More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2718 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2718  ABC transporter related  100 
 
 		 263 aa  522  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2339  ABC transporter, ATPase subunit  88.08 
 
 		 263 aa  456  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2105  ABC transporter related  72.03 
 
 		 263 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.617159  normal  0.69001 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3336  ABC transporter related  73.54 
 
 		 264 aa  375  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.314642  normal  0.191945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3243  ABC transporter related  71.26 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.211149  normal  0.876591 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2252  ABC transporter related  71.15 
 
 		 257 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.411417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6069  putative glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter ATP-binding protein  70.38 
 
 		 291 aa  359  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5204  ABC transporter related protein  56.73 
 
 		 270 aa  279  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.213509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0787  ABC transporter related  58.17 
 
 		 281 aa  268  8.999999999999999e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1069  ABC transporter related  53.39 
 
 		 259 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0686791  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  54.32 
 
 		 312 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.11 
 
 		 378 aa  249  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0297  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 375 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  54.32 
 
 		 312 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  52.07 
 
 		 317 aa  245  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  49.17 
 
 		 376 aa  245  6.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1033  ABC transporter related protein  52.02 
 
 		 322 aa  244  9.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.117975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  49.58 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1856  ABC transporter related  51.05 
 
 		 310 aa  242  6e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.500244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1175  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.93 
 
 		 375 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  53.75 
 
 		 254 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  47.83 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  56.89 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  56.44 
 
 		 312 aa  239  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  57.33 
 
 		 312 aa  237  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  55.7 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  56.89 
 
 		 312 aa  236  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 		 408 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.96 
 
 		 408 aa  235  5.0000000000000005e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  50.61 
 
 		 312 aa  234  8e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4888  ABC transporter related  54.32 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  hitchhiker  0.00773492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  56.89 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  56.89 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2313  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 315 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.499344  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  47.52 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  49.79 
 
 		 392 aa  233  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2051  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  51.88 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2945  ABC transporter related  52.7 
 
 		 354 aa  233  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00675888  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 		 379 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  54.08 
 
 		 312 aa  232  6e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 389 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15740  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  52.08 
 
 		 335 aa  231  1e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2099  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.88 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158223  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0149  ABC transporter related  48.97 
 
 		 314 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2493  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  50.42 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.167851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0478  ABC transporter related  50.83 
 
 		 333 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201964  hitchhiker  0.00297277 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3109  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 389 aa  230  2e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2538  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0404434  normal  0.847899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2530  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.42 
 
 		 391 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.232541 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3063  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 315 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  48.97 
 
 		 312 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0771  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  46.72 
 
 		 380 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  48.39 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  48.56 
 
 		 314 aa  229  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4291  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  49.59 
 
 		 351 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.603453 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  48.39 
 
 		 252 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 		 382 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4726  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  50.41 
 
 		 364 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.631244  hitchhiker  0.000147167 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2262  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  47.08 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 312 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  47.97 
 
 		 321 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  52.3 
 
 		 312 aa  228  6e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  52.3 
 
 		 312 aa  228  6e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  53.65 
 
 		 312 aa  228  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.53 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 		 312 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  51.46 
 
 		 312 aa  226  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2389  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.301455  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  49.59 
 
 		 317 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2125  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2063  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.832322  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2059  glycine betaine ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2279  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATP-binding protein  45.83 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.987599  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2305  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATP-binding protein  45.83 
 
 		 315 aa  225  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.264442 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  43.67 
 
 		 382 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 		 370 aa  225  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.67 
 
 		 382 aa  225  7e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2668  ABC transporter related  53.12 
 
 		 346 aa  224  7e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.194568  normal  0.0593639 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.67 
 
 		 382 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.67 
 
 		 382 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  45.45 
 
 		 400 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  43.67 
 
 		 382 aa  224  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  46.28 
 
 		 388 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.14 
 
 		 381 aa  223  2e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  46.28 
 
 		 391 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30040  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  48.97 
 
 		 282 aa  223  2e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0452  ABC transporter related  48.78 
 
 		 344 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.54 
 
 		 369 aa  223  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  45.34 
 
 		 418 aa  223  3e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  48.35 
 
 		 335 aa  223  3e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.98 
 
 		 385 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 		 385 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1635  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  47.5 
 
 		 397 aa  221  9e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.839045 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  46.69 
 
 		 398 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.478782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>