More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1507 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1507  ABC transporter related  100 
 
 
223 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1397  ABC transporter related  73.27 
 
 
225 aa  269  2e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0983365 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0976  ABC transporter related  62.14 
 
 
225 aa  252  4.0000000000000004e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.136497 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0057  ABC transporter related  59.33 
 
 
217 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.268272  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  35.58 
 
 
241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3516  ABC polyamine/opine transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
329 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3329  hypothetical protein  37.26 
 
 
349 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0596951  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3816  ABC transporter related protein  41.71 
 
 
351 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  hitchhiker  0.00416634 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0981  ABC transporter related  38.68 
 
 
353 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0023  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.44 
 
 
447 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.222017  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3000  ABC transporter related  36.55 
 
 
356 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0053  ABC transporter related  34.76 
 
 
309 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.916211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3702  ABC transporter related  37.91 
 
 
357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0526  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
314 aa  110  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0396747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5094  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
408 aa  109  3e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.344366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1247  ABC transporter related  40.09 
 
 
364 aa  109  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.198053  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3161  ABC transporter related  41.76 
 
 
329 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0305522 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1404  ABC transporter related  38.39 
 
 
356 aa  108  5e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0478366  normal  0.517405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.21 
 
 
357 aa  108  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2123  ABC transporter related  39.9 
 
 
542 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4680  ABC transporter related  40 
 
 
358 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.07 
 
 
362 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3863  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 
359 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4352  ABC transporter related  33.64 
 
 
369 aa  106  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000333427 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0973  molybdate ABC transporter ATP-binding protein  36.23 
 
 
365 aa  106  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2486  ABC transporter related  32.64 
 
 
375 aa  106  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.948028 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1532  ABC transporter related protein  34.71 
 
 
404 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.427318  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3588  ABC transporter related  35.48 
 
 
362 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.819948  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  40.91 
 
 
281 aa  106  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2080  ABC sugar transporter, ATPase subunit  37.14 
 
 
378 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  32.74 
 
 
352 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5884  ABC transporter related  35.89 
 
 
393 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2542  putative maltose/maltodextrin import ATP-binding protein malK  35.87 
 
 
366 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.441686 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1447  ABC transporter related  30.7 
 
 
367 aa  105  7e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2873  ABC transporter related  36.82 
 
 
353 aa  105  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.204327 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0546  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein ugpC  33.18 
 
 
338 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  37.44 
 
 
302 aa  104  8e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3264  Sigma 54 interacting domain protein  33.65 
 
 
231 aa  105  8e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000265903  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3229  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
408 aa  104  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2335  ABC transporter  35.83 
 
 
342 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.321614  normal  0.595854 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  35.02 
 
 
365 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5438  ABC transporter related  36.19 
 
 
365 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  0.134942 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2833  ABC transporter related  37.74 
 
 
415 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1716  ABC transporter related  37.56 
 
 
365 aa  104  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2580  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 
372 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  38.83 
 
 
353 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1979  ABC transporter related protein  32.14 
 
 
324 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2524  ABC transporter, ATP-binding protein  37.26 
 
 
342 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.340978  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0387  ABC transporter related  31 
 
 
367 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1803  ABC transporter related  33.88 
 
 
370 aa  103  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191731  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4895  ABC transporter related  35.79 
 
 
393 aa  103  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1152  ABC transporter related  32.86 
 
 
312 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1441  ABC transporter related  35.36 
 
 
359 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0488494  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  37.62 
 
 
359 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0831  ABC transporter related  32.38 
 
 
314 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1199  ABC transporter-like protein  41.75 
 
 
325 aa  103  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.525302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50650  Mo transporter, inner membrane ATP-binding component, ModC1  38.6 
 
 
380 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0400965  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1314  ABC transporter related  35.4 
 
 
373 aa  102  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0580714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.55 
 
 
366 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3243  ABC transporter related  35.85 
 
 
368 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2803  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
362 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0416971  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  34.98 
 
 
361 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1882  ABC transporter-related protein  39.66 
 
 
355 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0280  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  38.04 
 
 
384 aa  102  5e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2912  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  35.02 
 
 
377 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1587  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.6 
 
 
376 aa  102  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.167194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  32.74 
 
 
359 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0179  ABC transporter related  36.71 
 
 
388 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4913  ABC transporter related  34.3 
 
 
383 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.700005  normal  0.675349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  36.14 
 
 
369 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  36.87 
 
 
370 aa  102  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  36.14 
 
 
369 aa  102  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  32.29 
 
 
351 aa  102  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4178  ABC transporter related  35.55 
 
 
332 aa  102  7e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0491577  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  33.06 
 
 
369 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2041  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  37.95 
 
 
356 aa  102  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126101  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0010  ABC transporter related protein  32.91 
 
 
395 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 
378 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0669  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
352 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.324815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  38.25 
 
 
403 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2068  ABC transporter related  36.23 
 
 
364 aa  101  9e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5458  ABC transporter related  40.86 
 
 
416 aa  101  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5050  ABC transporter related  33.06 
 
 
369 aa  101  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.251909  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
353 aa  100  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3142  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.41 
 
 
361 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  36.61 
 
 
345 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6773  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
363 aa  101  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.78331  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2267  ABC transporter related  32.34 
 
 
393 aa  101  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274393  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1485  ABC transporter related  33.8 
 
 
371 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.223537  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1327  ABC transporter related  37.73 
 
 
388 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2559  ABC transporter related  37.44 
 
 
375 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0377  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
375 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.101699  normal  0.0235705 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1525  ABC transporter related  30.26 
 
 
367 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.571493  hitchhiker  0.00153278 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1852  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
395 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3783  ABC transporter related  33.8 
 
 
371 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256147  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1165  ABC transporter related  36.7 
 
 
363 aa  101  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191612  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0860  ABC transporter related  34.47 
 
 
353 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5401  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  35.41 
 
 
366 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.459496  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2604  ABC transporter related  37.44 
 
 
375 aa  100  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2713  ABC transporter related  32.13 
 
 
366 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>