-binding response regulator  31.91 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.223302  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0213  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.31 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0395409  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0742  two component transcriptional regulator  37.78 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0194  two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  35.87 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  35.87 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20711  two-component response regulator  36.17 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0287  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.94 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00220806  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  35.87 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1024  two component transcriptional regulator  38.54 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  25.67 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1196  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4285  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.87 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  25.19 
 
 		 238 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1827  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.08 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0590  DNA-binding response regulator  25 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1333  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.40527  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  29.27 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  32.43 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2729  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.77 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981161  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  39.51 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11290  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.41 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2570  response regulator receiver  33 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.16396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  34.74 
 
 		 241 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0715  two component transcriptional regulator, winged helix family  26.04 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  21.77 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1076  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0275  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>