More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0787 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  100 
 
 		 281 aa  541  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  58.17 
 
 		 263 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  57.26 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2339  ABC transporter, ATPase subunit  56.8 
 
 		 263 aa  262  4e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.87 
 
 		 408 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  54.37 
 
 		 264 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  51.76 
 
 		 270 aa  242  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3243  ABC transporter related  53.73 
 
 		 267 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.876591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2105  ABC transporter related  53.23 
 
 		 263 aa  241  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  52.19 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6069  putative glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter ATP-binding protein  54.72 
 
 		 291 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  48.55 
 
 		 376 aa  232  4.0000000000000004e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.82 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 381 aa  230  2e-59  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  53.59 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  53.59 
 
 		 317 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  51.57 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  51.04 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  53.16 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.02 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  50.62 
 
 		 312 aa  229  5e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 321 aa  228  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.84 
 
 		 315 aa  228  8e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  53.16 
 
 		 317 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  51.9 
 
 		 312 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  51.9 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  46.41 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  50.43 
 
 		 324 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 		 395 aa  224  8e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  47.74 
 
 		 314 aa  224  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  47.23 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  47.23 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  47.23 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  47.23 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  47.74 
 
 		 314 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  48.98 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  47.23 
 
 		 315 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2129  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.64 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.530478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  49.33 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.33 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  49.33 
 
 		 308 aa  223  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  49.33 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  51.9 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  49.33 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  49.33 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3334  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.69 
 
 		 376 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0347475  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  51.65 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.17 
 
 		 370 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 375 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1069  ABC transporter related  51.26 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0686791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.08 
 
 		 378 aa  219  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.58 
 
 		 335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.17 
 
 		 392 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1622  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.83 
 
 		 398 aa  219  6e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.96 
 
 		 418 aa  218  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.89 
 
 		 375 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  52.17 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.55 
 
 		 312 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2842  ABC transporter related  51.61 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00414619  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  46.89 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.38 
 
 		 397 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0913  choline ABC transporter ATP binding protein  49.07 
 
 		 305 aa  215  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  46.32 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  46.32 
 
 		 378 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  43.62 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  50.83 
 
 		 310 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  43.92 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.09 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  48.66 
 
 		 321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  49.57 
 
 		 317 aa  212  5.999999999999999e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2530  ABC transporter related  47.92 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  49.55 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  49.55 
 
 		 312 aa  211  1e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  46.27 
 
 		 318 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0119  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 369 aa  209  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  46.98 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  49.59 
 
 		 317 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3565  ABC transporter related  48.67 
 
 		 333 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.998829  normal  0.230396 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0762  ABC transporter related  46.98 
 
 		 325 aa  209  4e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.128148  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  48.89 
 
 		 244 aa  209  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0385  ABC transporter, ATP-binding protein  46.73 
 
 		 324 aa  208  7e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 		 379 aa  208  7e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>