More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1149 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  100 
 
 		 292 aa  610  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1370  lipoyl synthase  69.47 
 
 		 288 aa  419  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.472643 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  61.4 
 
 		 294 aa  361  1e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1277  lipoyl synthase  61.59 
 
 		 287 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.112928  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  57.93 
 
 		 300 aa  353  2e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1084  lipoyl synthase  61.71 
 
 		 291 aa  347  1e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1213  lipoyl synthase  59.36 
 
 		 292 aa  333  2e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 292 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2076  lipoyl synthase  53.55 
 
 		 299 aa  296  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.39872  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 282 aa  294  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  52.11 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  52.11 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0399  lipoyl synthase  52.67 
 
 		 283 aa  291  7e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0123517  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2714  lipoyl synthase  51.06 
 
 		 291 aa  291  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.171225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  52.31 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  51.76 
 
 		 304 aa  288  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0315  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 314 aa  289  5.0000000000000004e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  47.67 
 
 		 292 aa  288  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2079  lipoyl synthase  52.61 
 
 		 298 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.069299 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 299 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.08 
 
 		 283 aa  285  9e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  49.28 
 
 		 302 aa  285  9e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 290 aa  284  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3150  lipoyl synthase  51.43 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1401  lipoyl synthase  51.96 
 
 		 300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 297 aa  282  5.000000000000001e-75  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  52.33 
 
 		 298 aa  282  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  53.36 
 
 		 296 aa  281  1e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  47.7 
 
 		 290 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  48.74 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  47.86 
 
 		 304 aa  279  4e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  48.72 
 
 		 299 aa  279  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2662  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 281 aa  279  5e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3715  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00165797  hitchhiker  0.00474747 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2942  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  278  7e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000018983  hitchhiker  0.00758797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1252  lipoyl synthase  50 
 
 		 328 aa  278  8e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004228  lipoate synthase  49.29 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000803554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  277  1e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3282  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0177206  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3460  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.633504  normal  0.0256244 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  49.29 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  48.59 
 
 		 322 aa  276  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  49.29 
 
 		 303 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1085  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00323584  hitchhiker  0.0000378022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0979  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.464322  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  50.89 
 
 		 298 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.36 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0400  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 291 aa  275  5e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0867  lipoyl synthase  51.26 
 
 		 321 aa  275  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.719819  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01211  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3324  lipoyl synthase  50.9 
 
 		 321 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0295877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 321 aa  275  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 320 aa  275  8e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 290 aa  275  8e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  49.29 
 
 		 321 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0399  lipoyl synthase  49.65 
 
 		 291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.661131 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  50.53 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  48.62 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  48.75 
 
 		 318 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  46.98 
 
 		 322 aa  273  3e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  273  3e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  48.44 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  48.44 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0692  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  272  4.0000000000000004e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  48.44 
 
 		 298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  52 
 
 		 301 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2876  lipoyl synthase  50.54 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1439  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.115253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  48.11 
 
 		 334 aa  272  6e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  271  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0467  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 321 aa  271  7e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00091244  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  48.58 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1414  lipoyl synthase  48.55 
 
 		 315 aa  271  9e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00276409  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01649  lipoyl synthase  48.94 
 
 		 320 aa  271  9e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00769873  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 321 aa  271  9e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>