More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2139 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  71.08 
 
 		 738 aa  1120    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  68.92 
 
 		 741 aa  1101    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  74.06 
 
 		 747 aa  1188    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 739 aa  1545    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  72.8 
 
 		 739 aa  1145    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  69.86 
 
 		 720 aa  1069    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  42.65 
 
 		 744 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  42.9 
 
 		 731 aa  588  1e-166  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  42.26 
 
 		 730 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  40.51 
 
 		 731 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  40.29 
 
 		 738 aa  514  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  40.43 
 
 		 737 aa  506  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  38.84 
 
 		 739 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  36.22 
 
 		 759 aa  420  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  33.85 
 
 		 750 aa  380  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  32.59 
 
 		 731 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.93 
 
 		 722 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 		 695 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  32.88 
 
 		 733 aa  333  6e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 757 aa  331  3e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  32.64 
 
 		 760 aa  315  2.9999999999999996e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  32.33 
 
 		 760 aa  310  5e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  30.6 
 
 		 761 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 764 aa  308  3e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  31.9 
 
 		 760 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  32.42 
 
 		 764 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  31.85 
 
 		 764 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  32.16 
 
 		 760 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 		 764 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 764 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.72 
 
 		 731 aa  303  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 		 760 aa  301  4e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  29.51 
 
 		 729 aa  291  3e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  31.19 
 
 		 760 aa  290  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.61 
 
 		 734 aa  289  1e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  29.36 
 
 		 764 aa  287  5.999999999999999e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  30.78 
 
 		 758 aa  283  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  29.4 
 
 		 754 aa  280  7e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 		 807 aa  280  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  30.92 
 
 		 756 aa  278  2e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 		 695 aa  277  5e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 731 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 		 698 aa  275  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  31.08 
 
 		 695 aa  267  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.65 
 
 		 732 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  29.99 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  29.99 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 		 698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  29.35 
 
 		 758 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  30.13 
 
 		 758 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  29.84 
 
 		 758 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  29.34 
 
 		 700 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  28.39 
 
 		 704 aa  246  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  30.25 
 
 		 729 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  28.9 
 
 		 708 aa  238  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  28.38 
 
 		 685 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  28.13 
 
 		 711 aa  235  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.93 
 
 		 905 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.36 
 
 		 708 aa  222  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  28.71 
 
 		 691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  27.31 
 
 		 700 aa  221  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 		 691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  28.71 
 
 		 691 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  29.02 
 
 		 899 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  29.23 
 
 		 726 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 891 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.76 
 
 		 692 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.04 
 
 		 747 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  27.74 
 
 		 690 aa  215  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.39 
 
 		 793 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.23 
 
 		 688 aa  213  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 		 708 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 747 aa  213  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.56 
 
 		 792 aa  212  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.73 
 
 		 814 aa  211  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.15 
 
 		 900 aa  212  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.33 
 
 		 792 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.33 
 
 		 792 aa  211  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  28.63 
 
 		 776 aa  211  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.79 
 
 		 893 aa  211  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.47 
 
 		 792 aa  210  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.81 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.26 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.51 
 
 		 799 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.69 
 
 		 691 aa  209  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.81 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.21 
 
 		 1135 aa  209  1e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 		 718 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  27.26 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  25.58 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.58 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 703 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.81 
 
 		 814 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 701 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  25.58 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.58 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.58 
 
 		 814 aa  208  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 		 718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 		 718 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.58 
 
 		 814 aa  208  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>