More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0995 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_0312  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  74.4 
 
 
457 aa  726    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0995  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  100 
 
 
458 aa  929    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.355194  normal  0.0718594 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1902  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  76.59 
 
 
457 aa  704    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1973  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  48.31 
 
 
475 aa  398  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.684212 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0168  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  43.16 
 
 
481 aa  335  7.999999999999999e-91  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.59064  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1233  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  37.18 
 
 
454 aa  301  2e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2121  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  35.87 
 
 
458 aa  249  5e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000289432  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0403  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  40.88 
 
 
459 aa  240  2.9999999999999997e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1055  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.36 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.66 
 
 
488 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0660  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.92 
 
 
464 aa  179  9e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0557  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.64 
 
 
474 aa  179  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3719  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.65 
 
 
478 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3490  twin-arginine translocation pathway signal  29.12 
 
 
542 aa  173  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2715  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.82 
 
 
529 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.215491 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.45 
 
 
477 aa  170  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4123  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 
479 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4163  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.33 
 
 
479 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.445951 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0797  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.38 
 
 
458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6029  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.85 
 
 
479 aa  166  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0722  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.29 
 
 
456 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00721708  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0289  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.55 
 
 
523 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4913  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.9 
 
 
504 aa  164  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2300  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.86 
 
 
503 aa  164  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1149  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.75 
 
 
505 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.204851 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2097  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.2 
 
 
528 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.104758  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1186  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.51 
 
 
458 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1368  hypothetical protein  30.83 
 
 
513 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2276  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  31.01 
 
 
503 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000218156  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5939  twin-arginine translocation pathway signal  28.93 
 
 
499 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161214  decreased coverage  0.000467819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0472  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
459 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.347411  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1032  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.14 
 
 
483 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.608632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0009  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.35 
 
 
462 aa  155  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0089  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  26.9 
 
 
458 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1335  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.15 
 
 
552 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0391206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3958  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.42 
 
 
489 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.202688 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1359  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  33.33 
 
 
469 aa  153  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000049629  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0732  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.23 
 
 
458 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.285912 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4997  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.84 
 
 
483 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0596  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  31.93 
 
 
437 aa  151  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.766267  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1942  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.2 
 
 
498 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.502134  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0552  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.48 
 
 
454 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1459  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1332  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.2 
 
 
546 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.357045  normal  0.0644884 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3128  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1375  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3243  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.270124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2066  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3342  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.78 
 
 
491 aa  150  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0216935  normal  0.716068 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4319  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  30.1 
 
 
522 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2360  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1095  TldD/PmbA family protein  34.59 
 
 
477 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4998  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.18 
 
 
480 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3804  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.94 
 
 
504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.495254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4761  microcin-processing peptidase 2  27.72 
 
 
475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.58875  normal  0.0125504 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2698  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  34.73 
 
 
476 aa  147  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.504739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2703  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.66 
 
 
514 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0658462  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1719  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.37 
 
 
443 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0091  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.4 
 
 
543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196627  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4147  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  30.42 
 
 
478 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.511407  normal  0.0118957 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2099  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.24 
 
 
547 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2732  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.21 
 
 
504 aa  146  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1542  microcin-processing peptidase 2  27.72 
 
 
467 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0708612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3705  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.18 
 
 
478 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4767  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  35.06 
 
 
480 aa  145  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4949  TldD/PmbA family protein  30.61 
 
 
512 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.906043  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0666  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.13 
 
 
477 aa  143  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.231569  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0542  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.25 
 
 
475 aa  144  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0516  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  29.71 
 
 
480 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.134826  normal  0.446372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3701  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.99 
 
 
460 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0977  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.81 
 
 
444 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00101033  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3369  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  27.6 
 
 
490 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.355295  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0881  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.64 
 
 
443 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0409  TldD/PmbA family protein  34.81 
 
 
480 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0100  microcin-processing peptidase 2  30.34 
 
 
477 aa  140  3e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.884188  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3765  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.38 
 
 
478 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0599  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  28.83 
 
 
471 aa  141  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.722035  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0043  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  28.1 
 
 
463 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0090  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.94 
 
 
544 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.42092  normal  0.0324493 
 
 
-
 
NC_004310  BR0465  tldD protein, putative  26.96 
 
 
470 aa  140  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.902755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1013  TldD protein  26.02 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0510  microcin-processing peptidase 2 (TldD)  32.45 
 
 
477 aa  139  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00345987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1643  TldD protein  32.45 
 
 
477 aa  139  8.999999999999999e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000416782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0775  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.27 
 
 
462 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.861031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4822  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.73 
 
 
480 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.466892  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3440  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
505 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0749759 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0579  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.44 
 
 
470 aa  139  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0201  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  24.74 
 
 
462 aa  139  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199087  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1327  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  25.45 
 
 
495 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1519  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.12 
 
 
460 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000701587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3429  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
505 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3492  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  29.69 
 
 
505 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.24297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0640  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.36 
 
 
471 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.481365 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0203  peptidase U62, modulator of DNA gyrase  24.52 
 
 
462 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00203968  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2043  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.06 
 
 
486 aa  139  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0505  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.67 
 
 
471 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.279079  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0063  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  27.91 
 
 
484 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0152  tldD protein  26.06 
 
 
467 aa  138  2e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2721  peptidase U62 modulator of DNA gyrase  26.16 
 
 
460 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31850  hypothetical protein  36.54 
 
 
477 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>